More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A0978 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4239  hypothetical protein  84.03 
 
 
552 aa  888    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.958408 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1330  hypothetical protein  99.11 
 
 
561 aa  1040    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3575  hypothetical protein  66.42 
 
 
568 aa  686    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0600734  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2500  hypothetical protein  99.46 
 
 
557 aa  1118    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.844466  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1111  hypothetical protein  88.02 
 
 
555 aa  925    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0531038  normal  0.265542 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3167  hypothetical protein  64 
 
 
572 aa  660    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279864  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1495  hypothetical protein  97.49 
 
 
557 aa  1013    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0959  hypothetical protein  59.78 
 
 
568 aa  649    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3687  hypothetical protein  67.51 
 
 
556 aa  698    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.697369  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0181  hypothetical protein  86.03 
 
 
552 aa  915    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3664  hypothetical protein  88.57 
 
 
555 aa  931    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3990  hypothetical protein  89.11 
 
 
555 aa  958    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298982  normal  0.0224139 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4504  hypothetical protein  66.06 
 
 
579 aa  698    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325026  normal  0.987536 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4097  hypothetical protein  88.57 
 
 
555 aa  939    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357485  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4703  hypothetical protein  88.57 
 
 
555 aa  931    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00302923  normal  0.177338 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4636  hypothetical protein  66.06 
 
 
579 aa  698    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.19784  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7065  hypothetical protein  85.48 
 
 
552 aa  914    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234847  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5597  hypothetical protein  88.57 
 
 
555 aa  929    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.410297 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4562  hypothetical protein  88.57 
 
 
555 aa  941    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167245  hitchhiker  0.00212145 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0313  hypothetical protein  99.11 
 
 
561 aa  1040    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0601797  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0589  hypothetical protein  100 
 
 
557 aa  1122    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.934212  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1313  hypothetical protein  99.64 
 
 
557 aa  1120    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0237102  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1240  hypothetical protein  99.46 
 
 
557 aa  1118    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0978  hypothetical protein  100 
 
 
557 aa  1122    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10094  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0823  hypothetical protein  53.6 
 
 
557 aa  529  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0385424  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0143  hypothetical protein  49 
 
 
546 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3956  hypothetical protein  46.13 
 
 
547 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3087  thiamine pyrophosphate protein central region  34.2 
 
 
564 aa  209  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1839  acetolactate synthase catalytic subunit  29.34 
 
 
555 aa  194  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1950  acetolactate synthase catalytic subunit  29.34 
 
 
555 aa  194  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3813  acetolactate synthase catalytic subunit  30.35 
 
 
554 aa  190  7e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.34 
 
 
566 aa  189  8e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2624  acetolactate synthase catalytic subunit  30.81 
 
 
563 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  29.23 
 
 
572 aa  188  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30090  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  30.34 
 
 
553 aa  188  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.492934  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.92 
 
 
554 aa  187  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5448  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.42 
 
 
592 aa  186  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404549  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  30.15 
 
 
554 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1905  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  26.61 
 
 
573 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3590  hypothetical protein  30.97 
 
 
541 aa  183  7e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.291615  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0741  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.54 
 
 
573 aa  182  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.68 
 
 
567 aa  182  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  30.11 
 
 
554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  27.9 
 
 
566 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01970  acetolactate synthase, large subunit  29.18 
 
 
622 aa  181  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00241919  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1932  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.86 
 
 
554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.17 
 
 
569 aa  180  5.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5385  hypothetical protein  30.87 
 
 
542 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366398  normal  0.452356 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  27.53 
 
 
542 aa  180  7e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.03 
 
 
570 aa  179  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.03 
 
 
570 aa  179  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.03 
 
 
570 aa  179  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.03 
 
 
570 aa  179  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.63 
 
 
535 aa  179  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1620  acetolactate synthase catalytic subunit  29.02 
 
 
556 aa  179  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.546066  normal  0.5994 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.64 
 
 
566 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0620  acetolactate synthase catalytic subunit  29.91 
 
 
554 aa  179  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4867  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.5 
 
 
593 aa  179  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.49 
 
 
566 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.27 
 
 
558 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4185  acetolactate synthase catalytic subunit  27.39 
 
 
562 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4006  acetolactate synthase catalytic subunit  27.39 
 
 
562 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277464  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  28.57 
 
 
562 aa  178  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4022  acetolactate synthase catalytic subunit  27.39 
 
 
562 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4077  acetolactate synthase catalytic subunit  27.39 
 
 
562 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0853  acetolactate synthase, large subunit  26.99 
 
 
573 aa  178  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.640805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.86 
 
 
561 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1707  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27 
 
 
571 aa  179  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2671  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.1 
 
 
570 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.343163  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2937  hypothetical protein  29.21 
 
 
543 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4127  acetolactate synthase catalytic subunit  27.39 
 
 
562 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2840  hypothetical protein  30.66 
 
 
545 aa  177  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  30.5 
 
 
587 aa  178  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5349  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.16 
 
 
591 aa  177  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.15 
 
 
554 aa  177  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  27.59 
 
 
562 aa  177  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5323  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.75 
 
 
591 aa  177  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.196754  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4248  acetolactate synthase catalytic subunit  28.52 
 
 
562 aa  176  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4180  acetolactate synthase catalytic subunit  28.52 
 
 
562 aa  176  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0239  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.06 
 
 
592 aa  176  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2048  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.76 
 
 
596 aa  176  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.45 
 
 
570 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3884  acetolactate synthase catalytic subunit  28.52 
 
 
562 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2893  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.61 
 
 
592 aa  176  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020584 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46120  hypothetical protein  30.52 
 
 
533 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624787  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.39 
 
 
557 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0028  acetolactate synthase catalytic subunit  28.52 
 
 
562 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03555  acetolactate synthase large subunit  28.52 
 
 
562 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0032  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.52 
 
 
562 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.55 
 
 
573 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03497  hypothetical protein  28.52 
 
 
562 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1703  hypothetical protein  28.96 
 
 
558 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603628  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.94 
 
 
563 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.44 
 
 
553 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.1 
 
 
587 aa  175  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.62 
 
 
563 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4864  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.98 
 
 
591 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4038  acetolactate synthase catalytic subunit  28.39 
 
 
562 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.725928  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1966  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.18 
 
 
571 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.107455  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5404  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.34 
 
 
591 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589591  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>