More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4728 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3455  glyoxylate carboligase  62.37 
 
 		 577 aa  729    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4728  glyoxylate carboligase  100 
 
 		 572 aa  1159    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2853  glyoxylate carboligase  60.56 
 
 		 583 aa  665    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0172907  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0723  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  80.11 
 
 		 571 aa  934    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2548  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  74.3 
 
 		 570 aa  855    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.122041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45000  glyoxylate carboligase  52.14 
 
 		 591 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3829  glyoxylate carboligase  52.14 
 
 		 591 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3291  glyoxylate carboligase  50.77 
 
 		 594 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2612  glyoxylate carboligase  52.66 
 
 		 592 aa  583  1.0000000000000001e-165  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1598  glyoxylate carboligase  51.55 
 
 		 591 aa  578  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035378  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3448  glyoxylate carboligase  50.77 
 
 		 596 aa  580  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4297  glyoxylate carboligase  51.55 
 
 		 591 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3622  glyoxylate carboligase  51.38 
 
 		 591 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3478  glyoxylate carboligase  51.38 
 
 		 591 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1572  glyoxylate carboligase  51.38 
 
 		 591 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0611133  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3281  glyoxylate carboligase  52.23 
 
 		 591 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.819791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3151  glyoxylate carboligase  51.2 
 
 		 595 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3862  glyoxylate carboligase  51.03 
 
 		 591 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.985049  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5178  glyoxylate carboligase  50.6 
 
 		 591 aa  568  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1901  glyoxylate carboligase  50.6 
 
 		 591 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000229041 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6201  glyoxylate carboligase  50.6 
 
 		 591 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0309842  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1878  glyoxylate carboligase  50.6 
 
 		 591 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232165  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1787  glyoxylate carboligase  50.43 
 
 		 591 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2299  glyoxylate carboligase  50.94 
 
 		 591 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408845  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2312  glyoxylate carboligase  50.52 
 
 		 591 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2424  glyoxylate carboligase  50.94 
 
 		 591 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2769  glyoxylate carboligase  50.26 
 
 		 591 aa  568  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155295  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1396  glyoxylate carboligase  50.26 
 
 		 591 aa  566  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1815  glyoxylate carboligase  50.26 
 
 		 591 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3954  glyoxylate carboligase  50 
 
 		 597 aa  567  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416682  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2259  glyoxylate carboligase  50.77 
 
 		 591 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.712116  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2173  glyoxylate carboligase  50.94 
 
 		 591 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52322  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1157  glyoxylate carboligase  50.86 
 
 		 594 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0571  glyoxylate carboligase  49.83 
 
 		 593 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0625  glyoxylate carboligase  49.83 
 
 		 593 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.610949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08150  glyoxylate carboligase  50.26 
 
 		 603 aa  561  1e-158  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3087  glyoxylate carboligase  50.52 
 
 		 591 aa  561  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0564  glyoxylate carboligase  49.83 
 
 		 593 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1782  glyoxylate carboligase  49.83 
 
 		 591 aa  561  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.538882  normal  0.818313 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1620  glyoxylate carboligase  49.66 
 
 		 591 aa  558  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44538  normal  0.510397 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2460  glyoxylate carboligase  49.83 
 
 		 591 aa  560  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.583136  normal  0.435829 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3691  glyoxylate carboligase  50 
 
 		 592 aa  559  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2367  glyoxylate carboligase  50.52 
 
 		 591 aa  560  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1299  glyoxylate carboligase  50.26 
 
 		 591 aa  559  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00457  glyoxylate carboligase  49.06 
 
 		 593 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.50477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3105  glyoxylate carboligase  49.06 
 
 		 593 aa  556  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00462  hypothetical protein  49.06 
 
 		 593 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.711449  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0458  glyoxylate carboligase  49.23 
 
 		 594 aa  558  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258476  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3115  glyoxylate carboligase  49.06 
 
 		 593 aa  556  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0441  glyoxylate carboligase  49.06 
 
 		 593 aa  556  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0206883  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0566  glyoxylate carboligase  49.65 
 
 		 593 aa  558  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0608  glyoxylate carboligase  49.06 
 
 		 593 aa  556  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0544  glyoxylate carboligase  48.89 
 
 		 593 aa  555  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0581  glyoxylate carboligase  49.06 
 
 		 593 aa  555  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2117  glyoxylate carboligase  49.07 
 
 		 596 aa  552  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226819 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4561  glyoxylate carboligase  49.83 
 
 		 598 aa  552  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0550  glyoxylate carboligase  48.89 
 
 		 593 aa  553  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3438  glyoxylate carboligase  48.89 
 
 		 596 aa  551  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1135  glyoxylate carboligase  50 
 
 		 596 aa  550  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4308  glyoxylate carboligase  48.81 
 
 		 594 aa  549  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0403052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4866  glyoxylate carboligase  49.83 
 
 		 579 aa  546  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.553307 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0244  glyoxylate carboligase  49.41 
 
 		 601 aa  540  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43400  glyoxylate carboligase  50.77 
 
 		 567 aa  491  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  40.32 
 
 		 558 aa  366  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  37.48 
 
 		 557 aa  365  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  36.72 
 
 		 599 aa  361  2e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.23 
 
 		 553 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.83 
 
 		 557 aa  357  5e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  38.24 
 
 		 566 aa  356  5e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  38.78 
 
 		 552 aa  354  2e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.77 
 
 		 555 aa  352  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.61 
 
 		 582 aa  352  1e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.65 
 
 		 566 aa  350  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4449  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.8 
 
 		 570 aa  350  6e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  35.36 
 
 		 563 aa  348  1e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  37.21 
 
 		 587 aa  348  2e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  36.56 
 
 		 578 aa  348  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  36.92 
 
 		 587 aa  347  2e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  36.92 
 
 		 587 aa  348  2e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  36.89 
 
 		 567 aa  347  3e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  36.78 
 
 		 566 aa  347  5e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  36.41 
 
 		 588 aa  346  8e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.94 
 
 		 559 aa  346  8e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  36.1 
 
 		 577 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2270  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.83 
 
 		 576 aa  345  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3322  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  38.16 
 
 		 607 aa  344  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3108  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  38.33 
 
 		 571 aa  345  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  36.02 
 
 		 587 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.67 
 
 		 554 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.93 
 
 		 563 aa  343  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  36.74 
 
 		 562 aa  343  4e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1063  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.91 
 
 		 595 aa  343  5e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.722606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1175  Acetolactate synthase  35.58 
 
 		 591 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.112778  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.43 
 
 		 566 aa  343  7e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  39.25 
 
 		 556 aa  342  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0634  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.11 
 
 		 567 aa  342  2e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.876407  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.41 
 
 		 636 aa  341  2e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0105  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.85 
 
 		 568 aa  342  2e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180923  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  35.83 
 
 		 612 aa  338  9.999999999999999e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.3 
 
 		 563 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0519918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>