167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0573 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0573  phosphonopyruvate decarboxylase  100 
 
 		 384 aa  789    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0477  phosphonopyruvate decarboxylase  90.36 
 
 		 384 aa  695    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0817  phosphonopyruvate decarboxylase  55.41 
 
 		 408 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.438085  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2172  thiamine pyrophosphate enzyme family protein  55.44 
 
 		 721 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.531587  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0909  phosphonopyruvate decarboxylase  54.57 
 
 		 412 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1414  phosphonopyruvate decarboxylase, putative  50.13 
 
 		 378 aa  376  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5664  phosphonopyruvate decarboxylase  44.24 
 
 		 373 aa  308  9e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3414  phosphonopyruvate decarboxylase protein  34.09 
 
 		 380 aa  202  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1162  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  33.86 
 
 		 370 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3534  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.75 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1915  thiamine pyrophosphate enzyme, putative 3-phosphonopyruvate decarboxylase  32.32 
 
 		 393 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4472  phosphonopyruvate decarboxylase  31.16 
 
 		 395 aa  177  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110205  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4015  phosphonopyruvate decarboxylase  31.75 
 
 		 398 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.764027 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1316  thiamine pyrophosphate enzyme  33 
 
 		 384 aa  173  5.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3399  phosphonopyruvate decarboxylase  30.5 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2977  phosphonopyruvate decarboxylase  33.5 
 
 		 392 aa  170  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5998  phosphonopyruvate decarboxylase  33.08 
 
 		 387 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.412851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2234  putative thiamine pyrophosphate enzyme  32.43 
 
 		 387 aa  170  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4246  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  30 
 
 		 398 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4120  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30 
 
 		 398 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1809  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  31.03 
 
 		 399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0361229  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3821  phosphonopyruvate decarboxylase  31.08 
 
 		 394 aa  162  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.416111 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2064  3-phosphonopyruvate decarboxylase  31.45 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1909  3-phosphonopyruvate decarboxylase  30.64 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0779  3-phosphonopyruvate decarboxylase  31.45 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0690  3-phosphonopyruvate decarboxylase  31.45 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1769  3-phosphonopyruvate decarboxylase  32.32 
 
 		 372 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0759  3-phosphonopyruvate decarboxylase  32.32 
 
 		 372 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.762667  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1052  3-phosphonopyruvate decarboxylase  32.32 
 
 		 372 aa  149  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1069  hypothetical protein  34 
 
 		 199 aa  102  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0112  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.72 
 
 		 373 aa  96.3  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3542  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha / sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  27.3 
 
 		 382 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0505956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2976  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  28.79 
 
 		 373 aa  94.4  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0803  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  39.2 
 
 		 189 aa  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2117  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  24.87 
 
 		 372 aa  90.5  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3127  hypothetical protein  37.41 
 
 		 213 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1624  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.4 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1219  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.3 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0991  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.84 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0504  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta / sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  27.13 
 
 		 371 aa  79.3  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1402  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  34 
 
 		 184 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00264057 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1459  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  34.21 
 
 		 189 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.417982  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2733  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.25 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2499  hypothetical protein  34.67 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0964  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.51 
 
 		 185 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0982  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.63 
 
 		 185 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0238706  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1717  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.93 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1620  acetolactate synthase catalytic subunit  30.14 
 
 		 556 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.546066  normal  0.5994 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1623  sulfopyruvate decarboxylase  32.5 
 
 		 192 aa  62  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1187  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  32.84 
 
 		 175 aa  62  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1052  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  32.26 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1458  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  34.81 
 
 		 168 aa  58.9  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.454016  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5917  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.2 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854932  normal  0.161715 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1237  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  32.43 
 
 		 223 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0422665  normal  0.190035 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6125  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.43 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1227  sulfopyruvate decarboxylase  30.06 
 
 		 167 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.47502  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2070  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  31.53 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0454462 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1165  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  24.09 
 
 		 561 aa  57  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6413  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.61 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.53225 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0499  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  29.45 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.939895  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5427  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  25.18 
 
 		 202 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  27.93 
 
 		 551 aa  54.3  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  26.16 
 
 		 554 aa  54.3  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1409  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  28.83 
 
 		 166 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4015  thiamine pyrophosphate protein central region  30.47 
 
 		 638 aa  53.5  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6790  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  35.34 
 
 		 198 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  30.4 
 
 		 528 aa  53.5  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6968  thiamine pyrophosphate protein central region  32.18 
 
 		 595 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1519  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  32.18 
 
 		 595 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6310  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.18 
 
 		 595 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.683934  normal  0.626612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2177  sulfopyruvate decarboxylase  26.16 
 
 		 198 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0620  acetolactate synthase catalytic subunit  26.73 
 
 		 554 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1578  myo-inositol catabolism protein  28.49 
 
 		 645 aa  52  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.505237  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1399  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  30.71 
 
 		 166 aa  52.4  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.293231  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5624  benzoylformate decarboxylase  26.19 
 
 		 549 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.335952  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2814  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 565 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6335  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  27.44 
 
 		 582 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4714  probable malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  27.22 
 
 		 646 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163823  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64770  benzoylformate decarboxylase  25.71 
 
 		 528 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.819611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4353  hypothetical protein  29.03 
 
 		 513 aa  49.7  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.92083 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1115  putative acetolactate synthase large subunit  33.02 
 
 		 586 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0471394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0152  thiamine pyrophosphate protein  28.88 
 
 		 567 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2624  acetolactate synthase catalytic subunit  34.34 
 
 		 563 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.31 
 
 		 628 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.662359  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  24.75 
 
 		 562 aa  49.7  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3016  hypothetical protein  30.23 
 
 		 514 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4038  acetolactate synthase catalytic subunit  25.6 
 
 		 562 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.725928  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0680  thiamine pyrophosphate requiring enzyme  24.4 
 
 		 574 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0138  thiamine pyrophosphate protein  26.71 
 
 		 567 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0140  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.79 
 
 		 565 aa  48.5  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  28.57 
 
 		 552 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.21 
 
 		 619 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.960147  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2917  thiamine pyrophosphate protein  28.27 
 
 		 567 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0138  thiamine pyrophosphate protein  28.27 
 
 		 567 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0734  acetolactate synthase catalytic subunit  30.46 
 
 		 564 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0189  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  28.66 
 
 		 578 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000920393  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05831  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.46 
 
 		 587 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  26.54 
 
 		 554 aa  47.4  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1858  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.46 
 
 		 582 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.667431  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  30.89 
 
 		 568 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>