More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00079 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00079  acetolactate synthase III large subunit  100 
 
 
574 aa  1188    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3522  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  99.65 
 
 
574 aa  1183    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.89 
 
 
592 aa  666    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0366089  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2022  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.19 
 
 
585 aa  661    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.721399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4680  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  65.68 
 
 
574 aa  785    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0107751 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2270  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  59.54 
 
 
576 aa  735    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2077  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.69 
 
 
585 aa  678    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0624  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  91.46 
 
 
574 aa  1098    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.146468 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1955  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  71.9 
 
 
618 aa  891    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3236  acetolactate synthase III, large subunit, biosynthetic type  63.68 
 
 
575 aa  767    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00702842  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1745  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.77 
 
 
593 aa  683    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.569862 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0125  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  92.51 
 
 
584 aa  1114    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2279  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  74.22 
 
 
572 aa  918    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  63.37 
 
 
574 aa  780    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2288  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.79 
 
 
587 aa  665    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1063  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.82 
 
 
595 aa  678    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.722606  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1281  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.62 
 
 
587 aa  682    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  71.3 
 
 
573 aa  897    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1274  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.62 
 
 
587 aa  682    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  74.69 
 
 
572 aa  926    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1848  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.19 
 
 
587 aa  682    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0846  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  63.54 
 
 
574 aa  776    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0527  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  61.91 
 
 
608 aa  776    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3075  acetolactate synthase, large subunit  58.17 
 
 
566 aa  685    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.843153  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0947  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.87 
 
 
587 aa  687    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  75.26 
 
 
572 aa  934    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1991  acetolactate synthase, large subunit  59.61 
 
 
613 aa  675    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0810  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.39 
 
 
595 aa  681    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.845021  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1776  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  73.61 
 
 
573 aa  887    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1419  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.62 
 
 
587 aa  682    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2520  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  58.6 
 
 
582 aa  709    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4788  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  63.02 
 
 
574 aa  782    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.092848  hitchhiker  0.00966018 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7490  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  55.01 
 
 
591 aa  638    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300695  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0086  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  99.3 
 
 
574 aa  1177    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5592  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.79 
 
 
587 aa  666    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  75.09 
 
 
572 aa  933    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5410  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  64.3 
 
 
574 aa  779    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350466  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2893  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.14 
 
 
592 aa  696    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020584 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  98.95 
 
 
604 aa  1180    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0634  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  61.84 
 
 
567 aa  752    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.876407  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0396  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.19 
 
 
587 aa  682    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2932  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  84.17 
 
 
593 aa  1021    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  84.32 
 
 
572 aa  1013    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2773  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.57 
 
 
570 aa  694    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.239005  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0474  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  56.89 
 
 
585 aa  688    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  71.13 
 
 
573 aa  892    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1006  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  65.1 
 
 
574 aa  791    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.850126  hitchhiker  0.0000000000038167 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  99.48 
 
 
574 aa  1180    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.630637  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1045  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.44 
 
 
587 aa  680    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.160852  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1013  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  58.14 
 
 
587 aa  670    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.458682  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3112  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.94 
 
 
601 aa  692    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0197191  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  92.33 
 
 
584 aa  1112    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.084297 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2181  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.97 
 
 
587 aa  669    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384106  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  74.91 
 
 
572 aa  931    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0079  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  99.83 
 
 
574 aa  1186    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3322  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.42 
 
 
607 aa  686    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  61.21 
 
 
588 aa  749    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000348617  hitchhiker  0.0000942961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4867  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.33 
 
 
593 aa  692    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2119  acetolactate synthase, large subunit  59.33 
 
 
568 aa  703    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.712969  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2317  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.42 
 
 
594 aa  683    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.251422  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3231  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.19 
 
 
587 aa  662    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  73.17 
 
 
572 aa  912    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0892  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  58.38 
 
 
581 aa  710    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.806334  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  84.17 
 
 
575 aa  1021    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0501  acetolactate synthase, large subunit  57.09 
 
 
585 aa  706    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.143294  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  73.09 
 
 
573 aa  900    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302703  decreased coverage  0.000148215 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0522  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  61.91 
 
 
570 aa  776    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.96739  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0911  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.04 
 
 
587 aa  689    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  71.48 
 
 
573 aa  882    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  84.17 
 
 
575 aa  1021    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1654  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.79 
 
 
587 aa  665    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.527675  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  71.9 
 
 
574 aa  892    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0624  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  63.94 
 
 
572 aa  793    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1328  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.84 
 
 
587 aa  676    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0958781 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0754  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  64.99 
 
 
574 aa  784    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000260145 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  74.04 
 
 
572 aa  915    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1830  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  74.22 
 
 
572 aa  917    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1628  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  73.34 
 
 
572 aa  916    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2303  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.79 
 
 
587 aa  668    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62160  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  63.72 
 
 
574 aa  778    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.09482 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3580  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  99.65 
 
 
574 aa  1183    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105289 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2265  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.79 
 
 
587 aa  665    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587428  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1319  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  62.37 
 
 
570 aa  768    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2105  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.72 
 
 
591 aa  679    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0907357 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00556  acetolactate synthase III large subunit  64.98 
 
 
572 aa  800    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1113  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.19 
 
 
587 aa  682    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  92.51 
 
 
584 aa  1112    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0898  acetolactate synthase, large subunit  53.27 
 
 
564 aa  641    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2269  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  74.22 
 
 
572 aa  919    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1769  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  59.09 
 
 
598 aa  696    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.712951  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0127  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  92.16 
 
 
584 aa  1109    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.53134  hitchhiker  0.000772873 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2228  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  56.18 
 
 
585 aa  678    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.635342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  65.86 
 
 
574 aa  787    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145283  hitchhiker  0.0000405432 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4678  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  65.51 
 
 
574 aa  785    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000775214 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2018  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  75.69 
 
 
573 aa  929    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.801766  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0609  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  63.53 
 
 
599 aa  783    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  65.68 
 
 
574 aa  815    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0753  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  57.19 
 
 
587 aa  682    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0882  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  62.3 
 
 
572 aa  780    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.240618  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0128  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  92.33 
 
 
584 aa  1108    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>