More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0339 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0339  hypothetical protein  100 
 
 		 576 aa  1152    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4471  hypothetical protein  59.93 
 
 		 545 aa  615  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.658207  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1394  hypothetical protein  60.36 
 
 		 545 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4418  hypothetical protein  60.11 
 
 		 545 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4329  hypothetical protein  60.36 
 
 		 545 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1035  hypothetical protein  59.46 
 
 		 545 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.516106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6721  hypothetical protein  65.18 
 
 		 564 aa  591  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46120  hypothetical protein  59.02 
 
 		 533 aa  581  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624787  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1795  hypothetical protein  58.97 
 
 		 544 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3922  hypothetical protein  58.97 
 
 		 533 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13227  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2840  hypothetical protein  54.43 
 
 		 545 aa  523  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1549  hypothetical protein  49.56 
 
 		 580 aa  524  1e-147  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0538  hypothetical protein  53.75 
 
 		 530 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0749  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  52.54 
 
 		 546 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0179  hypothetical protein  48.44 
 
 		 537 aa  450  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2183  hypothetical protein  48.79 
 
 		 535 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2040  hypothetical protein  49.63 
 
 		 535 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5710  hypothetical protein  49.72 
 
 		 536 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3820  hypothetical protein  45.42 
 
 		 522 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366241  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65795  hypothetical protein  48.88 
 
 		 559 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000547463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3213  hypothetical protein  42.83 
 
 		 523 aa  361  2e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1932  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.57 
 
 		 554 aa  310  4e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4034  thiamine pyrophosphate protein central region  40.84 
 
 		 541 aa  307  4.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.350713  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0450  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  40.11 
 
 		 534 aa  306  8.000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1583  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  43.45 
 
 		 536 aa  295  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.37341 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2951  thiamine pyrophosphate protein central region  40.44 
 
 		 536 aa  273  9e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103515  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  32.86 
 
 		 578 aa  244  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  32.08 
 
 		 562 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1693  hypothetical protein  33.71 
 
 		 541 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4248  acetolactate synthase catalytic subunit  32.08 
 
 		 562 aa  239  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  33.21 
 
 		 562 aa  239  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4180  acetolactate synthase catalytic subunit  32.08 
 
 		 562 aa  239  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03555  acetolactate synthase large subunit  31.57 
 
 		 562 aa  237  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0032  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.57 
 
 		 562 aa  237  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03497  hypothetical protein  31.57 
 
 		 562 aa  237  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1689  hypothetical protein  35.32 
 
 		 547 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0028  acetolactate synthase catalytic subunit  31.57 
 
 		 562 aa  236  7e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3884  acetolactate synthase catalytic subunit  31.57 
 
 		 562 aa  236  7e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4038  acetolactate synthase catalytic subunit  31.91 
 
 		 562 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.725928  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  32.87 
 
 		 576 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4284  hypothetical protein  32.03 
 
 		 541 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  33.33 
 
 		 554 aa  232  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4006  acetolactate synthase catalytic subunit  31.86 
 
 		 562 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4127  acetolactate synthase catalytic subunit  31.86 
 
 		 562 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4077  acetolactate synthase catalytic subunit  31.86 
 
 		 562 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4185  acetolactate synthase catalytic subunit  31.86 
 
 		 562 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  31.01 
 
 		 566 aa  232  2e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.5 
 
 		 556 aa  232  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3813  acetolactate synthase catalytic subunit  33.81 
 
 		 554 aa  231  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.08 
 
 		 555 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4022  acetolactate synthase catalytic subunit  31.86 
 
 		 562 aa  232  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3594  hypothetical protein  33.15 
 
 		 541 aa  230  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234761  normal  0.928094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.24 
 
 		 566 aa  229  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  30.81 
 
 		 566 aa  228  3e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.93 
 
 		 552 aa  228  3e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2937  hypothetical protein  33.4 
 
 		 543 aa  228  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1703  hypothetical protein  30.87 
 
 		 558 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0634  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.44 
 
 		 567 aa  224  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.876407  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.86 
 
 		 569 aa  224  3e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.84 
 
 		 587 aa  224  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6021  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  31.1 
 
 		 611 aa  224  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  31.57 
 
 		 620 aa  224  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.45 
 
 		 558 aa  223  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30090  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  33.39 
 
 		 553 aa  223  6e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.492934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.45 
 
 		 566 aa  223  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.44 
 
 		 602 aa  223  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1717  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.02 
 
 		 566 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.589802  normal  0.264845 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.14 
 
 		 554 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2168  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.37 
 
 		 573 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1092  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.44 
 
 		 600 aa  222  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.25 
 
 		 588 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2757  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.95 
 
 		 632 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.928665  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1905  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  30.32 
 
 		 573 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3590  hypothetical protein  31.64 
 
 		 541 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.291615  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.13 
 
 		 557 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.62 
 
 		 574 aa  222  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.49 
 
 		 566 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.99 
 
 		 612 aa  219  7.999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  32.34 
 
 		 587 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.1 
 
 		 566 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0929  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.38 
 
 		 619 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0902  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.57 
 
 		 619 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7782  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  31.55 
 
 		 586 aa  217  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5385  hypothetical protein  31.75 
 
 		 542 aa  216  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366398  normal  0.452356 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.09 
 
 		 582 aa  216  7e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  29.65 
 
 		 562 aa  216  7e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0743  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.62 
 
 		 573 aa  216  8e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.597512 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0620  acetolactate synthase catalytic subunit  31.45 
 
 		 554 aa  216  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1123  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  31.42 
 
 		 629 aa  216  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4356  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  30.6 
 
 		 597 aa  216  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0195043  normal  0.165363 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  29.58 
 
 		 542 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.14 
 
 		 561 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  30.83 
 
 		 554 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.85 
 
 		 573 aa  214  3.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10680  acetolactate synthase, large subunit  31.59 
 
 		 626 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.141846 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4126  acetolactate synthase large subunit  30.93 
 
 		 638 aa  214  3.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.86 
 
 		 554 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0639  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.99 
 
 		 593 aa  214  4.9999999999999996e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0915985  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.98 
 
 		 557 aa  213  5.999999999999999e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0853  acetolactate synthase, large subunit  28.83 
 
 		 573 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.640805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>