More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3298 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1157  acetolactate synthase  66.85 
 
 
547 aa  785    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0170983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  66.85 
 
 
547 aa  785    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4257  acetolactate synthase  66.48 
 
 
547 aa  782    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1174  acetolactate synthase  66.11 
 
 
547 aa  774    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0167286 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3360  acetolactate synthase  56.23 
 
 
552 aa  642    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2127  acetolactate synthase  65.76 
 
 
547 aa  776    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240788  decreased coverage  0.000000336537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0913  acetolactate synthase  67.59 
 
 
547 aa  780    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00656  acetolactate synthase  66 
 
 
546 aa  762    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0212  acetolactate synthase  85.82 
 
 
546 aa  998    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4950  acetolactate synthase  86.18 
 
 
546 aa  1001    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0974  acetolactate synthase  86 
 
 
546 aa  999    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2550  acetolactate synthase  86 
 
 
546 aa  999    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2312  acetolactate synthase  86.55 
 
 
546 aa  1007    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3741  acetolactate synthase  86.55 
 
 
546 aa  1006    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.489898  normal  0.875754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2084  acetolactate synthase  91.82 
 
 
550 aa  1062    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167502  normal  0.0947077 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2032  acetolactate synthase  66 
 
 
558 aa  742    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.101383  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0228  acetolactate synthase  64.18 
 
 
550 aa  755    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.027454  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2585  acetolactate synthase  66.48 
 
 
547 aa  782    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78585  normal  0.153261 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1248  acetolactate synthase  97.82 
 
 
550 aa  1126    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.888375 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0497  acetolactate synthase  86.36 
 
 
546 aa  1004    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2379  acetolactate synthase  64.73 
 
 
563 aa  742    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.707802  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0246  acetolactate synthase  85.82 
 
 
546 aa  998    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3298  acetolactate synthase  100 
 
 
550 aa  1142    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0757379  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2393  acetolactate synthase  66.85 
 
 
547 aa  785    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.459354  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0639  acetolactate synthase  64.61 
 
 
548 aa  750    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.237163  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4581  acetolactate synthase  86.55 
 
 
546 aa  1006    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29409  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3850  acetolactate synthase  65.82 
 
 
546 aa  777    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780618  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  66.85 
 
 
547 aa  786    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5290  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  68.36 
 
 
547 aa  798    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2696  acetolactate synthase  86 
 
 
546 aa  999    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5509  acetolactate synthase  87.09 
 
 
546 aa  1011    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09820  acetolactate synthase  67.96 
 
 
547 aa  786    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.537219  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3782  acetolactate synthase  86.55 
 
 
546 aa  1006    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.393352  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3674  acetolactate synthase  86.73 
 
 
546 aa  1008    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.839187 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3397  acetolactate synthase  61.41 
 
 
556 aa  700    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0101  acetolactate synthase  58.36 
 
 
547 aa  661    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  0.539081 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1390  acetolactate synthase  85.82 
 
 
546 aa  998    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1587  acetolactate synthase  85.82 
 
 
546 aa  998    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8307  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  58.29 
 
 
552 aa  633  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0778  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  57.83 
 
 
554 aa  630  1e-179  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2375  acetolactate synthase  58.46 
 
 
551 aa  627  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373721  normal  0.787639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2397  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  57.09 
 
 
550 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.113727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1826  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  56.7 
 
 
546 aa  613  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.339659  normal  0.631348 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5394  acetolactate synthase  56.08 
 
 
548 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752966  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7024  hypothetical protein  54.2 
 
 
565 aa  555  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0863974  normal  0.0979808 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2541  acetolactate synthase  47.64 
 
 
544 aa  532  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1928  acetolactate synthase  42.59 
 
 
545 aa  455  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886275  normal  0.0286883 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0688  acetolactate synthase  41.49 
 
 
550 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4208  acetolactate synthase  41.26 
 
 
550 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4168  acetolactate synthase  41.26 
 
 
550 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0840  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein TPP-binding protein  41.94 
 
 
547 aa  437  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.923558  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3533  acetolactate synthase  40.98 
 
 
547 aa  430  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.476222 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2710  acetolactate synthase  41.07 
 
 
545 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404072  hitchhiker  0.0000000454495 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0051  acetolactate synthase  39.52 
 
 
547 aa  421  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0174  acetolactate synthase, large subunit  41 
 
 
544 aa  414  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.936487  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0036  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  40.07 
 
 
547 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5857  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  39.44 
 
 
554 aa  392  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0428  acetolactate synthase  38.94 
 
 
583 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1043  acetolactate synthase  36.18 
 
 
583 aa  360  5e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1763  acetolactate synthase, large subunit  35.09 
 
 
547 aa  350  3e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0734  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  38.71 
 
 
526 aa  347  3e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3439  acetolactate synthase  36.1 
 
 
559 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3317  acetolactate synthase  34.85 
 
 
559 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0619  acetolactate synthase  33.45 
 
 
559 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1046  acetolactate synthase  34.92 
 
 
562 aa  307  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0405645  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0520  acetolactate synthase  32.66 
 
 
548 aa  306  5.0000000000000004e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.778646 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0836  acetolactate synthase  33.09 
 
 
559 aa  306  6e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0956  acetolactate synthase  34.73 
 
 
565 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0771  acetolactate synthase  34.92 
 
 
565 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0772  acetolactate synthase  34.73 
 
 
565 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0920  acetolactate synthase  34.55 
 
 
562 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.143852  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4410  acetolactate synthase  34.73 
 
 
562 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0170739 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0823  acetolactate synthase  34.55 
 
 
562 aa  302  9e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0866  acetolactate synthase  34.55 
 
 
562 aa  302  9e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.913065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0958  acetolactate synthase  34.55 
 
 
562 aa  302  9e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0770  acetolactate synthase  34.73 
 
 
562 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3840  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.46 
 
 
546 aa  300  4e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2027  acetolactate synthase  33.94 
 
 
559 aa  289  8e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0940  acetolactate synthase  33.33 
 
 
558 aa  289  1e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00979223  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3432  acetolactate synthase  33.21 
 
 
561 aa  283  8.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  31.83 
 
 
599 aa  280  4e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1192  acetolactate synthase  32.12 
 
 
567 aa  280  4e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.37842  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2237  acetolactate synthase  31.49 
 
 
554 aa  277  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2276  acetolactate synthase  31.49 
 
 
554 aa  277  3e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1192  acetolactate synthase  33.52 
 
 
560 aa  276  5e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0417652  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000394  acetolactate synthase catabolic  31.32 
 
 
567 aa  276  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000407166  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0132  acetolactate synthase  31.82 
 
 
559 aa  276  7e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.43 
 
 
562 aa  276  9e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2155  acetolactate synthase  31.81 
 
 
554 aa  275  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2152  pyruvate oxidase  31.6 
 
 
566 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1349  acetolactate synthase  33.57 
 
 
554 aa  272  1e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0263641  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.59 
 
 
562 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2201  pyruvate oxidase  31.6 
 
 
566 aa  270  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0998219  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.67 
 
 
564 aa  270  5e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.5 
 
 
566 aa  270  5e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0186  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.98 
 
 
576 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.78 
 
 
582 aa  268  2e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  32.37 
 
 
587 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  31.19 
 
 
578 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  32.84 
 
 
555 aa  267  4e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>