More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_08150 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1787  glyoxylate carboligase  70.02 
 
 		 591 aa  853    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00457  glyoxylate carboligase  70.09 
 
 		 593 aa  851    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.50477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3105  glyoxylate carboligase  70.09 
 
 		 593 aa  851    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1396  glyoxylate carboligase  70.36 
 
 		 591 aa  855    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1620  glyoxylate carboligase  69.15 
 
 		 591 aa  841    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44538  normal  0.510397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4297  glyoxylate carboligase  70.19 
 
 		 591 aa  862    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1782  glyoxylate carboligase  69.85 
 
 		 591 aa  848    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.538882  normal  0.818313 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3281  glyoxylate carboligase  67.25 
 
 		 591 aa  791    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.819791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0608  glyoxylate carboligase  70.09 
 
 		 593 aa  851    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3862  glyoxylate carboligase  70.7 
 
 		 591 aa  869    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.985049  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3829  glyoxylate carboligase  70.7 
 
 		 591 aa  868    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0544  glyoxylate carboligase  69.74 
 
 		 593 aa  848    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00462  hypothetical protein  70.09 
 
 		 593 aa  851    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.711449  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3291  glyoxylate carboligase  68.17 
 
 		 594 aa  835    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2117  glyoxylate carboligase  69.24 
 
 		 596 aa  847    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226819 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2424  glyoxylate carboligase  69.68 
 
 		 591 aa  838    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1598  glyoxylate carboligase  69.34 
 
 		 591 aa  863    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035378  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3622  glyoxylate carboligase  70.36 
 
 		 591 aa  865    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3151  glyoxylate carboligase  67.59 
 
 		 595 aa  806    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5178  glyoxylate carboligase  70.53 
 
 		 591 aa  856    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0458  glyoxylate carboligase  68.86 
 
 		 594 aa  845    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258476  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0571  glyoxylate carboligase  69.57 
 
 		 593 aa  846    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2367  glyoxylate carboligase  67.74 
 
 		 591 aa  829    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3087  glyoxylate carboligase  69.49 
 
 		 591 aa  839    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2173  glyoxylate carboligase  69.85 
 
 		 591 aa  840    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52322  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0441  glyoxylate carboligase  69.91 
 
 		 593 aa  849    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0206883  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1299  glyoxylate carboligase  70.19 
 
 		 591 aa  858    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1572  glyoxylate carboligase  70.36 
 
 		 591 aa  867    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0611133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0625  glyoxylate carboligase  69.57 
 
 		 593 aa  847    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.610949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1157  glyoxylate carboligase  68.64 
 
 		 594 aa  829    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2769  glyoxylate carboligase  70.36 
 
 		 591 aa  871    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155295  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4561  glyoxylate carboligase  69.3 
 
 		 598 aa  821    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2460  glyoxylate carboligase  69.17 
 
 		 591 aa  838    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.583136  normal  0.435829 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3448  glyoxylate carboligase  67.8 
 
 		 596 aa  829    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2612  glyoxylate carboligase  69.88 
 
 		 592 aa  844    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4866  glyoxylate carboligase  66.49 
 
 		 579 aa  792    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.553307 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3115  glyoxylate carboligase  70.09 
 
 		 593 aa  851    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6201  glyoxylate carboligase  70.7 
 
 		 591 aa  855    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0309842  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0244  glyoxylate carboligase  70.38 
 
 		 601 aa  843    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4308  glyoxylate carboligase  69.02 
 
 		 594 aa  840    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0403052 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3438  glyoxylate carboligase  76.43 
 
 		 596 aa  941    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1901  glyoxylate carboligase  70.7 
 
 		 591 aa  855    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000229041 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1135  glyoxylate carboligase  69.54 
 
 		 596 aa  821    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1815  glyoxylate carboligase  70.02 
 
 		 591 aa  853    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45000  glyoxylate carboligase  70.7 
 
 		 591 aa  868    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3691  glyoxylate carboligase  78.14 
 
 		 592 aa  963    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1878  glyoxylate carboligase  70.7 
 
 		 591 aa  855    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232165  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3954  glyoxylate carboligase  67.51 
 
 		 597 aa  823    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416682  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08150  glyoxylate carboligase  100 
 
 		 603 aa  1228    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0566  glyoxylate carboligase  69.4 
 
 		 593 aa  845    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3478  glyoxylate carboligase  67.71 
 
 		 591 aa  808    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0550  glyoxylate carboligase  69.74 
 
 		 593 aa  848    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43400  glyoxylate carboligase  72.71 
 
 		 567 aa  791    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2312  glyoxylate carboligase  70 
 
 		 591 aa  862    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0564  glyoxylate carboligase  69.57 
 
 		 593 aa  846    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0581  glyoxylate carboligase  70.09 
 
 		 593 aa  851    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2259  glyoxylate carboligase  69.85 
 
 		 591 aa  838    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.712116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2299  glyoxylate carboligase  69.68 
 
 		 591 aa  838    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408845  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2853  glyoxylate carboligase  54.09 
 
 		 583 aa  597  1e-169  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0172907  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3455  glyoxylate carboligase  51.05 
 
 		 577 aa  588  1e-167  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2548  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  50.52 
 
 		 570 aa  581  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.122041 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0723  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  50.95 
 
 		 571 aa  565  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4728  glyoxylate carboligase  50.26 
 
 		 572 aa  547  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1175  Acetolactate synthase  36.76 
 
 		 591 aa  373  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.112778  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  37.78 
 
 		 588 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  37.18 
 
 		 557 aa  350  6e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  35.59 
 
 		 587 aa  344  2e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.7 
 
 		 557 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.66 
 
 		 569 aa  342  9e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  35.71 
 
 		 587 aa  340  4e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  35.18 
 
 		 587 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.5 
 
 		 558 aa  338  1.9999999999999998e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0105  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.86 
 
 		 568 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180923  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.43 
 
 		 555 aa  336  7.999999999999999e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.55 
 
 		 559 aa  335  1e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.12 
 
 		 563 aa  335  2e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  33.87 
 
 		 587 aa  333  5e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.11 
 
 		 558 aa  333  5e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  34.42 
 
 		 563 aa  333  6e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  35.58 
 
 		 567 aa  333  6e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.57 
 
 		 552 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  35.09 
 
 		 562 aa  328  2.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.6 
 
 		 553 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.16 
 
 		 554 aa  327  5e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.53 
 
 		 566 aa  326  6e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.96 
 
 		 554 aa  327  6e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2864  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.15 
 
 		 659 aa  326  8.000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  34.08 
 
 		 599 aa  326  1e-87  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  35.38 
 
 		 572 aa  325  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  36.12 
 
 		 619 aa  324  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.19 
 
 		 558 aa  323  6e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.92 
 
 		 566 aa  323  8e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8059  acetolactate synthase, large subunit  35.48 
 
 		 578 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  37.35 
 
 		 593 aa  322  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1335  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  35.47 
 
 		 611 aa  321  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.552773 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.7 
 
 		 555 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0706  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  35.78 
 
 		 581 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0609  acetolactate synthase, large subunit  34.34 
 
 		 584 aa  320  6e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0318526  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  36.18 
 
 		 602 aa  319  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3230  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.82 
 
 		 644 aa  319  9e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>