More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2853 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_3455  glyoxylate carboligase  71.1 
 
 		 577 aa  842    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0723  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  61.5 
 
 		 571 aa  714    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2853  glyoxylate carboligase  100 
 
 		 583 aa  1175    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0172907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4728  glyoxylate carboligase  60.56 
 
 		 572 aa  664    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2548  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  61.81 
 
 		 570 aa  703    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.122041 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3478  glyoxylate carboligase  53.12 
 
 		 591 aa  622  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3448  glyoxylate carboligase  53.95 
 
 		 596 aa  624  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3291  glyoxylate carboligase  54.3 
 
 		 594 aa  620  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2367  glyoxylate carboligase  52.72 
 
 		 591 aa  620  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2424  glyoxylate carboligase  54.04 
 
 		 591 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2299  glyoxylate carboligase  54.04 
 
 		 591 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408845  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2173  glyoxylate carboligase  54.39 
 
 		 591 aa  617  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52322  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1299  glyoxylate carboligase  54.03 
 
 		 591 aa  616  1e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3151  glyoxylate carboligase  52.85 
 
 		 595 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3954  glyoxylate carboligase  52.01 
 
 		 597 aa  613  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416682  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4297  glyoxylate carboligase  53.47 
 
 		 591 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3281  glyoxylate carboligase  52.78 
 
 		 591 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.819791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1598  glyoxylate carboligase  52.08 
 
 		 591 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035378  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2259  glyoxylate carboligase  53.87 
 
 		 591 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.712116  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3862  glyoxylate carboligase  53.3 
 
 		 591 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.985049  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1572  glyoxylate carboligase  53.3 
 
 		 591 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0611133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5178  glyoxylate carboligase  52.38 
 
 		 591 aa  610  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3622  glyoxylate carboligase  53.12 
 
 		 591 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1396  glyoxylate carboligase  52.15 
 
 		 591 aa  609  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1815  glyoxylate carboligase  52.32 
 
 		 591 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08150  glyoxylate carboligase  54.25 
 
 		 603 aa  609  1e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1901  glyoxylate carboligase  52.21 
 
 		 591 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000229041 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0458  glyoxylate carboligase  51.63 
 
 		 594 aa  607  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258476  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1157  glyoxylate carboligase  53.37 
 
 		 594 aa  608  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1787  glyoxylate carboligase  52.15 
 
 		 591 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4308  glyoxylate carboligase  52.32 
 
 		 594 aa  606  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0403052 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2769  glyoxylate carboligase  52.67 
 
 		 591 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155295  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2612  glyoxylate carboligase  53.47 
 
 		 592 aa  606  9.999999999999999e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6201  glyoxylate carboligase  52.5 
 
 		 591 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0309842  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1878  glyoxylate carboligase  52.5 
 
 		 591 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232165  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3829  glyoxylate carboligase  52.32 
 
 		 591 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2117  glyoxylate carboligase  52.5 
 
 		 596 aa  605  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226819 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2460  glyoxylate carboligase  52.26 
 
 		 591 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.583136  normal  0.435829 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1782  glyoxylate carboligase  52.43 
 
 		 591 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.538882  normal  0.818313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45000  glyoxylate carboligase  52.32 
 
 		 591 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3087  glyoxylate carboligase  52.78 
 
 		 591 aa  601  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2312  glyoxylate carboligase  52.78 
 
 		 591 aa  601  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1620  glyoxylate carboligase  51.91 
 
 		 591 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44538  normal  0.510397 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4561  glyoxylate carboligase  52.17 
 
 		 598 aa  596  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.437986 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00457  glyoxylate carboligase  51.11 
 
 		 593 aa  589  1e-167  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.50477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3105  glyoxylate carboligase  51.11 
 
 		 593 aa  589  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0608  glyoxylate carboligase  51.11 
 
 		 593 aa  589  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0571  glyoxylate carboligase  51.03 
 
 		 593 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0564  glyoxylate carboligase  51.03 
 
 		 593 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0581  glyoxylate carboligase  51.11 
 
 		 593 aa  591  1e-167  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3115  glyoxylate carboligase  51.11 
 
 		 593 aa  589  1e-167  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0441  glyoxylate carboligase  51.11 
 
 		 593 aa  588  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0206883  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0625  glyoxylate carboligase  51.03 
 
 		 593 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.610949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0544  glyoxylate carboligase  51.11 
 
 		 593 aa  588  1e-167  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3691  glyoxylate carboligase  51.39 
 
 		 592 aa  591  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0566  glyoxylate carboligase  51.03 
 
 		 593 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00462  hypothetical protein  51.11 
 
 		 593 aa  589  1e-167  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.711449  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1135  glyoxylate carboligase  51.3 
 
 		 596 aa  587  1e-166  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0550  glyoxylate carboligase  51.11 
 
 		 593 aa  587  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3438  glyoxylate carboligase  49.83 
 
 		 596 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0244  glyoxylate carboligase  51.79 
 
 		 601 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4866  glyoxylate carboligase  50.77 
 
 		 579 aa  568  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.553307 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43400  glyoxylate carboligase  52.16 
 
 		 567 aa  531  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  40.25 
 
 		 557 aa  403  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  39.86 
 
 		 588 aa  385  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  37.71 
 
 		 599 aa  381  1e-104  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  40 
 
 		 567 aa  379  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1175  Acetolactate synthase  38.67 
 
 		 591 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.112778  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  39.82 
 
 		 552 aa  375  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  39.21 
 
 		 563 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.48 
 
 		 554 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  39.3 
 
 		 557 aa  374  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  38.56 
 
 		 582 aa  371  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  37.2 
 
 		 563 aa  371  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  39.57 
 
 		 636 aa  370  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.68 
 
 		 559 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  36.74 
 
 		 587 aa  365  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.7 
 
 		 566 aa  368  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  37.1 
 
 		 587 aa  368  1e-100  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  38.69 
 
 		 566 aa  366  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  38.02 
 
 		 562 aa  366  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.66 
 
 		 569 aa  365  1e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  36.88 
 
 		 587 aa  365  1e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  38.77 
 
 		 562 aa  365  1e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  38.34 
 
 		 561 aa  365  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.39 
 
 		 566 aa  365  2e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.63 
 
 		 554 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  38.34 
 
 		 556 aa  364  3e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  37.8 
 
 		 555 aa  363  5.0000000000000005e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  36.38 
 
 		 587 aa  363  6e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.73 
 
 		 555 aa  362  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2270  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  38.27 
 
 		 576 aa  361  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  38.18 
 
 		 566 aa  360  3e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.32 
 
 		 557 aa  360  3e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.82 
 
 		 566 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1978  acetolactate synthase, large subunit  38.56 
 
 		 568 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.68 
 
 		 561 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  39.04 
 
 		 562 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  37.23 
 
 		 623 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  38.56 
 
 		 553 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>