More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4284 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1703  hypothetical protein  90.39 
 
 		 558 aa  967    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1693  hypothetical protein  79.85 
 
 		 541 aa  875    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3594  hypothetical protein  90.39 
 
 		 541 aa  980    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234761  normal  0.928094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4284  hypothetical protein  100 
 
 		 541 aa  1097    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2937  hypothetical protein  81.52 
 
 		 543 aa  889    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3590  hypothetical protein  51.85 
 
 		 541 aa  551  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.291615  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5385  hypothetical protein  51.65 
 
 		 542 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366398  normal  0.452356 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1689  hypothetical protein  50.09 
 
 		 547 aa  508  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4300  hypothetical protein  39.48 
 
 		 569 aa  339  8e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.48 
 
 		 552 aa  278  3e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0538  hypothetical protein  33.83 
 
 		 530 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0450  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  34.9 
 
 		 534 aa  266  7e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.3 
 
 		 553 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1092  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.62 
 
 		 600 aa  259  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.72 
 
 		 565 aa  258  2e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.33 
 
 		 582 aa  257  4e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.85 
 
 		 563 aa  257  5e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  34.62 
 
 		 599 aa  256  7e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.09 
 
 		 561 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.91 
 
 		 565 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4471  hypothetical protein  32.53 
 
 		 545 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.658207  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  32.14 
 
 		 566 aa  254  3e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.79 
 
 		 557 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.63 
 
 		 588 aa  253  6e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1170  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.22 
 
 		 583 aa  252  9.000000000000001e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.27 
 
 		 563 aa  252  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  33.75 
 
 		 587 aa  251  3e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  32.73 
 
 		 587 aa  251  3e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  32.91 
 
 		 587 aa  250  4e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.59 
 
 		 552 aa  250  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.62 
 
 		 555 aa  247  4e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2258  acetolactate synthase, large subunit  34.96 
 
 		 569 aa  247  4.9999999999999997e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.09 
 
 		 581 aa  246  6e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  31.69 
 
 		 587 aa  246  6e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  33.09 
 
 		 587 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.25 
 
 		 554 aa  246  9e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.01 
 
 		 569 aa  245  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.72 
 
 		 581 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2183  hypothetical protein  32.52 
 
 		 535 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.58 
 
 		 575 aa  244  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.58 
 
 		 575 aa  244  3.9999999999999997e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.66 
 
 		 574 aa  243  5e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.82 
 
 		 561 aa  243  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2932  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.58 
 
 		 593 aa  243  7e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  32.31 
 
 		 567 aa  243  7e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01970  acetolactate synthase, large subunit  32.68 
 
 		 622 aa  242  1e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00241919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.05 
 
 		 562 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.63 
 
 		 636 aa  241  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.89 
 
 		 566 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2840  hypothetical protein  33.52 
 
 		 545 aa  241  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  33.1 
 
 		 578 aa  240  4e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1921  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.95 
 
 		 576 aa  240  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.299558 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.67 
 
 		 556 aa  240  5e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.58 
 
 		 563 aa  239  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.41 
 
 		 573 aa  239  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2040  hypothetical protein  31.65 
 
 		 535 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  33.21 
 
 		 623 aa  238  2e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.7 
 
 		 558 aa  238  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62160  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.21 
 
 		 574 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.09482 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.99 
 
 		 566 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.41 
 
 		 571 aa  238  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  31.38 
 
 		 542 aa  237  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1428  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.37 
 
 		 564 aa  237  5.0000000000000005e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00100174  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.62 
 
 		 572 aa  236  6e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.6 
 
 		 572 aa  236  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.82 
 
 		 573 aa  236  9e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  31.07 
 
 		 572 aa  236  9e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.27 
 
 		 559 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001649  acetolactate synthase large subunit  30.04 
 
 		 574 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546971  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.21 
 
 		 573 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5410  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.85 
 
 		 574 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350466  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6128  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.2 
 
 		 579 aa  234  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1932  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  28.55 
 
 		 554 aa  234  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.98 
 
 		 593 aa  234  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.11 
 
 		 573 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46120  hypothetical protein  31.79 
 
 		 533 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624787  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.54 
 
 		 588 aa  233  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1795  hypothetical protein  31.8 
 
 		 544 aa  233  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.62 
 
 		 586 aa  232  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.51 
 
 		 570 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1165  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.41 
 
 		 561 aa  232  1e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.51 
 
 		 570 aa  232  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.51 
 
 		 570 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1934  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.47 
 
 		 571 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.51 
 
 		 570 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.08 
 
 		 584 aa  231  2e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  31.09 
 
 		 552 aa  231  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4449  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.88 
 
 		 570 aa  230  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.68 
 
 		 574 aa  231  4e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0554  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.25 
 
 		 547 aa  230  5e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00325179 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0527  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.81 
 
 		 608 aa  230  6e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.82 
 
 		 557 aa  230  6e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2757  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.11 
 
 		 632 aa  229  7e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.928665  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  31.24 
 
 		 566 aa  229  7e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2521  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  31.16 
 
 		 547 aa  229  7e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.948829  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.45 
 
 		 566 aa  229  8e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.84 
 
 		 566 aa  229  8e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.5 
 
 		 587 aa  229  8e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0526  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.92 
 
 		 587 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1707  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.2 
 
 		 571 aa  229  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>