More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4032 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1108  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  56.15 
 
 		 583 aa  643    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03646  acetolactate synthase II, valine insensitive, large subunit  80.04 
 
 		 548 aa  919    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0646243  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0442  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  63.7 
 
 		 562 aa  744    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4843  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  63.58 
 
 		 521 aa  698    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4347  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.42 
 
 		 552 aa  711    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4128  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  65.69 
 
 		 557 aa  722    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  56.15 
 
 		 583 aa  642    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  80.22 
 
 		 548 aa  923    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4111  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  79.67 
 
 		 548 aa  921    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4234  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  80.04 
 
 		 548 aa  922    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.194744  normal  0.310929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0345  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.36 
 
 		 569 aa  747    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0918871  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03595  hypothetical protein  80.04 
 
 		 548 aa  919    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0633614  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4061  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  82.23 
 
 		 548 aa  910    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4279  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  79.85 
 
 		 548 aa  920    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4232  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  79.67 
 
 		 548 aa  922    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4165  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  63.5 
 
 		 557 aa  743    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  97.45 
 
 		 548 aa  1102    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4009  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  65.33 
 
 		 557 aa  719    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02606  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  59.2 
 
 		 573 aa  637    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3985  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  80.04 
 
 		 548 aa  922    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  85.58 
 
 		 548 aa  984    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4183  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  79.49 
 
 		 548 aa  918    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.224573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3414  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  65.15 
 
 		 557 aa  719    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3329  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  58.41 
 
 		 578 aa  647    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0154  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  82.23 
 
 		 548 aa  911    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0147  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  62.64 
 
 		 558 aa  715    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0362  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.6 
 
 		 557 aa  716    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3664  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  65.15 
 
 		 551 aa  723    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0422  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  63.41 
 
 		 555 aa  711    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0482  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  82.23 
 
 		 548 aa  911    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267774 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4015  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  78.02 
 
 		 548 aa  909    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565502 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0356  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.6 
 
 		 557 aa  716    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4291  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  79.49 
 
 		 548 aa  920    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4126  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  79.85 
 
 		 548 aa  924    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  100 
 
 		 548 aa  1125    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3934  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  65.69 
 
 		 557 aa  722    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  84.67 
 
 		 548 aa  973    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3281  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.05 
 
 		 556 aa  714    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4760  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  82.42 
 
 		 548 aa  937    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0348  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  68.41 
 
 		 548 aa  751    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00410  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  65.28 
 
 		 548 aa  734    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4134  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  79.3 
 
 		 548 aa  918    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.82212  normal  0.957886 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4152  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  80.04 
 
 		 548 aa  922    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3614  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  65.88 
 
 		 557 aa  712    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4031  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  65.51 
 
 		 557 aa  719    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0289  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.23 
 
 		 557 aa  722    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2488  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  65.94 
 
 		 548 aa  738    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.818345  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0289  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  53.56 
 
 		 572 aa  594  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.403033  normal  0.363537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2114  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  53.51 
 
 		 565 aa  589  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.09 
 
 		 569 aa  553  1e-156  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.01 
 
 		 555 aa  548  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.53 
 
 		 636 aa  546  1e-154  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002041  acetolactate synthase large subunit  62 
 
 		 421 aa  543  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  48.92 
 
 		 577 aa  545  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.66 
 
 		 554 aa  544  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.13 
 
 		 573 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.95 
 
 		 571 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.66 
 
 		 570 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.48 
 
 		 570 aa  535  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.66 
 
 		 570 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.1 
 
 		 570 aa  536  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.94 
 
 		 588 aa  536  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.66 
 
 		 570 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.81 
 
 		 555 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.2 
 
 		 558 aa  535  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  47.93 
 
 		 578 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  48.11 
 
 		 562 aa  533  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1707  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.19 
 
 		 571 aa  535  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1934  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.41 
 
 		 571 aa  530  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.52 
 
 		 566 aa  530  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.33 
 
 		 559 aa  528  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.75 
 
 		 553 aa  529  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1966  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.85 
 
 		 571 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.107455  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  47.48 
 
 		 567 aa  530  1e-149  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.48 
 
 		 563 aa  529  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.17 
 
 		 566 aa  525  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  49.64 
 
 		 574 aa  526  1e-148  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.82 
 
 		 552 aa  526  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.2 
 
 		 554 aa  526  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.8 
 
 		 586 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  50.98 
 
 		 593 aa  527  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.04 
 
 		 558 aa  523  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2229  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.91 
 
 		 579 aa  524  1e-147  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.23 
 
 		 563 aa  525  1e-147  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.86 
 
 		 569 aa  519  1e-146  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1858  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.4 
 
 		 582 aa  521  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.667431  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.27 
 
 		 581 aa  519  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  45.94 
 
 		 566 aa  518  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.7 
 
 		 565 aa  518  1e-146  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2258  acetolactate synthase, large subunit  48.37 
 
 		 569 aa  519  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.63 
 
 		 566 aa  521  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.28 
 
 		 556 aa  521  1e-146  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.27 
 
 		 581 aa  519  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05831  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.06 
 
 		 587 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.65 
 
 		 558 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.64 
 
 		 565 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1900  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.32 
 
 		 568 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5448  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.74 
 
 		 592 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404549  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1985  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.15 
 
 		 568 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5349  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.05 
 
 		 591 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>