More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4562 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3167  hypothetical protein  64.77 
 
 		 572 aa  675    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279864  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1330  hypothetical protein  87.75 
 
 		 561 aa  933    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3575  hypothetical protein  64.84 
 
 		 568 aa  675    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0600734  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4636  hypothetical protein  65.38 
 
 		 579 aa  693    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.19784  normal  0.102467 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2500  hypothetical protein  88.93 
 
 		 557 aa  944    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.844466  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1111  hypothetical protein  95.32 
 
 		 555 aa  994    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0531038  normal  0.265542 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1495  hypothetical protein  88.87 
 
 		 557 aa  929    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0959  hypothetical protein  60.18 
 
 		 568 aa  659    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3990  hypothetical protein  95.68 
 
 		 555 aa  1032    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298982  normal  0.0224139 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4562  hypothetical protein  100 
 
 		 555 aa  1126    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167245  hitchhiker  0.00212145 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3687  hypothetical protein  66.79 
 
 		 556 aa  689    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.697369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0181  hypothetical protein  85.61 
 
 		 552 aa  918    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4239  hypothetical protein  84.39 
 
 		 552 aa  902    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.958408 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3664  hypothetical protein  96.4 
 
 		 555 aa  1004    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4097  hypothetical protein  99.46 
 
 		 555 aa  1120    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357485  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4703  hypothetical protein  96.4 
 
 		 555 aa  1004    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00302923  normal  0.177338 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7065  hypothetical protein  85.25 
 
 		 552 aa  920    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0234847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4504  hypothetical protein  65.38 
 
 		 579 aa  693    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325026  normal  0.987536 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0313  hypothetical protein  87.75 
 
 		 561 aa  933    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0601797  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5597  hypothetical protein  96.76 
 
 		 555 aa  1006    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410297 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0589  hypothetical protein  88.57 
 
 		 557 aa  939    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.934212  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1313  hypothetical protein  88.75 
 
 		 557 aa  942    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0237102  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1240  hypothetical protein  88.93 
 
 		 557 aa  944    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0978  hypothetical protein  88.57 
 
 		 557 aa  939    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10094  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0823  hypothetical protein  53.11 
 
 		 557 aa  541  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0385424  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0143  hypothetical protein  46.62 
 
 		 546 aa  443  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3956  hypothetical protein  46.7 
 
 		 547 aa  412  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1620  acetolactate synthase catalytic subunit  29.96 
 
 		 556 aa  199  9e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.546066  normal  0.5994 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3087  thiamine pyrophosphate protein central region  32.2 
 
 		 564 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  28.65 
 
 		 566 aa  196  9e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0741  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.26 
 
 		 573 aa  196  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  29.03 
 
 		 562 aa  194  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30090  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  30.06 
 
 		 553 aa  191  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.492934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.8 
 
 		 566 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4180  acetolactate synthase catalytic subunit  28.79 
 
 		 562 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4248  acetolactate synthase catalytic subunit  28.84 
 
 		 562 aa  190  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3813  acetolactate synthase catalytic subunit  28.8 
 
 		 554 aa  190  7e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0028  acetolactate synthase catalytic subunit  29.35 
 
 		 562 aa  189  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3884  acetolactate synthase catalytic subunit  29.35 
 
 		 562 aa  189  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4038  acetolactate synthase catalytic subunit  28.97 
 
 		 562 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.725928  normal  0.773319 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03555  acetolactate synthase large subunit  28.84 
 
 		 562 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0032  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.84 
 
 		 562 aa  188  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  28.73 
 
 		 572 aa  188  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03497  hypothetical protein  28.84 
 
 		 562 aa  188  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1839  acetolactate synthase catalytic subunit  28.17 
 
 		 555 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1950  acetolactate synthase catalytic subunit  28.17 
 
 		 555 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0853  acetolactate synthase, large subunit  27.83 
 
 		 573 aa  187  6e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.640805  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  28.47 
 
 		 554 aa  186  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.22 
 
 		 553 aa  186  9e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  29.07 
 
 		 554 aa  186  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.99 
 
 		 557 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1905  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  27.17 
 
 		 573 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.1 
 
 		 566 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.08 
 
 		 566 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2624  acetolactate synthase catalytic subunit  31.34 
 
 		 563 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  27.62 
 
 		 542 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.57 
 
 		 570 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.57 
 
 		 570 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.57 
 
 		 570 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.57 
 
 		 570 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1717  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.62 
 
 		 566 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.589802  normal  0.264845 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.08 
 
 		 554 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  28.54 
 
 		 562 aa  183  6e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.34 
 
 		 535 aa  182  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.51 
 
 		 573 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2168  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.97 
 
 		 573 aa  181  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4022  acetolactate synthase catalytic subunit  27.51 
 
 		 562 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4006  acetolactate synthase catalytic subunit  27.51 
 
 		 562 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0620  acetolactate synthase catalytic subunit  28.6 
 
 		 554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4077  acetolactate synthase catalytic subunit  27.51 
 
 		 562 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01970  acetolactate synthase, large subunit  29.31 
 
 		 622 aa  181  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00241919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.04 
 
 		 552 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4185  acetolactate synthase catalytic subunit  27.51 
 
 		 562 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.84 
 
 		 554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4127  acetolactate synthase catalytic subunit  27.51 
 
 		 562 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1707  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.15 
 
 		 571 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  30.51 
 
 		 587 aa  180  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.39 
 
 		 566 aa  180  4.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.32 
 
 		 571 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.95 
 
 		 561 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.07 
 
 		 567 aa  179  8e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.46 
 
 		 563 aa  180  8e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  27.19 
 
 		 566 aa  179  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.12 
 
 		 612 aa  179  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2420  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.78 
 
 		 586 aa  179  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2840  hypothetical protein  30.06 
 
 		 545 aa  178  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.77 
 
 		 587 aa  179  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.44 
 
 		 558 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  26 
 
 		 599 aa  179  2e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2183  hypothetical protein  30.31 
 
 		 535 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3009  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.2 
 
 		 585 aa  177  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161058 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.72 
 
 		 557 aa  177  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.49 
 
 		 566 aa  177  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.63 
 
 		 565 aa  176  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2893  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.63 
 
 		 592 aa  176  8e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020584 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1488  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.82 
 
 		 601 aa  176  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  27.85 
 
 		 562 aa  176  9e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4867  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.31 
 
 		 593 aa  176  9e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  26.56 
 
 		 570 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0734  acetolactate synthase catalytic subunit  27.77 
 
 		 564 aa  176  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>