104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0504 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0504  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta / sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  100 
 
 
371 aa  757    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2976  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  48.92 
 
 
373 aa  349  4e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2733  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  49.05 
 
 
370 aa  334  2e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0112  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  47.06 
 
 
373 aa  325  1e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2117  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  48.38 
 
 
372 aa  319  5e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3542  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha / sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  42.93 
 
 
382 aa  270  4e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0505956  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1162  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  32.45 
 
 
370 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1915  thiamine pyrophosphate enzyme, putative 3-phosphonopyruvate decarboxylase  28.46 
 
 
393 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3534  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.18 
 
 
393 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1459  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  41.9 
 
 
189 aa  124  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.417982  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4472  phosphonopyruvate decarboxylase  27.84 
 
 
395 aa  123  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110205  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4015  phosphonopyruvate decarboxylase  27.35 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.764027 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2234  putative thiamine pyrophosphate enzyme  28.49 
 
 
387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3821  phosphonopyruvate decarboxylase  28.97 
 
 
394 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.416111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5998  phosphonopyruvate decarboxylase  28.72 
 
 
387 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.412851 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4246  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  27.08 
 
 
398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4120  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.08 
 
 
398 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3399  phosphonopyruvate decarboxylase  26.86 
 
 
398 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1769  3-phosphonopyruvate decarboxylase  30 
 
 
372 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0759  3-phosphonopyruvate decarboxylase  30 
 
 
372 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.762667  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1052  3-phosphonopyruvate decarboxylase  30 
 
 
372 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1414  phosphonopyruvate decarboxylase, putative  32.57 
 
 
378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1316  thiamine pyrophosphate enzyme  28.19 
 
 
384 aa  116  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2064  3-phosphonopyruvate decarboxylase  30.2 
 
 
393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0779  3-phosphonopyruvate decarboxylase  30.2 
 
 
393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0690  3-phosphonopyruvate decarboxylase  30.2 
 
 
393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1909  3-phosphonopyruvate decarboxylase  29.43 
 
 
393 aa  113  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1624  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.95 
 
 
187 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1809  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  28.87 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0361229  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3414  phosphonopyruvate decarboxylase protein  28.02 
 
 
380 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0817  phosphonopyruvate decarboxylase  27.3 
 
 
408 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.438085  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0991  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.7 
 
 
188 aa  103  6e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2172  thiamine pyrophosphate enzyme family protein  27.54 
 
 
721 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.531587  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1717  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.1 
 
 
185 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5664  phosphonopyruvate decarboxylase  29.06 
 
 
373 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0964  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.04 
 
 
185 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0982  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.7 
 
 
185 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0238706  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1458  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  35.1 
 
 
168 aa  99  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.454016  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2977  phosphonopyruvate decarboxylase  25.94 
 
 
392 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1219  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.63 
 
 
187 aa  94.4  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0909  phosphonopyruvate decarboxylase  26.98 
 
 
412 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1399  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  36.84 
 
 
166 aa  93.2  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.293231  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1623  sulfopyruvate decarboxylase  34.18 
 
 
192 aa  93.2  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3127  hypothetical protein  37.5 
 
 
213 aa  93.2  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5917  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.36 
 
 
198 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854932  normal  0.161715 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1409  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  34.57 
 
 
166 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0499  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  33.13 
 
 
167 aa  89.4  9e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.939895  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1402  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  35.37 
 
 
184 aa  88.6  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00264057 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1227  sulfopyruvate decarboxylase  39.84 
 
 
167 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.47502  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1069  hypothetical protein  33.5 
 
 
199 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2499  hypothetical protein  37.5 
 
 
202 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0477  phosphonopyruvate decarboxylase  26.89 
 
 
384 aa  79.7  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1187  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  33.81 
 
 
175 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6790  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  34.88 
 
 
198 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0573  phosphonopyruvate decarboxylase  28.62 
 
 
384 aa  77  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2177  sulfopyruvate decarboxylase  30.63 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315174  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6413  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.34 
 
 
189 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.53225 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6125  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.34 
 
 
189 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1401  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  27.89 
 
 
168 aa  71.6  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00255271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6662  putative sulfopyruvate decarboxylase beta subunit  42.98 
 
 
193 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1052  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  34.38 
 
 
196 aa  62  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2500  putative decarboxylase  33.88 
 
 
177 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.92042 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5426  Sulfopyruvate decarboxylase alpha subunit  28.57 
 
 
166 aa  60.1  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0803  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  38.05 
 
 
189 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1051  hypothetical protein  28.66 
 
 
175 aa  59.3  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0660  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  30.77 
 
 
348 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1238  sulfopyruvate decarboxylase  28.57 
 
 
166 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0616406  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6412  hypothetical protein  38.1 
 
 
178 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.519498 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6124  hypothetical protein  38.1 
 
 
178 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2071  sulfopyruvate decarboxylase  28.57 
 
 
166 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0452585 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0554  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  33.33 
 
 
353 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1437  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, beta subunit  31.37 
 
 
299 aa  54.3  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00297797  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6791  hypothetical protein  32.33 
 
 
180 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.384747  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000460  2-oxoglutarate oxidoreductase beta subunit  29.14 
 
 
332 aa  53.9  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2675  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  30.88 
 
 
352 aa  53.1  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0071  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  33.33 
 
 
354 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4473  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  28.95 
 
 
359 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3719  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  27.93 
 
 
333 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal  0.267798 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3128  putative sulfopyruvate decarboxylase (alpha subunit)  28.06 
 
 
182 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0283  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  30.88 
 
 
361 aa  50.4  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6661  putative sulfopyruvate decarboxylase alpha subunit  30.7 
 
 
181 aa  50.4  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.984154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1620  acetolactate synthase catalytic subunit  22.1 
 
 
556 aa  49.7  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.546066  normal  0.5994 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6078  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  30.47 
 
 
353 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.162959 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1068  putative sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  38.46 
 
 
182 aa  47.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3085  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  28.46 
 
 
246 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.186779  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5918  hypothetical protein  34.04 
 
 
178 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262351  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1176  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  28.46 
 
 
246 aa  47.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.192e-27 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2178  hypothetical protein  27.2 
 
 
179 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4077  acetolactate synthase catalytic subunit  20.9 
 
 
562 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4127  acetolactate synthase catalytic subunit  20.9 
 
 
562 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4006  acetolactate synthase catalytic subunit  20.9 
 
 
562 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277464  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4185  acetolactate synthase catalytic subunit  20.9 
 
 
562 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4022  acetolactate synthase catalytic subunit  20.9 
 
 
562 aa  46.2  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0802  putative decarboxylase  26.09 
 
 
170 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2238  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.91 
 
 
247 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000276409  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1606  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  26.19 
 
 
244 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0729  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.71 
 
 
267 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.432873  normal  0.0371975 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0604  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  32.43 
 
 
277 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000157419 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3746  acetolactate synthase, large subunit  21.78 
 
 
573 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1631  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  21.15 
 
 
559 aa  43.5  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>