More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3009 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2802  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.62 
 
 
585 aa  867    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34708  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2242  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  70.55 
 
 
592 aa  837    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316433  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1328  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.5 
 
 
587 aa  639    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0958781 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2270  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  58.27 
 
 
576 aa  677    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2077  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.83 
 
 
585 aa  645    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1804  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  71.92 
 
 
607 aa  894    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516088  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0892  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.38 
 
 
581 aa  668    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.806334  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1113  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.97 
 
 
587 aa  635    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1389  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  72.95 
 
 
584 aa  900    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0317493  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1905  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.31 
 
 
585 aa  643    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239635  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0239  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  76.23 
 
 
592 aa  927    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2464  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  74.01 
 
 
585 aa  924    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0927747  normal  0.484681 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3351  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  73.2 
 
 
601 aa  901    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6087  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  71.06 
 
 
589 aa  857    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  64.46 
 
 
593 aa  802    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1848  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.97 
 
 
587 aa  635    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1782  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  58.27 
 
 
572 aa  689    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.331882  normal  0.0862821 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2105  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.16 
 
 
591 aa  645    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0947  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.31 
 
 
587 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1488  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  74.06 
 
 
601 aa  927    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2343  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.68 
 
 
592 aa  860    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4864  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  74.32 
 
 
591 aa  926    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1419  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.14 
 
 
587 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2520  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  56.57 
 
 
582 aa  669    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2280  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  61.47 
 
 
573 aa  706    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.659832  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2637  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  67.01 
 
 
588 aa  819    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1902  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.59 
 
 
566 aa  645    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000354639  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1779  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  66.72 
 
 
585 aa  826    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0502039  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1173  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  67.52 
 
 
584 aa  828    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320111  normal  0.560102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1961  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  60.37 
 
 
568 aa  692    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5404  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  75.34 
 
 
591 aa  931    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589591  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0634  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.32 
 
 
567 aa  645    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.876407  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1346  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  72.77 
 
 
584 aa  898    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0313448  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2532  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.68 
 
 
596 aa  873    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.630898  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1953  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.62 
 
 
598 aa  650    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2008  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  71.72 
 
 
592 aa  891    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1779  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  63.71 
 
 
608 aa  769    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0474  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.29 
 
 
585 aa  675    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0467  acetolactate synthase, large subunit  68.1 
 
 
586 aa  856    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5349  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  74.32 
 
 
591 aa  925    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1045  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.97 
 
 
587 aa  635    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.160852  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1281  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.14 
 
 
587 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3345  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.49 
 
 
592 aa  825    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615353  normal  0.0219835 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2261  acetolactate synthase, large subunit  62.22 
 
 
582 aa  736    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1897  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  66.95 
 
 
588 aa  827    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.195023  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3255  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  68.64 
 
 
593 aa  811    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2119  acetolactate synthase, large subunit  52.82 
 
 
568 aa  647    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.712969  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2317  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.82 
 
 
594 aa  643    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.251422  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2420  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  80.72 
 
 
586 aa  1015    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438184  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2098  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.49 
 
 
592 aa  830    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477274  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2158  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.91 
 
 
564 aa  687    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2722  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.17 
 
 
592 aa  830    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.817808  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0875  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.23 
 
 
583 aa  847    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.840064  normal  0.16884 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1470  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  63.87 
 
 
581 aa  766    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0753  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.97 
 
 
587 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2893  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.36 
 
 
592 aa  652    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020584 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1488  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  73.46 
 
 
600 aa  908    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1274  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.14 
 
 
587 aa  638    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2791  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.51 
 
 
596 aa  870    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111041  normal  0.823193 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5323  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  75.17 
 
 
591 aa  939    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.196754  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3112  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.17 
 
 
601 aa  647    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0197191  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2773  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.47 
 
 
570 aa  650    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4867  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.47 
 
 
593 aa  641    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1745  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.87 
 
 
593 aa  649    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0898  acetolactate synthase, large subunit  56.67 
 
 
564 aa  656    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3009  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  100 
 
 
585 aa  1214    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161058 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0396  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.97 
 
 
587 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2228  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.48 
 
 
585 aa  645    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0609  acetolactate synthase, large subunit  63.1 
 
 
584 aa  770    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0318526  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2169  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  67.36 
 
 
575 aa  822    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649258  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1294  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  66.84 
 
 
588 aa  817    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0745  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.38 
 
 
581 aa  668    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.425404  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1769  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.62 
 
 
598 aa  649    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.712951  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5448  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  76.7 
 
 
592 aa  946    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404549  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1991  acetolactate synthase, large subunit  55.89 
 
 
613 aa  632  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3322  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.93 
 
 
607 aa  632  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0911  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.95 
 
 
587 aa  633  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.52 
 
 
592 aa  625  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0366089  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2022  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.85 
 
 
585 aa  625  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.721399 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3231  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.67 
 
 
587 aa  624  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1063  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.24 
 
 
595 aa  624  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.722606  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1013  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.14 
 
 
587 aa  624  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458682  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2558  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.37 
 
 
566 aa  621  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0505809  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.33 
 
 
575 aa  620  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.33 
 
 
575 aa  620  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2288  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.97 
 
 
587 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5592  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.62 
 
 
587 aa  619  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2181  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.79 
 
 
587 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384106  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1654  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.97 
 
 
587 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.527675  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2048  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.08 
 
 
596 aa  621  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2368  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.82 
 
 
594 aa  621  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2303  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.79 
 
 
587 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2265  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.97 
 
 
587 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587428  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2932  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.33 
 
 
593 aa  620  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3075  acetolactate synthase, large subunit  51.93 
 
 
566 aa  616  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.843153  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0810  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.9 
 
 
595 aa  616  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.845021  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.26 
 
 
572 aa  617  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.79 
 
 
566 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.62 
 
 
566 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0882  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.24 
 
 
572 aa  613  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>