More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3329 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03646  acetolactate synthase II, valine insensitive, large subunit  58.15 
 
 
548 aa  653    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0646243  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3329  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  100 
 
 
578 aa  1168    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4134  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  57.43 
 
 
548 aa  654    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.82212  normal  0.957886 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  59.28 
 
 
548 aa  668    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4111  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  57.61 
 
 
548 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  77.57 
 
 
583 aa  906    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4183  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  57.94 
 
 
548 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.224573  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0345  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  56.99 
 
 
569 aa  635    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0918871  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4234  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  57.97 
 
 
548 aa  656    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.194744  normal  0.310929 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  58.95 
 
 
548 aa  676    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02606  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  80.97 
 
 
573 aa  900    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03595  hypothetical protein  58.15 
 
 
548 aa  653    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0633614  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4232  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  57.61 
 
 
548 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4279  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  57.79 
 
 
548 aa  652    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  57.97 
 
 
548 aa  656    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4760  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  59.6 
 
 
548 aa  649    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1108  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  77.74 
 
 
583 aa  908    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4126  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  57.61 
 
 
548 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  58.38 
 
 
548 aa  664    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4152  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  57.79 
 
 
548 aa  654    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  58.59 
 
 
548 aa  667    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4291  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  57.43 
 
 
548 aa  661    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4015  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  57.79 
 
 
548 aa  657    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565502 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3985  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  57.97 
 
 
548 aa  656    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0154  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  57.61 
 
 
548 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0482  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  57.61 
 
 
548 aa  615  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.267774 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4061  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  57.61 
 
 
548 aa  613  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3414  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  57.79 
 
 
557 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0348  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  55.14 
 
 
548 aa  605  9.999999999999999e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4165  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  54.41 
 
 
557 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0289  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  56.26 
 
 
572 aa  603  1.0000000000000001e-171  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.403033  normal  0.363537 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4843  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  55.28 
 
 
521 aa  601  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0442  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  54.26 
 
 
562 aa  600  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0362  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  55.9 
 
 
557 aa  601  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3664  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  56.34 
 
 
551 aa  601  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0356  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  55.9 
 
 
557 aa  600  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3281  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  56.99 
 
 
556 aa  598  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2114  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  53.98 
 
 
565 aa  600  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4347  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  56.14 
 
 
552 aa  597  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4128  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  55.98 
 
 
557 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4009  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  55.62 
 
 
557 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3934  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  55.98 
 
 
557 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4031  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  55.8 
 
 
557 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3614  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  56.16 
 
 
557 aa  593  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0147  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  52.58 
 
 
558 aa  592  1e-168  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0422  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  55.35 
 
 
555 aa  590  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0289  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  55.15 
 
 
557 aa  588  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2488  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  53.6 
 
 
548 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.818345  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00410  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  54.04 
 
 
548 aa  581  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.82 
 
 
569 aa  549  1e-155  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.47 
 
 
555 aa  542  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.64 
 
 
565 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.08 
 
 
588 aa  532  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.1 
 
 
558 aa  532  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.12 
 
 
566 aa  528  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.57 
 
 
570 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.39 
 
 
570 aa  526  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.57 
 
 
570 aa  526  1e-148  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.66 
 
 
559 aa  528  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  46.87 
 
 
562 aa  525  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.57 
 
 
570 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3813  acetolactate synthase catalytic subunit  48.92 
 
 
554 aa  525  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  48.92 
 
 
554 aa  523  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  50.27 
 
 
574 aa  523  1e-147  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.07 
 
 
555 aa  522  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.31 
 
 
554 aa  524  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  50 
 
 
593 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.78 
 
 
566 aa  521  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.59 
 
 
566 aa  521  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  48.19 
 
 
567 aa  520  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.94 
 
 
564 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2229  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.33 
 
 
579 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.65 
 
 
573 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.71 
 
 
566 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1707  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.42 
 
 
571 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.65 
 
 
571 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.93 
 
 
636 aa  513  1e-144  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.18 
 
 
566 aa  513  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.46 
 
 
558 aa  514  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1858  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.74 
 
 
582 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.667431  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1642  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  49.2 
 
 
618 aa  514  1e-144  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132379  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  46.92 
 
 
562 aa  513  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.74 
 
 
563 aa  514  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05831  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.74 
 
 
587 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.85 
 
 
553 aa  510  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4006  acetolactate synthase catalytic subunit  46.02 
 
 
562 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277464  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  47.29 
 
 
554 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.13 
 
 
570 aa  511  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4077  acetolactate synthase catalytic subunit  46.02 
 
 
562 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1966  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.93 
 
 
571 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.107455  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  45.07 
 
 
577 aa  509  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.04 
 
 
562 aa  510  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.64 
 
 
563 aa  509  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.38 
 
 
552 aa  508  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0898  acetolactate synthase, large subunit  45.62 
 
 
564 aa  510  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4127  acetolactate synthase catalytic subunit  46.02 
 
 
562 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4022  acetolactate synthase catalytic subunit  46.02 
 
 
562 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.35 
 
 
561 aa  510  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.56 
 
 
586 aa  509  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4185  acetolactate synthase catalytic subunit  46.02 
 
 
562 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>