More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3820 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3820  hypothetical protein  100 
 
 		 522 aa  1051    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366241  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0179  hypothetical protein  53.73 
 
 		 537 aa  535  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3213  hypothetical protein  49.11 
 
 		 523 aa  450  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4418  hypothetical protein  50.58 
 
 		 545 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1035  hypothetical protein  51.05 
 
 		 545 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.516106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1394  hypothetical protein  50.29 
 
 		 545 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4329  hypothetical protein  50.57 
 
 		 545 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4471  hypothetical protein  47.94 
 
 		 545 aa  442  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.658207  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0538  hypothetical protein  49.15 
 
 		 530 aa  443  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46120  hypothetical protein  48.95 
 
 		 533 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624787  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6721  hypothetical protein  50.58 
 
 		 564 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3922  hypothetical protein  49.33 
 
 		 533 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13227  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0749  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  49.9 
 
 		 546 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1795  hypothetical protein  49.7 
 
 		 544 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2840  hypothetical protein  48.24 
 
 		 545 aa  428  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1549  hypothetical protein  42.72 
 
 		 580 aa  425  1e-117  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0339  hypothetical protein  45.05 
 
 		 576 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2183  hypothetical protein  40.99 
 
 		 535 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2040  hypothetical protein  40.86 
 
 		 535 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5710  hypothetical protein  42.5 
 
 		 536 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65795  hypothetical protein  41.37 
 
 		 559 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000547463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1932  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.91 
 
 		 554 aa  269  8e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4034  thiamine pyrophosphate protein central region  38.3 
 
 		 541 aa  269  8e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.350713  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0450  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  36.98 
 
 		 534 aa  254  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2951  thiamine pyrophosphate protein central region  38.63 
 
 		 536 aa  251  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103515  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1583  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  38.78 
 
 		 536 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.37341 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1693  hypothetical protein  34.35 
 
 		 541 aa  236  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4284  hypothetical protein  33.21 
 
 		 541 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3087  thiamine pyrophosphate protein central region  34.05 
 
 		 564 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  31.93 
 
 		 578 aa  227  3e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2937  hypothetical protein  33.64 
 
 		 543 aa  227  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1703  hypothetical protein  32.59 
 
 		 558 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  31.86 
 
 		 566 aa  226  7e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  32.37 
 
 		 576 aa  225  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3594  hypothetical protein  34.39 
 
 		 541 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234761  normal  0.928094 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.91 
 
 		 573 aa  225  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00825  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.96 
 
 		 574 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001649  acetolactate synthase large subunit  33.58 
 
 		 574 aa  220  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.546971  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1689  hypothetical protein  34.87 
 
 		 547 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01970  acetolactate synthase, large subunit  31.59 
 
 		 622 aa  218  2.9999999999999998e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00241919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2059  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.72 
 
 		 573 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  32.31 
 
 		 623 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.93 
 
 		 563 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3605  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.03 
 
 		 572 aa  212  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30090  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  31.98 
 
 		 553 aa  212  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.492934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2270  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.89 
 
 		 576 aa  212  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  30.63 
 
 		 599 aa  211  3e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5039  acetolactate synthase large subunit  32.79 
 
 		 611 aa  209  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.818274  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1092  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.81 
 
 		 600 aa  209  8e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0596  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.66 
 
 		 573 aa  209  9e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.793346  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.78 
 
 		 558 aa  209  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0662  acetolactate synthase, large subunit  30.37 
 
 		 553 aa  208  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0231424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0968  thiamine pyrophosphate protein central region  31.65 
 
 		 563 aa  207  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.8 
 
 		 557 aa  207  4e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0294  putative pyruvate decarboxylase  31.17 
 
 		 590 aa  207  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3590  hypothetical protein  30.38 
 
 		 541 aa  207  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.291615  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  30.95 
 
 		 587 aa  206  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0852  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.34 
 
 		 552 aa  206  8e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.579609  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2932  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.43 
 
 		 593 aa  206  9e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.43 
 
 		 575 aa  206  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.43 
 
 		 575 aa  206  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.81 
 
 		 535 aa  206  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.9 
 
 		 572 aa  206  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3793  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.35 
 
 		 572 aa  204  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.98 
 
 		 573 aa  204  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1620  acetolactate synthase catalytic subunit  32.31 
 
 		 556 aa  202  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.546066  normal  0.5994 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3437  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.06 
 
 		 542 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00701573  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.54 
 
 		 573 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302703  decreased coverage  0.000148215 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.16 
 
 		 574 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2757  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.16 
 
 		 632 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.928665  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4300  hypothetical protein  32.14 
 
 		 569 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.422617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1628  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.28 
 
 		 572 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.13 
 
 		 587 aa  201  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.45 
 
 		 555 aa  201  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0634  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.38 
 
 		 573 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0171  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.96 
 
 		 586 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458212  normal  0.847135 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1020  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.63 
 
 		 565 aa  200  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2520  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  30.35 
 
 		 582 aa  200  5e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.78 
 
 		 612 aa  200  6e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.09 
 
 		 636 aa  199  7e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1613  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.25 
 
 		 558 aa  199  7e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0790  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.57 
 
 		 564 aa  199  9e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000243733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.35 
 
 		 552 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.27 
 
 		 556 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.5 
 
 		 584 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.084297 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00079  acetolactate synthase III large subunit  31.25 
 
 		 574 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00078  hypothetical protein  31.25 
 
 		 574 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.4 
 
 		 588 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.77 
 
 		 566 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0132  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.5 
 
 		 584 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6968  thiamine pyrophosphate protein central region  32.08 
 
 		 595 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0125  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.5 
 
 		 584 aa  198  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1519  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  32.08 
 
 		 595 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  30.13 
 
 		 562 aa  197  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6310  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 595 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.683934  normal  0.626612 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0127  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.5 
 
 		 584 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.53134  hitchhiker  0.000772873 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0128  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.5 
 
 		 584 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0083  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.25 
 
 		 574 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.630637  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.85 
 
 		 553 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0079  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.25 
 
 		 574 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>