24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0802 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0802  putative decarboxylase  100 
 
 		 170 aa  344  3e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2500  putative decarboxylase  29.22 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.92042 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1068  putative sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  32.9 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0112  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.46 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1399  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  32.26 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.293231  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1409  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  30.11 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1227  sulfopyruvate decarboxylase  29.03 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.47502  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0499  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  29.03 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.939895  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1623  sulfopyruvate decarboxylase  32.17 
 
 		 192 aa  52  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1162  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  27.2 
 
 		 370 aa  52  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2117  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  25.97 
 
 		 372 aa  49.7  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1458  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  28.03 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.454016  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1401  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  24.22 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00255271 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1187  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  30.69 
 
 		 175 aa  48.5  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6791  hypothetical protein  28.67 
 
 		 180 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.384747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3128  putative sulfopyruvate decarboxylase (alpha subunit)  29.79 
 
 		 182 aa  47.8  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2976  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  25 
 
 		 373 aa  45.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0504  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta / sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  26.09 
 
 		 371 aa  45.8  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5918  hypothetical protein  27.59 
 
 		 178 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262351  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5426  Sulfopyruvate decarboxylase alpha subunit  22.5 
 
 		 166 aa  44.3  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0675  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  34.88 
 
 		 535 aa  44.3  0.0009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.175682 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2071  sulfopyruvate decarboxylase  22.96 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0452585 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1966  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase  29.5 
 
 		 533 aa  41.6  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2733  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  23.01 
 
 		 370 aa  41.6  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.911419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>