More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3281 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_08150  glyoxylate carboligase  67.25 
 
 		 603 aa  791    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00457  glyoxylate carboligase  75.76 
 
 		 593 aa  941    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.50477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3105  glyoxylate carboligase  75.76 
 
 		 593 aa  941    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3087  glyoxylate carboligase  74.57 
 
 		 591 aa  904    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2299  glyoxylate carboligase  80.2 
 
 		 591 aa  970    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408845  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0571  glyoxylate carboligase  76.99 
 
 		 593 aa  941    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4297  glyoxylate carboligase  75.61 
 
 		 591 aa  913    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3151  glyoxylate carboligase  92.76 
 
 		 595 aa  1137    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3281  glyoxylate carboligase  100 
 
 		 591 aa  1209    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.819791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3115  glyoxylate carboligase  75.76 
 
 		 593 aa  941    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1157  glyoxylate carboligase  75 
 
 		 594 aa  898    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1135  glyoxylate carboligase  74.2 
 
 		 596 aa  872    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43400  glyoxylate carboligase  75.63 
 
 		 567 aa  807    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3862  glyoxylate carboligase  75.78 
 
 		 591 aa  912    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.985049  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1396  glyoxylate carboligase  79.02 
 
 		 591 aa  963    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1299  glyoxylate carboligase  79.09 
 
 		 591 aa  946    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3291  glyoxylate carboligase  87.2 
 
 		 594 aa  1068    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3829  glyoxylate carboligase  77.35 
 
 		 591 aa  924    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3438  glyoxylate carboligase  68.69 
 
 		 596 aa  833    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2367  glyoxylate carboligase  75.13 
 
 		 591 aa  893    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2424  glyoxylate carboligase  80.2 
 
 		 591 aa  970    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1598  glyoxylate carboligase  76.48 
 
 		 591 aa  921    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035378  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2259  glyoxylate carboligase  80.03 
 
 		 591 aa  969    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.712116  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2769  glyoxylate carboligase  76.48 
 
 		 591 aa  916    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155295  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0566  glyoxylate carboligase  77.16 
 
 		 593 aa  942    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5178  glyoxylate carboligase  78.51 
 
 		 591 aa  961    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00462  hypothetical protein  75.76 
 
 		 593 aa  941    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.711449  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0441  glyoxylate carboligase  76.82 
 
 		 593 aa  940    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0206883  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1782  glyoxylate carboligase  77.35 
 
 		 591 aa  944    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.538882  normal  0.818313 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4308  glyoxylate carboligase  76.22 
 
 		 594 aa  902    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0403052 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2173  glyoxylate carboligase  79.53 
 
 		 591 aa  965    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52322  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4561  glyoxylate carboligase  74.12 
 
 		 598 aa  875    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2460  glyoxylate carboligase  77 
 
 		 591 aa  938    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.583136  normal  0.435829 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3448  glyoxylate carboligase  87.84 
 
 		 596 aa  1080    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2612  glyoxylate carboligase  76.13 
 
 		 592 aa  924    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6201  glyoxylate carboligase  79.36 
 
 		 591 aa  967    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0309842  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1787  glyoxylate carboligase  79.27 
 
 		 591 aa  953    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1620  glyoxylate carboligase  78.4 
 
 		 591 aa  947    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44538  normal  0.510397 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0625  glyoxylate carboligase  77.16 
 
 		 593 aa  942    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.610949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1815  glyoxylate carboligase  79.44 
 
 		 591 aa  954    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45000  glyoxylate carboligase  77.35 
 
 		 591 aa  924    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0458  glyoxylate carboligase  73.61 
 
 		 594 aa  879    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258476  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3691  glyoxylate carboligase  70.38 
 
 		 592 aa  855    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1878  glyoxylate carboligase  79.36 
 
 		 591 aa  967    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232165  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0608  glyoxylate carboligase  75.76 
 
 		 593 aa  941    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0550  glyoxylate carboligase  75.25 
 
 		 593 aa  936    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1572  glyoxylate carboligase  75.44 
 
 		 591 aa  908    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0611133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4866  glyoxylate carboligase  69.43 
 
 		 579 aa  841    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.553307 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0244  glyoxylate carboligase  71.87 
 
 		 601 aa  855    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1901  glyoxylate carboligase  79.19 
 
 		 591 aa  964    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000229041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3622  glyoxylate carboligase  75.96 
 
 		 591 aa  910    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3478  glyoxylate carboligase  94.07 
 
 		 591 aa  1153    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0581  glyoxylate carboligase  75.76 
 
 		 593 aa  941    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3954  glyoxylate carboligase  77.68 
 
 		 597 aa  937    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416682  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2117  glyoxylate carboligase  76.68 
 
 		 596 aa  920    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226819 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2312  glyoxylate carboligase  76.66 
 
 		 591 aa  914    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0564  glyoxylate carboligase  76.99 
 
 		 593 aa  941    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0544  glyoxylate carboligase  75.59 
 
 		 593 aa  938    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3455  glyoxylate carboligase  53.57 
 
 		 577 aa  615  1e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2548  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  54.59 
 
 		 570 aa  605  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.122041 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2853  glyoxylate carboligase  52.78 
 
 		 583 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0172907  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0723  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  52.94 
 
 		 571 aa  578  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4728  glyoxylate carboligase  52.23 
 
 		 572 aa  564  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1175  Acetolactate synthase  34.55 
 
 		 591 aa  352  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.112778  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  36.01 
 
 		 588 aa  349  7e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.04 
 
 		 569 aa  347  3e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.73 
 
 		 552 aa  347  3e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.07 
 
 		 553 aa  345  2e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4449  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.25 
 
 		 570 aa  343  4e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2122  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  36.98 
 
 		 625 aa  342  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.1 
 
 		 554 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13018  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  36.67 
 
 		 618 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0170383  normal  0.298126 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  36.22 
 
 		 602 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  35.39 
 
 		 572 aa  338  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  36.4 
 
 		 619 aa  339  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  35.83 
 
 		 587 aa  339  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  35.62 
 
 		 557 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  35.32 
 
 		 563 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4239  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  37.21 
 
 		 620 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.302024 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  36.94 
 
 		 612 aa  337  5e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.46 
 
 		 566 aa  337  5e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  34.15 
 
 		 575 aa  335  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.32 
 
 		 559 aa  335  2e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  34.15 
 
 		 575 aa  335  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  38.73 
 
 		 555 aa  334  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2932  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  34.15 
 
 		 593 aa  334  3e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.35 
 
 		 557 aa  333  4e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.81 
 
 		 636 aa  333  5e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1886  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  35.74 
 
 		 619 aa  332  8e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0490387  normal  0.105007 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1906  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  35.74 
 
 		 619 aa  332  8e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365234  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2018  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.51 
 
 		 573 aa  333  8e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.801766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1952  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  35.74 
 
 		 619 aa  332  8e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1335  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  38.38 
 
 		 611 aa  332  1e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.552773 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  36.72 
 
 		 578 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  37.45 
 
 		 577 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  34.42 
 
 		 566 aa  330  4e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2821  acetolactate synthase large subunit  35.78 
 
 		 581 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.32 
 
 		 554 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2420  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.33 
 
 		 586 aa  328  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4126  acetolactate synthase large subunit  35.14 
 
 		 638 aa  328  2.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>