More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2077 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00079  acetolactate synthase III large subunit  56.69 
 
 		 574 aa  678    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3522  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.69 
 
 		 574 aa  675    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2008  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.74 
 
 		 592 aa  639    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.56 
 
 		 566 aa  652    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4680  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  60.6 
 
 		 574 aa  721    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0107751 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2270  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  68.85 
 
 		 576 aa  832    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2077  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  100 
 
 		 585 aa  1219    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.59 
 
 		 575 aa  671    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1063  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  77.31 
 
 		 595 aa  975    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.722606  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3236  acetolactate synthase III, large subunit, biosynthetic type  57.02 
 
 		 575 aa  666    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00702842  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0882  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.04 
 
 		 572 aa  729    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240618  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1389  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.75 
 
 		 584 aa  658    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0317493  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2279  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.41 
 
 		 572 aa  701    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  61.91 
 
 		 574 aa  732    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1113  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  79.22 
 
 		 587 aa  995    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1776  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.19 
 
 		 573 aa  700    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  75.78 
 
 		 592 aa  896    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0366089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5410  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  61.66 
 
 		 574 aa  744    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350466  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3112  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  75.6 
 
 		 601 aa  932    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0197191  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1319  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  59.22 
 
 		 570 aa  698    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1848  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  79.22 
 
 		 587 aa  995    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0846  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  60.6 
 
 		 574 aa  731    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0527  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  60.14 
 
 		 608 aa  709    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3075  acetolactate synthase, large subunit  68.25 
 
 		 566 aa  824    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.843153  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0624  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.39 
 
 		 574 aa  674    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.146468 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0947  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  90.63 
 
 		 587 aa  1129    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1804  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.7 
 
 		 607 aa  665    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516088  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1991  acetolactate synthase, large subunit  71.83 
 
 		 613 aa  832    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2343  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.86 
 
 		 592 aa  642    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0396  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  79.22 
 
 		 587 aa  995    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1419  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  79.39 
 
 		 587 aa  998    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2520  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  67.25 
 
 		 582 aa  795    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4788  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  61.73 
 
 		 574 aa  730    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.092848  hitchhiker  0.00966018 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4864  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.75 
 
 		 591 aa  643    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5323  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.51 
 
 		 591 aa  636    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.196754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5592  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  80.07 
 
 		 587 aa  981    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2464  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.78 
 
 		 585 aa  647    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0927747  normal  0.484681 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.59 
 
 		 575 aa  671    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  55.03 
 
 		 566 aa  643    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.83 
 
 		 573 aa  714    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302703  decreased coverage  0.000148215 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0634  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  66.25 
 
 		 567 aa  786    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.876407  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1769  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  74.41 
 
 		 598 aa  928    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.712951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  60.25 
 
 		 574 aa  717    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145283  hitchhiker  0.0000405432 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.85 
 
 		 574 aa  700    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.26 
 
 		 566 aa  663    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0474  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  71.63 
 
 		 585 aa  860    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0467  acetolactate synthase, large subunit  55.2 
 
 		 586 aa  641    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1006  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  62.45 
 
 		 574 aa  733    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.850126  hitchhiker  0.0000000000038167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2105  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  76.48 
 
 		 591 aa  935    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1045  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  79.22 
 
 		 587 aa  995    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.160852  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.95 
 
 		 573 aa  697    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.54 
 
 		 572 aa  713    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0609  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.74 
 
 		 599 aa  709    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.73 
 
 		 573 aa  704    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.13 
 
 		 572 aa  684    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3322  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  75.13 
 
 		 607 aa  917    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  62.59 
 
 		 588 aa  746    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000348617  hitchhiker  0.0000942961 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3351  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.99 
 
 		 601 aa  660    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2119  acetolactate synthase, large subunit  69.01 
 
 		 568 aa  839    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.712969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2317  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  76.36 
 
 		 594 aa  924    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.251422  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3231  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  79.39 
 
 		 587 aa  973    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.3 
 
 		 572 aa  708    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0079  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.69 
 
 		 574 aa  677    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0754  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  60.25 
 
 		 574 aa  716    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260145 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0501  acetolactate synthase, large subunit  57.44 
 
 		 585 aa  682    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.143294  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4678  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  60.25 
 
 		 574 aa  717    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000775214 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0522  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  60.42 
 
 		 570 aa  704    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.96739  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0911  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  90.29 
 
 		 587 aa  1125    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3580  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.69 
 
 		 574 aa  675    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.69 
 
 		 574 aa  678    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.630637  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1654  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  79.9 
 
 		 587 aa  980    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.527675  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1274  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  79.39 
 
 		 587 aa  998    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0624  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  58.48 
 
 		 572 aa  680    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1488  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.24 
 
 		 600 aa  658    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2932  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.57 
 
 		 593 aa  672    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.23 
 
 		 572 aa  702    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1830  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.23 
 
 		 572 aa  702    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1628  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.23 
 
 		 572 aa  706    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.36 
 
 		 572 aa  711    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2303  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  79.73 
 
 		 587 aa  977    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62160  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  62.01 
 
 		 574 aa  747    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.09482 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0753  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  79.22 
 
 		 587 aa  995    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2265  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  79.9 
 
 		 587 aa  980    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587428  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1488  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  58.38 
 
 		 601 aa  684    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1346  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.58 
 
 		 584 aa  656    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0313448  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2982  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.4 
 
 		 572 aa  635    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000024883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4867  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  74.78 
 
 		 593 aa  899    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3024  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.4 
 
 		 572 aa  635    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000501065  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0898  acetolactate synthase, large subunit  59.22 
 
 		 564 aa  701    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2269  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.23 
 
 		 572 aa  701    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1955  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.24 
 
 		 618 aa  695    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.51 
 
 		 604 aa  676    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2558  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.44 
 
 		 566 aa  655    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0505809  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.54 
 
 		 572 aa  713    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1013  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  80.24 
 
 		 587 aa  985    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1745  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  76.01 
 
 		 593 aa  916    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2018  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.95 
 
 		 573 aa  697    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.801766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1281  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  79.39 
 
 		 587 aa  998    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.42 
 
 		 574 aa  700    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.19 
 
 		 572 aa  711    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>