More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0609 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0609  acetolactate synthase, large subunit  100 
 
 
584 aa  1195    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0318526  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2270  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.38 
 
 
576 aa  636    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5349  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  65.96 
 
 
591 aa  787    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5323  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  66.19 
 
 
591 aa  798    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.196754  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1389  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  62.97 
 
 
584 aa  768    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0317493  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5448  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  65.08 
 
 
592 aa  794    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404549  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3009  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  63.1 
 
 
585 aa  770    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161058 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2464  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  67.75 
 
 
585 aa  823    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0927747  normal  0.484681 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2280  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.47 
 
 
573 aa  639    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.659832  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0892  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.71 
 
 
581 aa  636    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.806334  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2343  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  61.26 
 
 
592 aa  738    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1346  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  62.8 
 
 
584 aa  766    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0313448  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2637  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  62.46 
 
 
588 aa  758    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4864  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  65.96 
 
 
591 aa  789    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2420  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  66.67 
 
 
586 aa  788    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438184  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1782  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.66 
 
 
572 aa  636    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.331882  normal  0.0862821 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2802  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  62.12 
 
 
585 aa  753    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34708  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0467  acetolactate synthase, large subunit  64 
 
 
586 aa  753    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3351  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  65.68 
 
 
601 aa  774    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6087  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  63.67 
 
 
589 aa  741    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3345  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  62.94 
 
 
592 aa  735    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615353  normal  0.0219835 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2261  acetolactate synthase, large subunit  72.43 
 
 
582 aa  858    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1173  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  62.8 
 
 
584 aa  761    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320111  normal  0.560102 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1897  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  61.6 
 
 
588 aa  748    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.195023  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2158  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.91 
 
 
564 aa  649    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3255  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  61.09 
 
 
593 aa  713    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1294  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  62.29 
 
 
588 aa  757    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2098  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  62.72 
 
 
592 aa  733    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477274  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2722  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  61.62 
 
 
592 aa  716    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.817808  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0875  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  65.31 
 
 
583 aa  783    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.840064  normal  0.16884 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1470  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  72.56 
 
 
581 aa  882    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1804  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  62.52 
 
 
607 aa  771    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516088  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1488  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  65.02 
 
 
600 aa  795    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1779  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  63.76 
 
 
585 aa  757    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0502039  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2532  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  63.71 
 
 
596 aa  772    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.630898  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2791  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  63.71 
 
 
596 aa  766    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111041  normal  0.823193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0239  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  66.61 
 
 
592 aa  773    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5404  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  65.96 
 
 
591 aa  790    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589591  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2242  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  63.12 
 
 
592 aa  734    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316433  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0898  acetolactate synthase, large subunit  54.77 
 
 
564 aa  637    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1488  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  66.21 
 
 
601 aa  789    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1779  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  62.96 
 
 
608 aa  702    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2169  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  61.7 
 
 
575 aa  728    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649258  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2008  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  63.44 
 
 
592 aa  770    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0745  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.71 
 
 
581 aa  636    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.425404  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  62.5 
 
 
593 aa  747    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1961  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.19 
 
 
568 aa  629  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1902  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.32 
 
 
566 aa  622  1e-177  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000354639  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2520  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  54.67 
 
 
582 aa  615  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2893  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.09 
 
 
592 aa  617  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020584 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0634  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.04 
 
 
567 aa  613  9.999999999999999e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.876407  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2773  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.01 
 
 
570 aa  608  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2077  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.53 
 
 
585 aa  608  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0474  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.89 
 
 
585 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2558  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.5 
 
 
566 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0505809  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1063  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.75 
 
 
595 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.722606  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2048  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.06 
 
 
596 aa  602  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0911  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.28 
 
 
587 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1905  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.74 
 
 
585 aa  605  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239635  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.83 
 
 
564 aa  601  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0947  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.4 
 
 
587 aa  598  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3112  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.26 
 
 
601 aa  598  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0197191  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2228  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.66 
 
 
585 aa  601  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0882  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.4 
 
 
572 aa  601  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240618  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.97 
 
 
563 aa  597  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3075  acetolactate synthase, large subunit  53.08 
 
 
566 aa  596  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.843153  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.23 
 
 
566 aa  595  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1113  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.75 
 
 
587 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1281  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.75 
 
 
587 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1848  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.75 
 
 
587 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.7 
 
 
566 aa  593  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0753  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.75 
 
 
587 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1419  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.75 
 
 
587 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.71 
 
 
565 aa  592  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1274  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.75 
 
 
587 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1045  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.11 
 
 
587 aa  594  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.160852  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2317  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.26 
 
 
594 aa  592  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.251422  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1953  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.26 
 
 
598 aa  593  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1769  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.26 
 
 
598 aa  593  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.712951  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0396  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.75 
 
 
587 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1745  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.26 
 
 
593 aa  592  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4867  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.09 
 
 
593 aa  588  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2105  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.83 
 
 
591 aa  590  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3322  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.35 
 
 
607 aa  589  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2119  acetolactate synthase, large subunit  51.66 
 
 
568 aa  589  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.712969  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1328  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.92 
 
 
587 aa  590  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0958781 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.06 
 
 
562 aa  585  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0810  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.18 
 
 
595 aa  586  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.845021  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.05 
 
 
566 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  51.4 
 
 
566 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2982  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.42 
 
 
572 aa  582  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000024883  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3024  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.42 
 
 
572 aa  582  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000501065  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.52 
 
 
563 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.97 
 
 
562 aa  581  1e-164  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.79 
 
 
566 aa  579  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2022  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.44 
 
 
585 aa  579  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.721399 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.86 
 
 
570 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1991  acetolactate synthase, large subunit  54.39 
 
 
613 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3231  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.26 
 
 
587 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.01 
 
 
573 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>