More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2270 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00079  acetolactate synthase III large subunit  59.54 
 
 
574 aa  735    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3522  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  59.54 
 
 
574 aa  732    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1294  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.41 
 
 
588 aa  667    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.2 
 
 
566 aa  654    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4680  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  63.96 
 
 
574 aa  766    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0107751 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2270  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  100 
 
 
576 aa  1189    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2077  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  68.85 
 
 
585 aa  832    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0396  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.2 
 
 
587 aa  837    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1173  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.64 
 
 
584 aa  680    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320111  normal  0.560102 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3236  acetolactate synthase III, large subunit, biosynthetic type  57.5 
 
 
575 aa  701    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00702842  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1389  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.89 
 
 
584 aa  699    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0317493  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2279  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  60.35 
 
 
572 aa  749    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  65.46 
 
 
574 aa  781    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1281  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.38 
 
 
587 aa  840    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1804  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.79 
 
 
607 aa  699    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516088  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0624  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.01 
 
 
574 aa  724    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.146468 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1274  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.38 
 
 
587 aa  840    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  60.64 
 
 
572 aa  750    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1848  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.2 
 
 
587 aa  837    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0846  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  65.64 
 
 
574 aa  783    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0527  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  62.26 
 
 
608 aa  756    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3075  acetolactate synthase, large subunit  66.2 
 
 
566 aa  784    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.843153  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  67.78 
 
 
592 aa  790    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0366089  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3112  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  68.19 
 
 
601 aa  813    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0197191  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0947  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.2 
 
 
587 aa  834    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2464  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  58.03 
 
 
585 aa  701    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0927747  normal  0.484681 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1991  acetolactate synthase, large subunit  71.35 
 
 
613 aa  817    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2343  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.7 
 
 
592 aa  680    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.34 
 
 
566 aa  670    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1419  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.38 
 
 
587 aa  840    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2520  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  73.69 
 
 
582 aa  909    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4788  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  65.1 
 
 
574 aa  781    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.092848  hitchhiker  0.00966018 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2637  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.41 
 
 
588 aa  666    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.89 
 
 
573 aa  739    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302703  decreased coverage  0.000148215 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5592  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.38 
 
 
587 aa  817    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  60.88 
 
 
574 aa  755    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.54 
 
 
574 aa  736    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.630637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  55.91 
 
 
566 aa  657    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2037  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.64 
 
 
564 aa  635    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182642  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0634  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  66.55 
 
 
567 aa  805    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.876407  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  60.57 
 
 
572 aa  748    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1006  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  66.25 
 
 
574 aa  795    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.850126  hitchhiker  0.0000000000038167 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  61.38 
 
 
575 aa  747    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  58.3 
 
 
573 aa  721    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1776  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  60.25 
 
 
573 aa  731    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0474  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  71.15 
 
 
585 aa  847    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0467  acetolactate synthase, large subunit  58.91 
 
 
586 aa  691    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5410  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  66.43 
 
 
574 aa  803    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350466  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6087  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.1 
 
 
589 aa  678    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1045  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.73 
 
 
587 aa  840    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.160852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0753  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.2 
 
 
587 aa  837    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1113  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.2 
 
 
587 aa  837    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3345  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.6 
 
 
592 aa  677    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615353  normal  0.0219835 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1488  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  58.27 
 
 
601 aa  697    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1063  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  66.08 
 
 
595 aa  793    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.722606  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1897  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.44 
 
 
588 aa  661    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.195023  normal  0.574809 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3322  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  67.96 
 
 
607 aa  811    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  65.17 
 
 
588 aa  776    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000348617  hitchhiker  0.0000942961 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3255  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.86 
 
 
593 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2119  acetolactate synthase, large subunit  68.08 
 
 
568 aa  830    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.712969  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2317  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  68.49 
 
 
594 aa  810    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.251422  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3231  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.63 
 
 
587 aa  814    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  60.82 
 
 
572 aa  753    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2008  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.69 
 
 
592 aa  694    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2098  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.19 
 
 
592 aa  676    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477274  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0501  acetolactate synthase, large subunit  60.56 
 
 
585 aa  721    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.143294  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2722  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.75 
 
 
592 aa  644    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.817808  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0522  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  62.43 
 
 
570 aa  756    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.96739  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0911  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  70.09 
 
 
587 aa  837    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0875  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.63 
 
 
583 aa  677    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.840064  normal  0.16884 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  62.94 
 
 
572 aa  752    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1654  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  68.92 
 
 
587 aa  813    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.527675  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1745  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  67.84 
 
 
593 aa  797    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0624  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.8 
 
 
572 aa  704    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1488  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.14 
 
 
600 aa  701    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1346  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.71 
 
 
584 aa  697    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0313448  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  60.18 
 
 
572 aa  749    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1830  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  60.18 
 
 
572 aa  750    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1628  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  60.35 
 
 
572 aa  749    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0079  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.54 
 
 
574 aa  734    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2303  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  69.63 
 
 
587 aa  819    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62160  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  65.9 
 
 
574 aa  802    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.09482 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2265  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  68.92 
 
 
587 aa  813    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587428  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  61.1 
 
 
572 aa  754    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1319  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  64.79 
 
 
570 aa  759    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2982  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.65 
 
 
572 aa  645    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000024883  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0609  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  62.96 
 
 
599 aa  761    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3024  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.65 
 
 
572 aa  645    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000501065  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0898  acetolactate synthase, large subunit  62.68 
 
 
564 aa  744    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2269  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  60.18 
 
 
572 aa  750    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1769  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  68.31 
 
 
598 aa  816    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.712951  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  61.06 
 
 
573 aa  748    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2558  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.32 
 
 
566 aa  660    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0505809  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  63.78 
 
 
574 aa  766    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145283  hitchhiker  0.0000405432 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2169  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.76 
 
 
575 aa  668    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649258  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2018  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.54 
 
 
573 aa  743    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.801766  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2105  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  67.67 
 
 
591 aa  800    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.54 
 
 
574 aa  727    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0609  acetolactate synthase, large subunit  55.38 
 
 
584 aa  636    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0318526  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0882  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  65.78 
 
 
572 aa  808    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>