More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0662 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0662  acetolactate synthase, large subunit  100 
 
 
553 aa  1124    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0231424  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1114  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  33.87 
 
 
562 aa  282  9e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3230  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.57 
 
 
644 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.99 
 
 
556 aa  274  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.33 
 
 
569 aa  271  2e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.38 
 
 
569 aa  271  2.9999999999999997e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.34 
 
 
554 aa  270  5e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.91 
 
 
554 aa  269  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.36 
 
 
563 aa  268  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.69 
 
 
619 aa  266  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.8 
 
 
555 aa  264  4e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.83 
 
 
552 aa  264  4e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1123  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  32.04 
 
 
629 aa  262  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  31.82 
 
 
542 aa  262  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2757  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.36 
 
 
632 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.928665  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  31.48 
 
 
562 aa  261  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.32 
 
 
553 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1233  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  31.87 
 
 
627 aa  259  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506  normal  0.463621 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4239  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  30.39 
 
 
620 aa  259  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.302024 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.39 
 
 
555 aa  258  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.91 
 
 
581 aa  258  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2122  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  30.34 
 
 
625 aa  258  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522117  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0105  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.65 
 
 
568 aa  258  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180923  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.32 
 
 
559 aa  257  4e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6021  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  32.91 
 
 
611 aa  257  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.91 
 
 
581 aa  257  4e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  32.37 
 
 
566 aa  256  7e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  32.22 
 
 
620 aa  256  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.08 
 
 
557 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2256  acetolactate synthase, large subunit  31.63 
 
 
560 aa  255  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0902  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.04 
 
 
619 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.55 
 
 
561 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0929  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.04 
 
 
619 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2864  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.63 
 
 
659 aa  254  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4073  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.57 
 
 
623 aa  254  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24876  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.51 
 
 
602 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1921  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.28 
 
 
576 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.299558 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.25 
 
 
573 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4126  acetolactate synthase large subunit  30.65 
 
 
638 aa  253  6e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.66 
 
 
612 aa  253  8.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1906  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  30.66 
 
 
619 aa  253  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365234  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1952  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  30.66 
 
 
619 aa  253  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338885  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1886  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  30.66 
 
 
619 aa  253  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0490387  normal  0.105007 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3746  acetolactate synthase, large subunit  31.87 
 
 
573 aa  252  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3554  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.5 
 
 
581 aa  252  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.743835  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.99 
 
 
582 aa  252  1e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.21 
 
 
587 aa  250  4e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  31.65 
 
 
587 aa  250  4e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32 
 
 
557 aa  250  5e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13018  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  31.46 
 
 
618 aa  250  5e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0170383  normal  0.298126 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3108  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.89 
 
 
571 aa  250  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  31.17 
 
 
587 aa  250  6e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0171  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.87 
 
 
586 aa  249  7e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458212  normal  0.847135 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  29.75 
 
 
567 aa  249  9e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3437  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.28 
 
 
542 aa  249  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00701573  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.81 
 
 
636 aa  249  1e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7782  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  32.9 
 
 
586 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.54 
 
 
558 aa  249  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1466  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.34 
 
 
617 aa  248  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0931966  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2539  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  31.78 
 
 
633 aa  248  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0377208  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2169  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.15 
 
 
575 aa  247  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.649258  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.43 
 
 
570 aa  247  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.43 
 
 
570 aa  247  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.43 
 
 
570 aa  247  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8059  acetolactate synthase, large subunit  32.21 
 
 
578 aa  247  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634605  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3392  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  31.03 
 
 
585 aa  247  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2229  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.75 
 
 
579 aa  247  4e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1934  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.14 
 
 
571 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.15 
 
 
562 aa  246  8e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.08 
 
 
574 aa  246  9e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.12 
 
 
569 aa  245  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.469559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.7 
 
 
571 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.25 
 
 
570 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  30.76 
 
 
587 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  29.46 
 
 
578 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2258  acetolactate synthase, large subunit  30.78 
 
 
569 aa  245  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2821  acetolactate synthase large subunit  31.56 
 
 
581 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3351  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.52 
 
 
601 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  30.49 
 
 
554 aa  244  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.02 
 
 
558 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.09 
 
 
570 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4356  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  30.51 
 
 
597 aa  244  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0195043  normal  0.165363 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0186  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.02 
 
 
576 aa  243  5e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.23 
 
 
556 aa  243  6e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1966  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.58 
 
 
571 aa  243  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.107455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.87 
 
 
557 aa  243  7.999999999999999e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_737  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.23 
 
 
569 aa  242  1e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00716267  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.59 
 
 
548 aa  242  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0620  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.79 
 
 
560 aa  242  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.635865  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0611  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  31.91 
 
 
589 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.175913  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1707  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.76 
 
 
571 aa  241  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.05 
 
 
561 aa  241  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  28.47 
 
 
577 aa  242  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.08 
 
 
588 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.98 
 
 
563 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  29.87 
 
 
587 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.26 
 
 
572 aa  240  4e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  28.83 
 
 
599 aa  240  5.999999999999999e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.42 
 
 
566 aa  240  5.999999999999999e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0752  acetolactate synthase, large subunit  28.88 
 
 
569 aa  239  5.999999999999999e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>