More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2117 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0458  glyoxylate carboligase  76.21 
 
 		 594 aa  954    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258476  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00457  glyoxylate carboligase  75.29 
 
 		 593 aa  941    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.50477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3105  glyoxylate carboligase  75.29 
 
 		 593 aa  941    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3862  glyoxylate carboligase  77.35 
 
 		 591 aa  958    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.985049  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4297  glyoxylate carboligase  77.85 
 
 		 591 aa  966    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3281  glyoxylate carboligase  76.68 
 
 		 591 aa  920    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.819791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3115  glyoxylate carboligase  75.29 
 
 		 593 aa  941    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2367  glyoxylate carboligase  76.35 
 
 		 591 aa  911    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2769  glyoxylate carboligase  78.36 
 
 		 591 aa  973    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155295  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0544  glyoxylate carboligase  75.29 
 
 		 593 aa  941    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3087  glyoxylate carboligase  74.5 
 
 		 591 aa  936    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0441  glyoxylate carboligase  75.13 
 
 		 593 aa  939    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0206883  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3622  glyoxylate carboligase  77.35 
 
 		 591 aa  958    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1787  glyoxylate carboligase  78.86 
 
 		 591 aa  988    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1620  glyoxylate carboligase  79.53 
 
 		 591 aa  992    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44538  normal  0.510397 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00462  hypothetical protein  75.29 
 
 		 593 aa  941    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.711449  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3291  glyoxylate carboligase  76.94 
 
 		 594 aa  927    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2424  glyoxylate carboligase  79.7 
 
 		 591 aa  987    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1598  glyoxylate carboligase  77.68 
 
 		 591 aa  976    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035378  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1396  glyoxylate carboligase  78.86 
 
 		 591 aa  987    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5178  glyoxylate carboligase  78.86 
 
 		 591 aa  985    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0564  glyoxylate carboligase  74.62 
 
 		 593 aa  934    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0550  glyoxylate carboligase  74.62 
 
 		 593 aa  934    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0608  glyoxylate carboligase  75.29 
 
 		 593 aa  941    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0566  glyoxylate carboligase  74.62 
 
 		 593 aa  934    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2312  glyoxylate carboligase  76.85 
 
 		 591 aa  949    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2173  glyoxylate carboligase  79.87 
 
 		 591 aa  987    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52322  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4308  glyoxylate carboligase  77.22 
 
 		 594 aa  959    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0403052 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3478  glyoxylate carboligase  76.94 
 
 		 591 aa  926    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4561  glyoxylate carboligase  76.57 
 
 		 598 aa  908    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2460  glyoxylate carboligase  79.03 
 
 		 591 aa  986    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.583136  normal  0.435829 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3448  glyoxylate carboligase  76.42 
 
 		 596 aa  920    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2612  glyoxylate carboligase  75.38 
 
 		 592 aa  926    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6201  glyoxylate carboligase  79.03 
 
 		 591 aa  985    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0309842  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1157  glyoxylate carboligase  73.49 
 
 		 594 aa  922    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3954  glyoxylate carboligase  79.3 
 
 		 597 aa  988    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416682  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1815  glyoxylate carboligase  79.03 
 
 		 591 aa  989    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45000  glyoxylate carboligase  77.68 
 
 		 591 aa  961    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3829  glyoxylate carboligase  77.68 
 
 		 591 aa  961    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3438  glyoxylate carboligase  71.48 
 
 		 596 aa  890    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3691  glyoxylate carboligase  72.13 
 
 		 592 aa  891    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1878  glyoxylate carboligase  79.03 
 
 		 591 aa  985    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232165  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0244  glyoxylate carboligase  74.79 
 
 		 601 aa  908    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1135  glyoxylate carboligase  75.66 
 
 		 596 aa  902    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43400  glyoxylate carboligase  76.64 
 
 		 567 aa  852    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0581  glyoxylate carboligase  75.63 
 
 		 593 aa  944    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1782  glyoxylate carboligase  78.86 
 
 		 591 aa  984    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.538882  normal  0.818313 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08150  glyoxylate carboligase  69.24 
 
 		 603 aa  847    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1299  glyoxylate carboligase  78.02 
 
 		 591 aa  966    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2117  glyoxylate carboligase  100 
 
 		 596 aa  1229    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226819 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1901  glyoxylate carboligase  78.86 
 
 		 591 aa  983    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000229041 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4866  glyoxylate carboligase  69.19 
 
 		 579 aa  839    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.553307 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2259  glyoxylate carboligase  79.53 
 
 		 591 aa  986    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.712116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2299  glyoxylate carboligase  79.7 
 
 		 591 aa  987    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408845  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0571  glyoxylate carboligase  74.62 
 
 		 593 aa  934    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3151  glyoxylate carboligase  76.41 
 
 		 595 aa  918    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1572  glyoxylate carboligase  77.68 
 
 		 591 aa  962    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0611133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0625  glyoxylate carboligase  74.62 
 
 		 593 aa  934    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.610949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2853  glyoxylate carboligase  52.15 
 
 		 583 aa  591  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0172907  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3455  glyoxylate carboligase  49.23 
 
 		 577 aa  580  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2548  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  50.85 
 
 		 570 aa  576  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.122041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4728  glyoxylate carboligase  49.07 
 
 		 572 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0723  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  48.98 
 
 		 571 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1175  Acetolactate synthase  33.16 
 
 		 591 aa  349  8e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.112778  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  35.01 
 
 		 588 aa  348  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.05 
 
 		 569 aa  344  2.9999999999999997e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.46 
 
 		 553 aa  342  8e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.22 
 
 		 552 aa  342  1e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4449  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.45 
 
 		 570 aa  340  5e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  34.19 
 
 		 563 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.66 
 
 		 557 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1335  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  36.68 
 
 		 611 aa  337  2.9999999999999997e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.552773 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0105  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.62 
 
 		 568 aa  335  2e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180923  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.59 
 
 		 554 aa  334  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.51 
 
 		 581 aa  333  6e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2122  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  35.33 
 
 		 625 aa  332  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13018  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  34.81 
 
 		 618 aa  331  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0170383  normal  0.298126 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.98 
 
 		 581 aa  330  4e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.45 
 
 		 636 aa  330  5.0000000000000004e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3230  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.75 
 
 		 644 aa  330  7e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2821  acetolactate synthase large subunit  34.58 
 
 		 581 aa  329  8e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.59 
 
 		 535 aa  329  9e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.59 
 
 		 569 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.74 
 
 		 555 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0611  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  35.41 
 
 		 589 aa  325  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.175913  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.15 
 
 		 566 aa  326  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.34 
 
 		 558 aa  325  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  34.95 
 
 		 570 aa  324  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7782  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  34.84 
 
 		 586 aa  325  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.98 
 
 		 554 aa  325  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4239  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  35.34 
 
 		 620 aa  325  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.302024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8059  acetolactate synthase, large subunit  35.71 
 
 		 578 aa  324  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.5 
 
 		 565 aa  324  3e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  34.77 
 
 		 570 aa  324  4e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  34.77 
 
 		 570 aa  324  4e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.78 
 
 		 559 aa  323  4e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  34.77 
 
 		 570 aa  324  4e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2229  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.69 
 
 		 579 aa  323  5e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3554  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.58 
 
 		 581 aa  323  7e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.743835  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  32.33 
 
 		 599 aa  323  7e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>