More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1459 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1459  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  100 
 
 
189 aa  387  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.417982  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1624  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  59.22 
 
 
187 aa  204  8e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1219  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  51.63 
 
 
187 aa  174  8e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0991  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  52.13 
 
 
188 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0982  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  50.53 
 
 
185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0238706  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0964  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  50.53 
 
 
185 aa  169  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1717  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  50.27 
 
 
185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1402  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  48.5 
 
 
184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00264057 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2117  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  45.36 
 
 
372 aa  148  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3542  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha / sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  42.86 
 
 
382 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0505956  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2976  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  39.78 
 
 
373 aa  137  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0112  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  43.09 
 
 
373 aa  136  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2733  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  43.09 
 
 
370 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0504  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta / sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  41.9 
 
 
371 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1069  hypothetical protein  39.78 
 
 
199 aa  123  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2499  hypothetical protein  40.96 
 
 
202 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3127  hypothetical protein  39.46 
 
 
213 aa  117  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6125  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.24 
 
 
189 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6413  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.24 
 
 
189 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.53225 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2977  phosphonopyruvate decarboxylase  34.07 
 
 
392 aa  108  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1316  thiamine pyrophosphate enzyme  36.56 
 
 
384 aa  105  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1162  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  37.1 
 
 
370 aa  105  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5998  phosphonopyruvate decarboxylase  41.59 
 
 
387 aa  101  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.412851 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3399  phosphonopyruvate decarboxylase  42.73 
 
 
398 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2234  putative thiamine pyrophosphate enzyme  40.71 
 
 
387 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4246  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  42.73 
 
 
398 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4120  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.73 
 
 
398 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0759  3-phosphonopyruvate decarboxylase  42.73 
 
 
372 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.762667  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0779  3-phosphonopyruvate decarboxylase  42.73 
 
 
393 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3821  phosphonopyruvate decarboxylase  33.16 
 
 
394 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.416111 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1769  3-phosphonopyruvate decarboxylase  42.73 
 
 
372 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2177  sulfopyruvate decarboxylase  35.33 
 
 
198 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315174  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2064  3-phosphonopyruvate decarboxylase  42.73 
 
 
393 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1909  3-phosphonopyruvate decarboxylase  42.73 
 
 
393 aa  100  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0690  3-phosphonopyruvate decarboxylase  42.73 
 
 
393 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1052  3-phosphonopyruvate decarboxylase  42.73 
 
 
372 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1052  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  39.74 
 
 
196 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4472  phosphonopyruvate decarboxylase  41.82 
 
 
395 aa  99.4  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110205  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3534  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.82 
 
 
393 aa  97.8  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4015  phosphonopyruvate decarboxylase  40.91 
 
 
398 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.764027 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1915  thiamine pyrophosphate enzyme, putative 3-phosphonopyruvate decarboxylase  40.91 
 
 
393 aa  96.3  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5917  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.76 
 
 
198 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854932  normal  0.161715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3414  phosphonopyruvate decarboxylase protein  35.93 
 
 
380 aa  93.2  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1414  phosphonopyruvate decarboxylase, putative  33.99 
 
 
378 aa  92  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1809  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  39.09 
 
 
399 aa  92  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0361229  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6790  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  35.29 
 
 
198 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5427  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  34.03 
 
 
202 aa  87  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0803  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  44.44 
 
 
189 aa  86.3  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6662  putative sulfopyruvate decarboxylase beta subunit  38 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0817  phosphonopyruvate decarboxylase  42.5 
 
 
408 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.438085  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2172  thiamine pyrophosphate enzyme family protein  42.5 
 
 
721 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.531587  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0909  phosphonopyruvate decarboxylase  42.5 
 
 
412 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5664  phosphonopyruvate decarboxylase  42.57 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2070  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  31.94 
 
 
213 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0454462 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0573  phosphonopyruvate decarboxylase  35.42 
 
 
384 aa  75.5  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0477  phosphonopyruvate decarboxylase  36.29 
 
 
384 aa  74.7  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1237  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  31.25 
 
 
223 aa  74.3  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0422665  normal  0.190035 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0945  thiamine pyrophosphate protein  33.04 
 
 
561 aa  56.2  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1410  thiamine pyrophosphate protein  37.5 
 
 
564 aa  54.7  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372474  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2723  thiamine pyrophosphate protein central region  40.32 
 
 
596 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3608  thiamine pyrophosphate protein central region  27.07 
 
 
669 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.908775  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7802  thiamine pyrophosphate protein central region  30.37 
 
 
612 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.821593  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0670  TPP-requiring enzyme IolD  32.73 
 
 
607 aa  53.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2843  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP bindin  39.13 
 
 
593 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.89479  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0714  TPP-requiring enzyme IolD  32.73 
 
 
607 aa  52.8  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83955  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1650  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.47 
 
 
617 aa  52.4  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.121087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3590  hypothetical protein  32.14 
 
 
541 aa  52.4  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.291615  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1620  acetolactate synthase catalytic subunit  29.41 
 
 
556 aa  52  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.546066  normal  0.5994 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3838  thiamine pyrophosphate protein central region  33 
 
 
607 aa  52  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21480  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  36.17 
 
 
551 aa  52  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1893  thiamine pyrophosphate protein central region  33.93 
 
 
638 aa  51.2  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0289  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.1 
 
 
572 aa  51.2  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.403033  normal  0.363537 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0929  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.26 
 
 
619 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0066  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.77 
 
 
627 aa  50.8  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.354472  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4566  acetolactate synthase  33.93 
 
 
636 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.958598  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0902  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.26 
 
 
619 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1341  thiamine pyrophosphate protein central region  33.93 
 
 
627 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0940  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  33.93 
 
 
627 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  42.62 
 
 
587 aa  50.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1302  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.93 
 
 
627 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1400  thiamine pyrophosphate protein central region  33.93 
 
 
627 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1422  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.93 
 
 
627 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0734  acetolactate synthase catalytic subunit  27.94 
 
 
564 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  34.04 
 
 
570 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  41.94 
 
 
584 aa  50.1  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3550  acetolactate synthase, large subunit  44.26 
 
 
583 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3281  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.75 
 
 
556 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.61 
 
 
602 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0127  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.63 
 
 
593 aa  49.3  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0620  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.93 
 
 
560 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.635865  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1800  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.74 
 
 
626 aa  49.3  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2314  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  33.93 
 
 
612 aa  48.9  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284269  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1631  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  37.88 
 
 
559 aa  49.3  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4038  acetolactate synthase catalytic subunit  27.21 
 
 
562 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.725928  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1883  acetolactate synthase catalytic subunit  31.62 
 
 
615 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4491  thiamine pyrophosphate protein central region  29.19 
 
 
637 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0431429  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1601  thiamine pyrophosphate protein central region  34.26 
 
 
649 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392192  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0428  acetolactate synthase  40.98 
 
 
583 aa  48.5  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1404  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  29.84 
 
 
581 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2941  benzoylformate decarboxylase  39.71 
 
 
528 aa  48.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>