More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2181 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00079  acetolactate synthase III large subunit  57.97 
 
 
574 aa  685    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3522  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.97 
 
 
574 aa  682    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.85 
 
 
575 aa  678    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.77 
 
 
566 aa  644    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4680  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  60.69 
 
 
574 aa  709    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0107751 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2270  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  69.98 
 
 
576 aa  839    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2077  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  79.73 
 
 
585 aa  1001    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1281  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  95.4 
 
 
587 aa  1176    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2105  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  72.76 
 
 
591 aa  905    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3236  acetolactate synthase III, large subunit, biosynthetic type  56.64 
 
 
575 aa  674    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00702842  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1769  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  76.08 
 
 
598 aa  926    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.712951  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1389  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.65 
 
 
584 aa  669    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0317493  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2279  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.83 
 
 
572 aa  708    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  61.23 
 
 
574 aa  723    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0079  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.97 
 
 
574 aa  685    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1063  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  75.21 
 
 
595 aa  940    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.722606  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2464  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.59 
 
 
585 aa  646    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0927747  normal  0.484681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4678  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  60.33 
 
 
574 aa  705    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000775214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4867  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  74.34 
 
 
593 aa  897    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1274  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  95.4 
 
 
587 aa  1176    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1848  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  95.23 
 
 
587 aa  1174    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0846  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  60.69 
 
 
574 aa  720    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0527  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.44 
 
 
608 aa  693    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3075  acetolactate synthase, large subunit  68.61 
 
 
566 aa  816    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.843153  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  74.78 
 
 
592 aa  889    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0366089  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0947  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  78.19 
 
 
587 aa  987    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1346  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.48 
 
 
584 aa  667    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0313448  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1991  acetolactate synthase, large subunit  71.13 
 
 
613 aa  833    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2343  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  53.58 
 
 
592 aa  641    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.43 
 
 
572 aa  714    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1419  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  95.4 
 
 
587 aa  1176    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2520  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  67.78 
 
 
582 aa  808    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4788  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.24 
 
 
574 aa  714    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.092848  hitchhiker  0.00966018 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2932  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.48 
 
 
593 aa  679    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1013  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  98.47 
 
 
587 aa  1208    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458682  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5592  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  98.47 
 
 
587 aa  1209    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1804  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.3 
 
 
607 aa  666    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516088  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2008  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.34 
 
 
592 aa  650    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  54.61 
 
 
566 aa  642    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4864  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.24 
 
 
591 aa  635    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0634  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  65.01 
 
 
567 aa  764    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.876407  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  60.14 
 
 
572 aa  718    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0624  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.67 
 
 
574 aa  666    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.146468 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.61 
 
 
574 aa  694    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1319  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.65 
 
 
570 aa  677    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0474  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  69.44 
 
 
585 aa  857    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0467  acetolactate synthase, large subunit  55.59 
 
 
586 aa  655    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.23 
 
 
573 aa  689    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3112  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  76.4 
 
 
601 aa  920    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0197191  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1045  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  96.59 
 
 
587 aa  1190    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.160852  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0396  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  95.23 
 
 
587 aa  1174    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1113  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  95.23 
 
 
587 aa  1174    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.97 
 
 
604 aa  683    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5410  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  61.48 
 
 
574 aa  733    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350466  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.9 
 
 
572 aa  687    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.33 
 
 
573 aa  708    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302703  decreased coverage  0.000148215 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3322  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  73.44 
 
 
607 aa  912    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  61.92 
 
 
588 aa  730    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000348617  hitchhiker  0.0000942961 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0754  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  60.14 
 
 
574 aa  704    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000260145 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2119  acetolactate synthase, large subunit  68.67 
 
 
568 aa  841    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.712969  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2317  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  74.3 
 
 
594 aa  907    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.251422  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3231  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  94.72 
 
 
587 aa  1148    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.36 
 
 
572 aa  704    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1488  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.74 
 
 
601 aa  672    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1955  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.9 
 
 
618 aa  700    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0501  acetolactate synthase, large subunit  56.77 
 
 
585 aa  672    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.143294  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3351  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  54.53 
 
 
601 aa  657    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0522  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.51 
 
 
570 aa  691    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.96739  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0911  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  78.02 
 
 
587 aa  986    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.96 
 
 
572 aa  715    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.97 
 
 
574 aa  686    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.630637  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1654  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  98.47 
 
 
587 aa  1209    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.527675  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1745  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  75.13 
 
 
593 aa  903    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0624  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.07 
 
 
572 aa  669    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1488  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  55.83 
 
 
600 aa  652    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.48 
 
 
566 aa  654    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.3 
 
 
572 aa  709    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1830  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.3 
 
 
572 aa  708    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1628  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.79 
 
 
572 aa  711    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.84 
 
 
573 aa  686    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2303  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  99.49 
 
 
587 aa  1216    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62160  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  61.84 
 
 
574 aa  736    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.09482 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2265  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  98.47 
 
 
587 aa  1209    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587428  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  60.14 
 
 
572 aa  718    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  60.33 
 
 
574 aa  706    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145283  hitchhiker  0.0000405432 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2288  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  98.47 
 
 
587 aa  1209    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0609  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.04 
 
 
599 aa  693    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2893  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  73.31 
 
 
592 aa  915    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020584 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0898  acetolactate synthase, large subunit  60.43 
 
 
564 aa  720    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2269  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.3 
 
 
572 aa  708    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1006  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  62.14 
 
 
574 aa  728    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.850126  hitchhiker  0.0000000000038167 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2558  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.32 
 
 
566 aa  647    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0505809  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.94 
 
 
593 aa  640    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3580  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.97 
 
 
574 aa  682    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.85 
 
 
575 aa  678    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2018  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.44 
 
 
573 aa  697    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.801766  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0753  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  95.23 
 
 
587 aa  1174    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.56 
 
 
574 aa  677    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1776  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.97 
 
 
573 aa  695    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0882  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.54 
 
 
572 aa  733    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>