108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1915 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1915  thiamine pyrophosphate enzyme, putative 3-phosphonopyruvate decarboxylase  100 
 
 
393 aa  797    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4246  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  93.72 
 
 
398 aa  738    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3534  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  95.17 
 
 
393 aa  766    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4120  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  93.72 
 
 
398 aa  738    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4472  phosphonopyruvate decarboxylase  93.92 
 
 
395 aa  741    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110205  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3399  phosphonopyruvate decarboxylase  93.22 
 
 
398 aa  733    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4015  phosphonopyruvate decarboxylase  93.72 
 
 
398 aa  757    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.764027 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3821  phosphonopyruvate decarboxylase  81.77 
 
 
394 aa  641    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.416111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5998  phosphonopyruvate decarboxylase  81.65 
 
 
387 aa  638    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.412851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2234  putative thiamine pyrophosphate enzyme  81.65 
 
 
387 aa  632  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1909  3-phosphonopyruvate decarboxylase  83.08 
 
 
393 aa  628  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2064  3-phosphonopyruvate decarboxylase  82.05 
 
 
393 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0779  3-phosphonopyruvate decarboxylase  82.05 
 
 
393 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0690  3-phosphonopyruvate decarboxylase  82.05 
 
 
393 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1809  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  79.19 
 
 
399 aa  620  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0361229  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1769  3-phosphonopyruvate decarboxylase  81.03 
 
 
372 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0759  3-phosphonopyruvate decarboxylase  81.03 
 
 
372 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.762667  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1052  3-phosphonopyruvate decarboxylase  81.03 
 
 
372 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1316  thiamine pyrophosphate enzyme  58.53 
 
 
384 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3414  phosphonopyruvate decarboxylase protein  46.83 
 
 
380 aa  329  5.0000000000000004e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2977  phosphonopyruvate decarboxylase  46.33 
 
 
392 aa  325  7e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1414  phosphonopyruvate decarboxylase, putative  36.83 
 
 
378 aa  265  8.999999999999999e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1162  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  38.5 
 
 
370 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5664  phosphonopyruvate decarboxylase  33.93 
 
 
373 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0817  phosphonopyruvate decarboxylase  36.29 
 
 
408 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.438085  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2172  thiamine pyrophosphate enzyme family protein  35.77 
 
 
721 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.531587  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0909  phosphonopyruvate decarboxylase  35.92 
 
 
412 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0477  phosphonopyruvate decarboxylase  31.74 
 
 
384 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0573  phosphonopyruvate decarboxylase  31.57 
 
 
384 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2976  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  29.33 
 
 
373 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2117  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  29.52 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0504  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta / sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  28.46 
 
 
371 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0112  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.81 
 
 
373 aa  126  6e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2733  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.37 
 
 
370 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3542  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha / sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  26.75 
 
 
382 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0505956  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3127  hypothetical protein  35.75 
 
 
213 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0964  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.95 
 
 
185 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0982  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.63 
 
 
185 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0238706  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1219  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.51 
 
 
187 aa  103  6e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1069  hypothetical protein  32.29 
 
 
199 aa  102  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1717  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.87 
 
 
185 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0991  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.43 
 
 
188 aa  101  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1624  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  44.44 
 
 
187 aa  97.1  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1459  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  40.91 
 
 
189 aa  96.3  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.417982  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2499  hypothetical protein  34.36 
 
 
202 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1458  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  34.84 
 
 
168 aa  89.4  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.454016  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1402  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  32.54 
 
 
184 aa  87  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00264057 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1409  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  34.11 
 
 
166 aa  86.3  9e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5917  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.18 
 
 
198 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854932  normal  0.161715 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1399  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  33.6 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.293231  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0499  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  32.56 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.939895  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1227  sulfopyruvate decarboxylase  32.56 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.47502  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0803  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  31.47 
 
 
189 aa  81.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1187  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  30.13 
 
 
175 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6790  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  34.72 
 
 
198 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1237  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  32.64 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0422665  normal  0.190035 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1623  sulfopyruvate decarboxylase  30.63 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6413  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.64 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.53225 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6125  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.71 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5427  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  32.88 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2070  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  32.12 
 
 
213 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0454462 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1052  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  35.66 
 
 
196 aa  71.2  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2177  sulfopyruvate decarboxylase  32.09 
 
 
198 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315174  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1401  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  30 
 
 
168 aa  65.9  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00255271 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1068  putative sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  30.71 
 
 
182 aa  63.9  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2500  putative decarboxylase  27.92 
 
 
177 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.92042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3128  putative sulfopyruvate decarboxylase (alpha subunit)  29.5 
 
 
182 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6661  putative sulfopyruvate decarboxylase alpha subunit  38.1 
 
 
181 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.984154 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6412  hypothetical protein  34.33 
 
 
178 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.519498 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6124  hypothetical protein  34.33 
 
 
178 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1051  hypothetical protein  35.16 
 
 
175 aa  57  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2178  hypothetical protein  37.38 
 
 
179 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6791  hypothetical protein  36.45 
 
 
180 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.384747  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5918  hypothetical protein  37.38 
 
 
178 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262351  normal  0.158251 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5426  Sulfopyruvate decarboxylase alpha subunit  29.13 
 
 
166 aa  53.1  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1238  sulfopyruvate decarboxylase  30.93 
 
 
166 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0616406  normal  0.178604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2071  sulfopyruvate decarboxylase  30.93 
 
 
166 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0452585 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5007  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.71 
 
 
621 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.544612  normal  0.0507111 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4490  acetolactate synthase, large subunit  36.36 
 
 
621 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2119  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.14 
 
 
621 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2710  acetolactate synthase  26.46 
 
 
545 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.404072  hitchhiker  0.0000000454495 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2814  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.63 
 
 
565 aa  47.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6662  putative sulfopyruvate decarboxylase beta subunit  33.14 
 
 
193 aa  47  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2723  thiamine pyrophosphate protein central region  33.04 
 
 
596 aa  47  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1837  acetolactate synthase  32.74 
 
 
553 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2038  acetolactate synthase, large subunit  36.36 
 
 
625 aa  45.8  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.206948  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4788  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  25.43 
 
 
574 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.092848  hitchhiker  0.00966018 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2843  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP bindin  28.89 
 
 
593 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.89479  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0348  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  27.06 
 
 
548 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0624  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.32 
 
 
574 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.146468 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1909  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  43.1 
 
 
561 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000425472  hitchhiker  0.0000717525 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0639  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  42.37 
 
 
593 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0915985  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.81 
 
 
574 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0696  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.31 
 
 
281 aa  43.9  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0217424  normal  0.137282 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0929  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  39.66 
 
 
619 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0902  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  39.66 
 
 
619 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0680  thiamine pyrophosphate requiring enzyme  29.17 
 
 
574 aa  43.5  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1750  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, beta subunit  32.71 
 
 
292 aa  43.5  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181475  normal  0.121515 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2145  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  40 
 
 
562 aa  43.5  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000794715  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1895  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  32.67 
 
 
298 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.168372 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>