More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3624 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03555  acetolactate synthase large subunit  71.07 
 
 		 562 aa  815    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0032  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  71.07 
 
 		 562 aa  815    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1950  acetolactate synthase catalytic subunit  79.93 
 
 		 555 aa  915    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4038  acetolactate synthase catalytic subunit  70.71 
 
 		 562 aa  815    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.725928  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1839  acetolactate synthase catalytic subunit  79.93 
 
 		 555 aa  915    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1620  acetolactate synthase catalytic subunit  68.71 
 
 		 556 aa  775    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.546066  normal  0.5994 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4022  acetolactate synthase catalytic subunit  71.79 
 
 		 562 aa  826    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4248  acetolactate synthase catalytic subunit  71.25 
 
 		 562 aa  818    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0734  acetolactate synthase catalytic subunit  77.9 
 
 		 564 aa  880    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3076  acetolactate synthase catalytic subunit  66.37 
 
 		 555 aa  752    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932178  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1631  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  58.55 
 
 		 559 aa  652    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0398  acetolactate synthase catalytic subunit  60.25 
 
 		 605 aa  693    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4180  acetolactate synthase catalytic subunit  71.25 
 
 		 562 aa  818    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3884  acetolactate synthase catalytic subunit  71.25 
 
 		 562 aa  815    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0620  acetolactate synthase catalytic subunit  82.31 
 
 		 554 aa  939    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  71.43 
 
 		 562 aa  817    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  100 
 
 		 554 aa  1124    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1883  acetolactate synthase catalytic subunit  62.95 
 
 		 615 aa  687    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4185  acetolactate synthase catalytic subunit  71.79 
 
 		 562 aa  826    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4077  acetolactate synthase catalytic subunit  71.79 
 
 		 562 aa  826    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  71.43 
 
 		 562 aa  822    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03497  hypothetical protein  71.07 
 
 		 562 aa  815    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2624  acetolactate synthase catalytic subunit  62.68 
 
 		 563 aa  704    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0028  acetolactate synthase catalytic subunit  71.25 
 
 		 562 aa  815    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4127  acetolactate synthase catalytic subunit  71.79 
 
 		 562 aa  826    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3813  acetolactate synthase catalytic subunit  96.21 
 
 		 554 aa  1087    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4006  acetolactate synthase catalytic subunit  71.79 
 
 		 562 aa  826    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  81.77 
 
 		 554 aa  941    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0158  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  57.53 
 
 		 564 aa  582  1.0000000000000001e-165  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.63 
 
 		 555 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.17 
 
 		 557 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4111  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  47.64 
 
 		 548 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4232  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  47.64 
 
 		 548 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4291  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  47.45 
 
 		 548 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  47.82 
 
 		 548 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.22 
 
 		 554 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.21 
 
 		 554 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4234  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  48.18 
 
 		 548 aa  513  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.194744  normal  0.310929 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4152  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  48.18 
 
 		 548 aa  514  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4126  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  47.45 
 
 		 548 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4183  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  47.36 
 
 		 548 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.224573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3985  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  48.18 
 
 		 548 aa  513  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  48.18 
 
 		 548 aa  513  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03646  acetolactate synthase II, valine insensitive, large subunit  48.18 
 
 		 548 aa  511  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0646243  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  46.73 
 
 		 548 aa  508  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4279  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  48 
 
 		 548 aa  511  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4134  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  48.36 
 
 		 548 aa  511  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.82212  normal  0.957886 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03595  hypothetical protein  48.18 
 
 		 548 aa  511  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0633614  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1707  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.83 
 
 		 571 aa  509  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.31 
 
 		 571 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.19 
 
 		 569 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  46.36 
 
 		 548 aa  505  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.62 
 
 		 556 aa  508  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.44 
 
 		 561 aa  506  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0140  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.13 
 
 		 565 aa  504  1e-141  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.13 
 
 		 573 aa  503  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3329  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  48.92 
 
 		 578 aa  503  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.13 
 
 		 570 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.13 
 
 		 570 aa  501  1e-140  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.44 
 
 		 588 aa  501  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.13 
 
 		 570 aa  501  1e-140  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  45.92 
 
 		 548 aa  499  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.66 
 
 		 563 aa  499  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4015  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  46.92 
 
 		 548 aa  499  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565502 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1428  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.76 
 
 		 564 aa  501  1e-140  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00100174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.13 
 
 		 570 aa  501  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1934  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.95 
 
 		 571 aa  497  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0345  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  46.75 
 
 		 569 aa  498  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0918871  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  44.98 
 
 		 552 aa  498  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  47.32 
 
 		 583 aa  495  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.1 
 
 		 558 aa  496  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  44.19 
 
 		 553 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.22 
 
 		 570 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  43.27 
 
 		 569 aa  494  9.999999999999999e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  44.77 
 
 		 559 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1165  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  43.55 
 
 		 561 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.54 
 
 		 557 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.31 
 
 		 561 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.03 
 
 		 555 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  45.36 
 
 		 567 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1108  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  47.68 
 
 		 583 aa  494  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  44.96 
 
 		 566 aa  491  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1966  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.4 
 
 		 571 aa  491  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.107455  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.27 
 
 		 563 aa  491  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.31 
 
 		 587 aa  491  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  43.73 
 
 		 557 aa  486  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.04 
 
 		 574 aa  486  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  44.56 
 
 		 562 aa  486  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  45.29 
 
 		 623 aa  485  1e-136  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0442  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  44.93 
 
 		 562 aa  487  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3281  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  47.91 
 
 		 556 aa  486  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.5 
 
 		 593 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1296  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  43.55 
 
 		 563 aa  485  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.64 
 
 		 612 aa  484  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.45 
 
 		 558 aa  485  1e-135  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4165  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  45.03 
 
 		 557 aa  484  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  43.04 
 
 		 555 aa  484  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0289  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  46.32 
 
 		 557 aa  483  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4009  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  46.38 
 
 		 557 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0741  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  43.77 
 
 		 573 aa  480  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>