80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1409 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1409  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  100 
 
 		 166 aa  339  1e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0499  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  97.59 
 
 		 167 aa  333  5e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.939895  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1227  sulfopyruvate decarboxylase  97.59 
 
 		 167 aa  333  5e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.47502  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1399  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  81.71 
 
 		 166 aa  285  2e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.293231  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1187  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  60.92 
 
 		 175 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1623  sulfopyruvate decarboxylase  55.21 
 
 		 192 aa  189  2e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1458  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  53.01 
 
 		 168 aa  176  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.454016  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1401  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  36.69 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00255271 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2733  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.35 
 
 		 370 aa  106  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1051  hypothetical protein  34.21 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6791  hypothetical protein  36.18 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.384747  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2178  hypothetical protein  35.67 
 
 		 179 aa  100  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5918  hypothetical protein  35.53 
 
 		 178 aa  100  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262351  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3542  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha / sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  37.87 
 
 		 382 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0505956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2117  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  37.5 
 
 		 372 aa  99  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1316  thiamine pyrophosphate enzyme  34.9 
 
 		 384 aa  98.6  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2976  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  36.42 
 
 		 373 aa  94.7  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6661  putative sulfopyruvate decarboxylase alpha subunit  32.03 
 
 		 181 aa  92  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.984154 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5426  Sulfopyruvate decarboxylase alpha subunit  35.06 
 
 		 166 aa  92  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0504  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta / sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  34.57 
 
 		 371 aa  91.7  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3414  phosphonopyruvate decarboxylase protein  33.07 
 
 		 380 aa  91.3  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6124  hypothetical protein  30.92 
 
 		 178 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6412  hypothetical protein  30.92 
 
 		 178 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.519498 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1238  sulfopyruvate decarboxylase  35.71 
 
 		 166 aa  88.6  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0616406  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0112  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.99 
 
 		 373 aa  87.8  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2071  sulfopyruvate decarboxylase  34.92 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0452585 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4120  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.11 
 
 		 398 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4015  phosphonopyruvate decarboxylase  34.11 
 
 		 398 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.764027 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3534  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.11 
 
 		 393 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4246  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  34.11 
 
 		 398 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1915  thiamine pyrophosphate enzyme, putative 3-phosphonopyruvate decarboxylase  34.11 
 
 		 393 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2977  phosphonopyruvate decarboxylase  33.13 
 
 		 392 aa  85.5  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3399  phosphonopyruvate decarboxylase  34.11 
 
 		 398 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4472  phosphonopyruvate decarboxylase  34.96 
 
 		 395 aa  85.1  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110205  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1909  3-phosphonopyruvate decarboxylase  34.17 
 
 		 393 aa  85.1  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2064  3-phosphonopyruvate decarboxylase  35.09 
 
 		 393 aa  84  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0690  3-phosphonopyruvate decarboxylase  35.09 
 
 		 393 aa  84  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0779  3-phosphonopyruvate decarboxylase  35.09 
 
 		 393 aa  84  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1162  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  37.84 
 
 		 370 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1068  putative sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  31.85 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2500  putative decarboxylase  29.11 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.92042 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2234  putative thiamine pyrophosphate enzyme  33.33 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3821  phosphonopyruvate decarboxylase  32.58 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.416111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5998  phosphonopyruvate decarboxylase  32.52 
 
 		 387 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.412851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3128  putative sulfopyruvate decarboxylase (alpha subunit)  37 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1052  3-phosphonopyruvate decarboxylase  34.58 
 
 		 372 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0759  3-phosphonopyruvate decarboxylase  34.58 
 
 		 372 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.762667  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1769  3-phosphonopyruvate decarboxylase  34.58 
 
 		 372 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1414  phosphonopyruvate decarboxylase, putative  37.6 
 
 		 378 aa  76.6  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5664  phosphonopyruvate decarboxylase  31.37 
 
 		 373 aa  72.4  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1809  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  30.6 
 
 		 399 aa  71.6  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0361229  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0817  phosphonopyruvate decarboxylase  32.03 
 
 		 408 aa  64.3  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.438085  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2172  thiamine pyrophosphate enzyme family protein  35.92 
 
 		 721 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.531587  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0909  phosphonopyruvate decarboxylase  32.03 
 
 		 412 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0477  phosphonopyruvate decarboxylase  33.87 
 
 		 384 aa  57.4  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0573  phosphonopyruvate decarboxylase  28.83 
 
 		 384 aa  54.3  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0802  putative decarboxylase  30.11 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1008  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  28.85 
 
 		 598 aa  48.5  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160683  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1389  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  27.74 
 
 		 598 aa  47.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000343744  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7024  hypothetical protein  22.56 
 
 		 565 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0863974  normal  0.0979808 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0537  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  24.68 
 
 		 511 aa  45.4  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2426  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain-containing protein  26.44 
 
 		 585 aa  44.7  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146056  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0057  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  26.54 
 
 		 735 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3809  pyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit, putative  26.44 
 
 		 585 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3786  putative pyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  26.44 
 
 		 585 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00291108 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1426  putative pyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  26.44 
 
 		 585 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.580657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3873  putative pyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  26.44 
 
 		 585 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3821  putative pyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  26.44 
 
 		 585 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.667676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3545  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain-containing protein  26.44 
 
 		 585 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0111808  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3910  pyruvate ferredoxin oxidoreductase subunit alpha  26.44 
 
 		 585 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3533  pyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  26.44 
 
 		 585 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3515  pyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  26.44 
 
 		 585 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3623  pyruvate ferredoxin oxidoreductase subunit alpha  26.44 
 
 		 585 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2300  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, subunit alpha  25 
 
 		 621 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.73042 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2988  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, subunit alpha  27.22 
 
 		 635 aa  41.6  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371879  hitchhiker  0.00474189 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0446  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  24.53 
 
 		 624 aa  41.6  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00317389  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0762  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  31.82 
 
 		 628 aa  41.2  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0058  indolepyruvate oxidoreductase, subunit  25.17 
 
 		 600 aa  40.8  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602223  normal  0.513175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.46 
 
 		 588 aa  40.4  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0314  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain-containing protein  24.34 
 
 		 614 aa  40.4  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553295 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>