More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3105 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0608  glyoxylate carboligase  100 
 
 		 593 aa  1226    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00457  glyoxylate carboligase  100 
 
 		 593 aa  1226    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.50477  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3105  glyoxylate carboligase  100 
 
 		 593 aa  1226    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3829  glyoxylate carboligase  74.41 
 
 		 591 aa  936    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3954  glyoxylate carboligase  75.04 
 
 		 597 aa  929    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416682  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4297  glyoxylate carboligase  74.75 
 
 		 591 aa  943    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3281  glyoxylate carboligase  75.76 
 
 		 591 aa  941    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.819791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3115  glyoxylate carboligase  100 
 
 		 593 aa  1226    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2769  glyoxylate carboligase  74.75 
 
 		 591 aa  947    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155295  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1135  glyoxylate carboligase  74.2 
 
 		 596 aa  879    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1396  glyoxylate carboligase  78.64 
 
 		 591 aa  982    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1620  glyoxylate carboligase  77.97 
 
 		 591 aa  973    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.44538  normal  0.510397 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0458  glyoxylate carboligase  73.42 
 
 		 594 aa  906    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258476  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3862  glyoxylate carboligase  74.58 
 
 		 591 aa  939    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.985049  normal  0.531415 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4866  glyoxylate carboligase  69.55 
 
 		 579 aa  864    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.553307 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0571  glyoxylate carboligase  96.63 
 
 		 593 aa  1193    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0625  glyoxylate carboligase  96.46 
 
 		 593 aa  1191    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.610949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2299  glyoxylate carboligase  78.98 
 
 		 591 aa  980    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.408845  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3291  glyoxylate carboligase  79.41 
 
 		 594 aa  961    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1901  glyoxylate carboligase  79.32 
 
 		 591 aa  979    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000229041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3622  glyoxylate carboligase  74.92 
 
 		 591 aa  941    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0544  glyoxylate carboligase  99.49 
 
 		 593 aa  1221    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2424  glyoxylate carboligase  78.98 
 
 		 591 aa  980    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1598  glyoxylate carboligase  73.9 
 
 		 591 aa  947    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.035378  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43400  glyoxylate carboligase  74.81 
 
 		 567 aa  828    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5178  glyoxylate carboligase  79.66 
 
 		 591 aa  985    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.191483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0566  glyoxylate carboligase  96.29 
 
 		 593 aa  1190    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1787  glyoxylate carboligase  79.15 
 
 		 591 aa  979    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2173  glyoxylate carboligase  78.81 
 
 		 591 aa  976    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52322  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2312  glyoxylate carboligase  75.38 
 
 		 591 aa  932    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.276153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1299  glyoxylate carboligase  79.15 
 
 		 591 aa  978    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4561  glyoxylate carboligase  75 
 
 		 598 aa  890    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.437986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2460  glyoxylate carboligase  77.29 
 
 		 591 aa  963    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.583136  normal  0.435829 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3448  glyoxylate carboligase  79.58 
 
 		 596 aa  964    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2612  glyoxylate carboligase  74.45 
 
 		 592 aa  937    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6201  glyoxylate carboligase  79.49 
 
 		 591 aa  981    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0309842  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0581  glyoxylate carboligase  99.66 
 
 		 593 aa  1223    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1572  glyoxylate carboligase  74.58 
 
 		 591 aa  939    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0611133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3151  glyoxylate carboligase  77.66 
 
 		 595 aa  957    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1782  glyoxylate carboligase  77.12 
 
 		 591 aa  964    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.538882  normal  0.818313 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1815  glyoxylate carboligase  79.32 
 
 		 591 aa  981    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45000  glyoxylate carboligase  74.41 
 
 		 591 aa  936    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4308  glyoxylate carboligase  74.96 
 
 		 594 aa  922    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0403052 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3478  glyoxylate carboligase  78.2 
 
 		 591 aa  965    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3691  glyoxylate carboligase  72.25 
 
 		 592 aa  904    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1878  glyoxylate carboligase  79.49 
 
 		 591 aa  981    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232165  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1157  glyoxylate carboligase  73.86 
 
 		 594 aa  917    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0441  glyoxylate carboligase  99.83 
 
 		 593 aa  1224    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0206883  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0564  glyoxylate carboligase  96.63 
 
 		 593 aa  1193    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3438  glyoxylate carboligase  72.5 
 
 		 596 aa  900    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0550  glyoxylate carboligase  99.16 
 
 		 593 aa  1217    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2117  glyoxylate carboligase  75.29 
 
 		 596 aa  941    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226819 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00462  hypothetical protein  100 
 
 		 593 aa  1226    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.711449  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08150  glyoxylate carboligase  70.09 
 
 		 603 aa  851    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3087  glyoxylate carboligase  74.41 
 
 		 591 aa  928    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0244  glyoxylate carboligase  72.95 
 
 		 601 aa  898    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2259  glyoxylate carboligase  79.15 
 
 		 591 aa  981    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.712116  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2367  glyoxylate carboligase  74.05 
 
 		 591 aa  891    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3455  glyoxylate carboligase  50.35 
 
 		 577 aa  587  1e-166  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2548  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain-containing protein  51.46 
 
 		 570 aa  585  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271153  normal  0.122041 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2853  glyoxylate carboligase  51.11 
 
 		 583 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0172907  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0723  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  48.97 
 
 		 571 aa  556  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4728  glyoxylate carboligase  49.06 
 
 		 572 aa  546  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1175  Acetolactate synthase  35.98 
 
 		 591 aa  376  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.112778  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.1 
 
 		 569 aa  364  3e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  36.95 
 
 		 588 aa  364  3e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4449  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.93 
 
 		 570 aa  357  2.9999999999999997e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  38.36 
 
 		 552 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  36.6 
 
 		 563 aa  356  5.999999999999999e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.23 
 
 		 554 aa  353  7e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  37.46 
 
 		 557 aa  351  3e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.1 
 
 		 557 aa  350  3e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.28 
 
 		 553 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13018  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  36.45 
 
 		 618 aa  345  1e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0170383  normal  0.298126 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2821  acetolactate synthase large subunit  35.4 
 
 		 581 aa  345  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.52 
 
 		 554 aa  345  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.61 
 
 		 563 aa  343  5e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2982  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.51 
 
 		 572 aa  342  8e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000024883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3024  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.51 
 
 		 572 aa  342  8e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000501065  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2122  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  36.69 
 
 		 625 aa  342  9e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522117  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.1 
 
 		 566 aa  342  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  34.49 
 
 		 587 aa  341  2e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0105  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.73 
 
 		 568 aa  341  2.9999999999999998e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180923  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.83 
 
 		 558 aa  340  4e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3554  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.51 
 
 		 581 aa  339  7e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.743835  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1886  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  35.11 
 
 		 619 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0490387  normal  0.105007 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1335  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  36.81 
 
 		 611 aa  338  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.552773 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2864  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.96 
 
 		 659 aa  338  9.999999999999999e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1906  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  35.11 
 
 		 619 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365234  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  35.55 
 
 		 587 aa  338  9.999999999999999e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1952  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  35.11 
 
 		 619 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.56 
 
 		 559 aa  339  9.999999999999999e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3230  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.67 
 
 		 644 aa  338  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  34.05 
 
 		 587 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1557  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.01 
 
 		 581 aa  337  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1968  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.19 
 
 		 581 aa  337  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.697399  normal  0.245648 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4073  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.05 
 
 		 623 aa  337  5e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24876  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4239  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  36.92 
 
 		 620 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.302024 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  35.98 
 
 		 572 aa  336  7.999999999999999e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.86 
 
 		 562 aa  336  7.999999999999999e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>