More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2008 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5404  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  69.68 
 
 		 591 aa  868    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2893  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.68 
 
 		 592 aa  645    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020584 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2270  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.69 
 
 		 576 aa  694    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2077  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.74 
 
 		 585 aa  639    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1782  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.47 
 
 		 572 aa  674    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.331882  normal  0.0862821 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1346  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  83.25 
 
 		 584 aa  1037    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0313448  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1389  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  83.42 
 
 		 584 aa  1038    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0317493  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1961  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  64.61 
 
 		 568 aa  759    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2242  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  78.66 
 
 		 592 aa  930    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316433  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2181  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.34 
 
 		 587 aa  637    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2464  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  71.33 
 
 		 585 aa  884    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0927747  normal  0.484681 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1173  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  68.55 
 
 		 584 aa  842    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320111  normal  0.560102 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2228  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.74 
 
 		 585 aa  639    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1804  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  82.42 
 
 		 607 aa  1033    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516088  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1848  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.03 
 
 		 587 aa  652    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4864  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  69.85 
 
 		 591 aa  868    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1294  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.06 
 
 		 588 aa  845    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1113  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.03 
 
 		 587 aa  652    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0947  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.21 
 
 		 587 aa  643    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2343  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  74.83 
 
 		 592 aa  936    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2008  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  100 
 
 		 592 aa  1233    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1419  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.03 
 
 		 587 aa  651    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2520  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  56.67 
 
 		 582 aa  676    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0239  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  69.43 
 
 		 592 aa  853    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2637  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  68.72 
 
 		 588 aa  843    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5349  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  69.68 
 
 		 591 aa  865    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5592  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.17 
 
 		 587 aa  636    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6087  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  77.51 
 
 		 589 aa  945    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5323  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  68.48 
 
 		 591 aa  858    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.196754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1953  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.15 
 
 		 598 aa  635    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1779  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  67.35 
 
 		 585 aa  830    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0502039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2105  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.46 
 
 		 591 aa  642    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2802  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  83.93 
 
 		 585 aa  1052    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.34708  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0474  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.89 
 
 		 585 aa  666    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0467  acetolactate synthase, large subunit  64.97 
 
 		 586 aa  807    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1045  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.38 
 
 		 587 aa  653    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.160852  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0892  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.3 
 
 		 581 aa  664    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.806334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1745  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.04 
 
 		 593 aa  635    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3345  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  77.78 
 
 		 592 aa  922    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615353  normal  0.0219835 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2261  acetolactate synthase, large subunit  61.9 
 
 		 582 aa  733    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  63.88 
 
 		 593 aa  775    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1897  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  67.24 
 
 		 588 aa  825    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.195023  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3322  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.32 
 
 		 607 aa  654    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3255  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  77.35 
 
 		 593 aa  913    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2317  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.9 
 
 		 594 aa  647    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.251422  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3231  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.07 
 
 		 587 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1902  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.63 
 
 		 566 aa  664    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000354639  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2098  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  77.95 
 
 		 592 aa  925    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1488  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  71.84 
 
 		 601 aa  897    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2722  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  75.43 
 
 		 592 aa  913    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.817808  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1013  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.86 
 
 		 587 aa  642    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0911  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.61 
 
 		 587 aa  650    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0875  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.56 
 
 		 583 aa  839    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.840064  normal  0.16884 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1470  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  62.09 
 
 		 581 aa  740    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.560122 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1281  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.03 
 
 		 587 aa  651    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1488  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  81.8 
 
 		 600 aa  1029    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0609  acetolactate synthase, large subunit  63.44 
 
 		 584 aa  770    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0318526  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1779  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  61.59 
 
 		 608 aa  731    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0745  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.3 
 
 		 581 aa  664    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.425404  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2158  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.36 
 
 		 564 aa  675    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2303  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.51 
 
 		 587 aa  638    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2420  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  70.19 
 
 		 586 aa  868    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2791  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  85.01 
 
 		 596 aa  1066    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111041  normal  0.823193 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1905  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.74 
 
 		 585 aa  640    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0898  acetolactate synthase, large subunit  56.11 
 
 		 564 aa  671    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2280  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  70.13 
 
 		 573 aa  825    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.659832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1274  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.03 
 
 		 587 aa  651    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3009  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  71.72 
 
 		 585 aa  891    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161058 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2169  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  66.2 
 
 		 575 aa  805    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0753  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.03 
 
 		 587 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3351  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  67.86 
 
 		 601 aa  858    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5448  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  69.26 
 
 		 592 aa  867    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404549  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2022  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.42 
 
 		 585 aa  644    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.721399 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0396  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.03 
 
 		 587 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2532  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  85.18 
 
 		 596 aa  1068    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.630898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1328  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.9 
 
 		 587 aa  653    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0958781 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2288  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.17 
 
 		 587 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1769  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.15 
 
 		 598 aa  633  1e-180  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.712951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1654  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.17 
 
 		 587 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.527675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2265  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.17 
 
 		 587 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587428  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2773  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.33 
 
 		 570 aa  634  1e-180  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3112  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.3 
 
 		 601 aa  631  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0197191  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0634  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.08 
 
 		 567 aa  629  1e-179  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.876407  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1063  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.51 
 
 		 595 aa  629  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.722606  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2119  acetolactate synthase, large subunit  52.28 
 
 		 568 aa  626  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.712969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2037  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.8 
 
 		 564 aa  628  1e-178  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182642  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.74 
 
 		 592 aa  627  1e-178  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0366089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0810  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.16 
 
 		 595 aa  622  1e-177  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.845021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4867  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.55 
 
 		 593 aa  623  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2048  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.56 
 
 		 596 aa  622  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2368  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.12 
 
 		 594 aa  624  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.68 
 
 		 566 aa  618  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3075  acetolactate synthase, large subunit  53.16 
 
 		 566 aa  621  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.843153  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.81 
 
 		 562 aa  620  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.32 
 
 		 566 aa  615  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2558  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.73 
 
 		 566 aa  616  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0505809  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  51.15 
 
 		 566 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1991  acetolactate synthase, large subunit  54.02 
 
 		 613 aa  609  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.47 
 
 		 563 aa  609  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.32 
 
 		 564 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>