More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3448 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00457  glyoxylate carboligase  79.58 
 
 		 593 aa  964    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.50477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3105  glyoxylate carboligase  79.58 
 
 		 593 aa  964    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2367  glyoxylate carboligase  77.03 
 
 		 591 aa  907    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1157  glyoxylate carboligase  73.49 
 
 		 594 aa  895    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4297  glyoxylate carboligase  74.31 
 
 		 591 aa  916    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4866  glyoxylate carboligase  68.57 
 
 		 579 aa  852    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.553307 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3281  glyoxylate carboligase  87.84 
 
 		 591 aa  1080    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.819791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2259  glyoxylate carboligase  80.97 
 
 		 591 aa  983    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.712116  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3115  glyoxylate carboligase  79.58 
 
 		 593 aa  964    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3829  glyoxylate carboligase  74.87 
 
 		 591 aa  926    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3622  glyoxylate carboligase  74.65 
 
 		 591 aa  917    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3291  glyoxylate carboligase  94.77 
 
 		 594 aa  1165    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1620  glyoxylate carboligase  80.21 
 
 		 591 aa  976    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44538  normal  0.510397 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2424  glyoxylate carboligase  81.14 
 
 		 591 aa  984    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1598  glyoxylate carboligase  75.52 
 
 		 591 aa  937    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035378  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2312  glyoxylate carboligase  74.58 
 
 		 591 aa  917    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3478  glyoxylate carboligase  91.03 
 
 		 591 aa  1112    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5178  glyoxylate carboligase  81.14 
 
 		 591 aa  983    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0564  glyoxylate carboligase  78.55 
 
 		 593 aa  960    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1787  glyoxylate carboligase  80.14 
 
 		 591 aa  977    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1901  glyoxylate carboligase  81.66 
 
 		 591 aa  986    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000229041 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0566  glyoxylate carboligase  78.55 
 
 		 593 aa  960    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1396  glyoxylate carboligase  80.8 
 
 		 591 aa  983    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0458  glyoxylate carboligase  73.1 
 
 		 594 aa  885    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258476  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0550  glyoxylate carboligase  79.07 
 
 		 593 aa  957    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2173  glyoxylate carboligase  81.49 
 
 		 591 aa  981    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52322  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1135  glyoxylate carboligase  73.81 
 
 		 596 aa  880    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2769  glyoxylate carboligase  74.53 
 
 		 591 aa  920    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155295  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4561  glyoxylate carboligase  74.26 
 
 		 598 aa  884    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2460  glyoxylate carboligase  80.03 
 
 		 591 aa  972    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.583136  normal  0.435829 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1782  glyoxylate carboligase  80.03 
 
 		 591 aa  976    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.538882  normal  0.818313 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3448  glyoxylate carboligase  100 
 
 		 596 aa  1227    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2612  glyoxylate carboligase  74.7 
 
 		 592 aa  928    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0625  glyoxylate carboligase  78.72 
 
 		 593 aa  962    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.610949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0441  glyoxylate carboligase  79.32 
 
 		 593 aa  966    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0206883  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6201  glyoxylate carboligase  81.83 
 
 		 591 aa  989    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0309842  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3438  glyoxylate carboligase  70.03 
 
 		 596 aa  866    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4308  glyoxylate carboligase  75.38 
 
 		 594 aa  908    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0403052 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2117  glyoxylate carboligase  76.42 
 
 		 596 aa  920    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3151  glyoxylate carboligase  89.38 
 
 		 595 aa  1095    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1815  glyoxylate carboligase  80.31 
 
 		 591 aa  978    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2299  glyoxylate carboligase  81.14 
 
 		 591 aa  984    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408845  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45000  glyoxylate carboligase  74.87 
 
 		 591 aa  926    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1572  glyoxylate carboligase  74.31 
 
 		 591 aa  915    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0611133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0244  glyoxylate carboligase  70.12 
 
 		 601 aa  858    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3691  glyoxylate carboligase  71.19 
 
 		 592 aa  882    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1878  glyoxylate carboligase  81.83 
 
 		 591 aa  989    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232165  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3087  glyoxylate carboligase  74.41 
 
 		 591 aa  918    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3862  glyoxylate carboligase  74.83 
 
 		 591 aa  921    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.985049  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43400  glyoxylate carboligase  74.29 
 
 		 567 aa  819    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0581  glyoxylate carboligase  79.58 
 
 		 593 aa  964    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3954  glyoxylate carboligase  78.19 
 
 		 597 aa  964    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416682  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0544  glyoxylate carboligase  79.41 
 
 		 593 aa  961    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1299  glyoxylate carboligase  78.78 
 
 		 591 aa  964    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00462  hypothetical protein  79.58 
 
 		 593 aa  964    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.711449  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0571  glyoxylate carboligase  78.55 
 
 		 593 aa  960    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0608  glyoxylate carboligase  79.58 
 
 		 593 aa  964    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08150  glyoxylate carboligase  67.8 
 
 		 603 aa  829    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3455  glyoxylate carboligase  52.5 
 
 		 577 aa  623  1e-177  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2548  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  53.24 
 
 		 570 aa  608  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.122041 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2853  glyoxylate carboligase  53.95 
 
 		 583 aa  611  1e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0172907  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0723  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  51.55 
 
 		 571 aa  588  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4728  glyoxylate carboligase  50.77 
 
 		 572 aa  569  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1175  Acetolactate synthase  35.89 
 
 		 591 aa  371  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.112778  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.71 
 
 		 552 aa  358  9.999999999999999e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  36.36 
 
 		 588 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.08 
 
 		 569 aa  358  1.9999999999999998e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4449  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.01 
 
 		 570 aa  354  2e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.23 
 
 		 553 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.54 
 
 		 554 aa  350  4e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.77 
 
 		 557 aa  348  1e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.66 
 
 		 566 aa  348  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  34.94 
 
 		 587 aa  347  3e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  35.39 
 
 		 602 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  35.63 
 
 		 619 aa  346  7e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.28 
 
 		 554 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.33 
 
 		 559 aa  343  4e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.99 
 
 		 555 aa  342  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  34.7 
 
 		 587 aa  342  1e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  34.36 
 
 		 563 aa  341  2e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  34.28 
 
 		 587 aa  340  5e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  35.64 
 
 		 612 aa  340  5.9999999999999996e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  35.28 
 
 		 557 aa  339  7e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  34.34 
 
 		 587 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2122  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  35.25 
 
 		 625 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2420  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.11 
 
 		 586 aa  336  5.999999999999999e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3230  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.01 
 
 		 644 aa  336  7e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.89 
 
 		 566 aa  336  9e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  37.04 
 
 		 577 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  34 
 
 		 599 aa  335  2e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  33.8 
 
 		 587 aa  334  3e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.08 
 
 		 562 aa  333  4e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4126  acetolactate synthase large subunit  34.45 
 
 		 638 aa  333  4e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  34.95 
 
 		 567 aa  333  4e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0929  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  35.12 
 
 		 619 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0902  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  35.12 
 
 		 619 aa  332  8e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4239  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  35.6 
 
 		 620 aa  332  9e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.302024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2757  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  34.16 
 
 		 632 aa  332  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.928665  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.38 
 
 		 558 aa  332  2e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.29 
 
 		 566 aa  331  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>