106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2117 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2117  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  100 
 
 
372 aa  754    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0112  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  52.8 
 
 
373 aa  374  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2733  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  52.14 
 
 
370 aa  369  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2976  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  49.19 
 
 
373 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0504  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta / sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  48.38 
 
 
371 aa  319  5e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3542  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha / sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  43.01 
 
 
382 aa  292  5e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0505956  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1459  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  45.36 
 
 
189 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.417982  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1162  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  30.65 
 
 
370 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1624  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  46.3 
 
 
187 aa  136  5e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3414  phosphonopyruvate decarboxylase protein  31.35 
 
 
380 aa  134  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3534  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.41 
 
 
393 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2234  putative thiamine pyrophosphate enzyme  29.97 
 
 
387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5998  phosphonopyruvate decarboxylase  29.46 
 
 
387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.412851 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0817  phosphonopyruvate decarboxylase  30.73 
 
 
408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.438085  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1915  thiamine pyrophosphate enzyme, putative 3-phosphonopyruvate decarboxylase  29.52 
 
 
393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0909  phosphonopyruvate decarboxylase  30.67 
 
 
412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0991  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.3 
 
 
188 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3821  phosphonopyruvate decarboxylase  29.47 
 
 
394 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.416111 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3399  phosphonopyruvate decarboxylase  29.43 
 
 
398 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4246  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  29.32 
 
 
398 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4120  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.32 
 
 
398 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4472  phosphonopyruvate decarboxylase  30.16 
 
 
395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110205  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2172  thiamine pyrophosphate enzyme family protein  30.98 
 
 
721 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.531587  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4015  phosphonopyruvate decarboxylase  28.61 
 
 
398 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.764027 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1717  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.8 
 
 
185 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1219  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.25 
 
 
187 aa  124  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0982  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.8 
 
 
185 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0238706  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0964  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.8 
 
 
185 aa  122  7e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5664  phosphonopyruvate decarboxylase  29.34 
 
 
373 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1316  thiamine pyrophosphate enzyme  28.28 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1809  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  27.34 
 
 
399 aa  116  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0361229  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2064  3-phosphonopyruvate decarboxylase  30.46 
 
 
393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0779  3-phosphonopyruvate decarboxylase  30.46 
 
 
393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0690  3-phosphonopyruvate decarboxylase  30.46 
 
 
393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1414  phosphonopyruvate decarboxylase, putative  28.29 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3127  hypothetical protein  40.74 
 
 
213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1909  3-phosphonopyruvate decarboxylase  29.79 
 
 
393 aa  114  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1402  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  38.5 
 
 
184 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00264057 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1623  sulfopyruvate decarboxylase  40.26 
 
 
192 aa  108  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1769  3-phosphonopyruvate decarboxylase  31.91 
 
 
372 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0759  3-phosphonopyruvate decarboxylase  31.91 
 
 
372 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.762667  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1052  3-phosphonopyruvate decarboxylase  31.91 
 
 
372 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1458  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  38.82 
 
 
168 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.454016  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2499  hypothetical protein  35.11 
 
 
202 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1409  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  37.5 
 
 
166 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2977  phosphonopyruvate decarboxylase  26.87 
 
 
392 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1069  hypothetical protein  35.11 
 
 
199 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1227  sulfopyruvate decarboxylase  36.84 
 
 
167 aa  97.4  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.47502  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0499  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  36.18 
 
 
167 aa  96.3  8e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.939895  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5917  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.41 
 
 
198 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854932  normal  0.161715 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0803  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  34.97 
 
 
189 aa  92.8  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1399  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  37.84 
 
 
166 aa  91.7  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.293231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2177  sulfopyruvate decarboxylase  32.43 
 
 
198 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315174  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0477  phosphonopyruvate decarboxylase  25.44 
 
 
384 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6790  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  32.07 
 
 
198 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6125  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.47 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6413  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.47 
 
 
189 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.53225 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0573  phosphonopyruvate decarboxylase  24.11 
 
 
384 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6662  putative sulfopyruvate decarboxylase beta subunit  34.44 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1052  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  33.33 
 
 
196 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1187  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  32.35 
 
 
175 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1401  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  27.63 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00255271 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1051  hypothetical protein  37.4 
 
 
175 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6412  hypothetical protein  34.62 
 
 
178 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.519498 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6124  hypothetical protein  34.62 
 
 
178 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2500  putative decarboxylase  29.49 
 
 
177 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.92042 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1237  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  31.33 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0422665  normal  0.190035 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2070  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  30.72 
 
 
213 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0454462 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5918  hypothetical protein  33.55 
 
 
178 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262351  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6661  putative sulfopyruvate decarboxylase alpha subunit  36.84 
 
 
181 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.984154 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2178  hypothetical protein  32.58 
 
 
179 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6791  hypothetical protein  30.97 
 
 
180 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.384747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3128  putative sulfopyruvate decarboxylase (alpha subunit)  32.77 
 
 
182 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1068  putative sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  29.05 
 
 
182 aa  57  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5426  Sulfopyruvate decarboxylase alpha subunit  30.07 
 
 
166 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5427  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  29.45 
 
 
202 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1238  sulfopyruvate decarboxylase  31.15 
 
 
166 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0616406  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2071  sulfopyruvate decarboxylase  29.66 
 
 
166 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0452585 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  27.78 
 
 
562 aa  50.1  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0802  putative decarboxylase  25.97 
 
 
170 aa  49.7  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0093  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  26.44 
 
 
263 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0843  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.82 
 
 
262 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.044301  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4038  acetolactate synthase catalytic subunit  25.81 
 
 
562 aa  47  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.725928  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3884  acetolactate synthase catalytic subunit  25.56 
 
 
562 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0028  acetolactate synthase catalytic subunit  25.56 
 
 
562 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4248  acetolactate synthase catalytic subunit  25.56 
 
 
562 aa  46.6  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0696  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  45.16 
 
 
280 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4180  acetolactate synthase catalytic subunit  26.11 
 
 
562 aa  46.2  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03555  acetolactate synthase large subunit  25 
 
 
562 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0032  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25 
 
 
562 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4010  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  43.55 
 
 
276 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  26.11 
 
 
562 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03497  hypothetical protein  25 
 
 
562 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0729  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.97 
 
 
267 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.432873  normal  0.0371975 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1420  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  43.55 
 
 
276 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464193  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0620  acetolactate synthase catalytic subunit  26.26 
 
 
554 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1167  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  33.7 
 
 
280 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1750  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, beta subunit  32.26 
 
 
292 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181475  normal  0.121515 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1839  acetolactate synthase catalytic subunit  26.23 
 
 
555 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1948  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  28.3 
 
 
261 aa  44.3  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0727116 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>