More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6128 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2862  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  64.4 
 
 
564 aa  770    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1921  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.44 
 
 
576 aa  699    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.299558 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3419  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  68.74 
 
 
579 aa  874    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.130634  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  54.92 
 
 
588 aa  677    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6128  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  100 
 
 
579 aa  1200    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.04 
 
 
586 aa  677    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4449  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.64 
 
 
570 aa  550  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3108  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.74 
 
 
571 aa  530  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.11 
 
 
558 aa  524  1e-147  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.63 
 
 
555 aa  522  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.88 
 
 
569 aa  518  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.31 
 
 
559 aa  512  1e-144  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.85 
 
 
570 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.85 
 
 
570 aa  510  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.03 
 
 
570 aa  511  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.85 
 
 
570 aa  510  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.86 
 
 
563 aa  510  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0105  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.92 
 
 
568 aa  509  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180923  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.03 
 
 
566 aa  510  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  44.68 
 
 
566 aa  508  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0186  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  44.9 
 
 
576 aa  510  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.13 
 
 
569 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.469559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  46.68 
 
 
578 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  44.15 
 
 
566 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0752  acetolactate synthase, large subunit  46.95 
 
 
569 aa  506  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  45.06 
 
 
577 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  44.58 
 
 
566 aa  503  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_737  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.13 
 
 
569 aa  504  1e-141  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00716267  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  43.55 
 
 
566 aa  502  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.37 
 
 
563 aa  502  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  46.79 
 
 
567 aa  503  1e-141  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.44 
 
 
562 aa  502  1e-141  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.29 
 
 
563 aa  502  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  44.43 
 
 
565 aa  499  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2229  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.4 
 
 
579 aa  499  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0853  acetolactate synthase, large subunit  46.32 
 
 
573 aa  498  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.640805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.57 
 
 
557 aa  498  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.79 
 
 
558 aa  498  1e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  45.83 
 
 
566 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  45.39 
 
 
548 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1707  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.14 
 
 
571 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  43.9 
 
 
566 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.5 
 
 
573 aa  492  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.99 
 
 
593 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  43.63 
 
 
570 aa  490  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  45.55 
 
 
548 aa  491  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.15 
 
 
571 aa  491  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1966  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.64 
 
 
571 aa  491  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.107455  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  45.55 
 
 
548 aa  490  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  44.88 
 
 
562 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1717  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.54 
 
 
566 aa  486  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.589802  normal  0.264845 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1858  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.53 
 
 
582 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.667431  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1240  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.91 
 
 
580 aa  485  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2168  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.82 
 
 
573 aa  485  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0741  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.02 
 
 
573 aa  488  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05831  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.36 
 
 
587 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2037  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.22 
 
 
564 aa  482  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182642  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.1 
 
 
588 aa  482  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  42.76 
 
 
563 aa  483  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1557  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.58 
 
 
581 aa  485  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  44.3 
 
 
548 aa  482  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.42 
 
 
552 aa  485  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0898  acetolactate synthase, large subunit  44.33 
 
 
564 aa  484  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1968  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.38 
 
 
581 aa  484  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.697399  normal  0.245648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.81 
 
 
558 aa  479  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1905  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  44.96 
 
 
573 aa  480  1e-134  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.74 
 
 
574 aa  481  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.56 
 
 
612 aa  481  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.66 
 
 
563 aa  479  1e-134  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  44.36 
 
 
562 aa  481  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  43.91 
 
 
553 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  42.96 
 
 
564 aa  481  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.87 
 
 
570 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1909  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  44.72 
 
 
561 aa  481  1e-134  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000425472  hitchhiker  0.0000717525 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1517  acetolactate synthase catalytic subunit  44.73 
 
 
566 aa  477  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1934  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  43.44 
 
 
571 aa  478  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1556  acetolactate synthase catalytic subunit  44.91 
 
 
566 aa  478  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1281  acetolactate synthase catalytic subunit  44.73 
 
 
569 aa  476  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1282  acetolactate synthase catalytic subunit  44.73 
 
 
566 aa  476  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4126  acetolactate synthase large subunit  45.15 
 
 
638 aa  476  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18810  acetolactate synthase, large subunit  43.52 
 
 
585 aa  477  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.740593  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2757  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.04 
 
 
632 aa  476  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.928665  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1488  acetolactate synthase catalytic subunit  44.91 
 
 
569 aa  477  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  44.23 
 
 
562 aa  475  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1417  acetolactate synthase catalytic subunit  44.73 
 
 
566 aa  475  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  44.42 
 
 
554 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  44.17 
 
 
561 aa  475  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2145  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.7 
 
 
562 aa  476  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000794715  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2558  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  42.06 
 
 
566 aa  477  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0505809  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1308  acetolactate synthase catalytic subunit  44.73 
 
 
578 aa  475  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.26 
 
 
557 aa  474  1e-132  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4111  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  43.87 
 
 
548 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2256  acetolactate synthase, large subunit  44.31 
 
 
560 aa  473  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4126  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  43.87 
 
 
548 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1978  acetolactate synthase, large subunit  46.21 
 
 
568 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0892  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  42.66 
 
 
581 aa  472  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.806334  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0736  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  44.97 
 
 
597 aa  473  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.591869  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0745  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  42.66 
 
 
581 aa  472  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.425404  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4232  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  43.87 
 
 
548 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1319  acetolactate synthase catalytic subunit  44.46 
 
 
566 aa  473  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>