More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1932 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  100 
 
 		 570 aa  1179    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0945  thiamine pyrophosphate protein  55.96 
 
 		 561 aa  629  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1410  thiamine pyrophosphate protein  55.38 
 
 		 564 aa  631  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372474  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  56.86 
 
 		 568 aa  612  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1228  thiamine pyrophosphate protein  53.47 
 
 		 575 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299499  normal  0.940009 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1291  thiamine pyrophosphate protein  53.01 
 
 		 575 aa  589  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0542091  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3016  thiamine pyrophosphate protein  54.04 
 
 		 566 aa  589  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3885  thiamine pyrophosphate protein  54.2 
 
 		 572 aa  588  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0051  thiamine pyrophosphate protein  54.82 
 
 		 574 aa  588  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1353  thiamine pyrophosphate protein  54.66 
 
 		 581 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2121  thiamine pyrophosphate protein  52.64 
 
 		 548 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.299662 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3250  thiamine pyrophosphate protein  54.32 
 
 		 567 aa  569  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492745  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0138  thiamine pyrophosphate protein  54.68 
 
 		 567 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0133  thiamine pyrophosphate protein  54.4 
 
 		 567 aa  568  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.377635  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3318  thiamine pyrophosphate protein  54.05 
 
 		 567 aa  568  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2917  thiamine pyrophosphate protein  54.86 
 
 		 567 aa  568  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0138  thiamine pyrophosphate protein  54.86 
 
 		 567 aa  568  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0136  thiamine pyrophosphate protein  54.13 
 
 		 567 aa  565  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3933  thiamine pyrophosphate protein  54.23 
 
 		 567 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2989  thiamine pyrophosphate protein  54.23 
 
 		 567 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0152  thiamine pyrophosphate protein  54.5 
 
 		 567 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1548  thiamine pyrophosphate protein  54.23 
 
 		 567 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  51.55 
 
 		 549 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2117  thiamine pyrophosphate protein  53.47 
 
 		 556 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.925616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3054  thiamine pyrophosphate protein  54.23 
 
 		 567 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0128  thiamine pyrophosphate protein  53.6 
 
 		 567 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0427824  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4004  thiamine pyrophosphate protein  54.23 
 
 		 567 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3316  thiamine pyrophosphate protein  54.23 
 
 		 567 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  52.79 
 
 		 552 aa  558  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2625  thiamine pyrophosphate protein  51.09 
 
 		 555 aa  559  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  52.34 
 
 		 552 aa  561  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3275  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  52.54 
 
 		 559 aa  560  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0313  thiamine pyrophosphate protein  50.72 
 
 		 557 aa  557  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2263  thiamine pyrophosphate protein  52.53 
 
 		 572 aa  558  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.00000136096  unclonable  0.000000016429 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1643  thiamine pyrophosphate protein  52.32 
 
 		 559 aa  552  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1497  thiamine pyrophosphate protein  51.79 
 
 		 582 aa  548  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2795  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  52.23 
 
 		 572 aa  551  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.595093 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2885  thiamine pyrophosphate protein  50.27 
 
 		 552 aa  551  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1636  thiamine pyrophosphate protein  51.25 
 
 		 559 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0789  thiamine pyrophosphate protein  50.89 
 
 		 564 aa  551  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000306468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2933  thiamine pyrophosphate protein  50.91 
 
 		 550 aa  547  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0998  thiamine pyrophosphate protein  49.46 
 
 		 559 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.79453  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1062  acetolactate synthase, large subunit  49.64 
 
 		 556 aa  548  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0882  thiamine pyrophosphate protein  49.46 
 
 		 558 aa  543  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0284  thiamine pyrophosphate protein  52.08 
 
 		 576 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0633  thiamine pyrophosphate protein  52.29 
 
 		 553 aa  540  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151923  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1620  thiamine pyrophosphate protein  49.65 
 
 		 567 aa  536  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.738779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1340  thiamine pyrophosphate protein  49.73 
 
 		 565 aa  537  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2520  thiamine pyrophosphate protein  49.55 
 
 		 565 aa  536  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121235 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2817  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  49.01 
 
 		 570 aa  523  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2213  Fis family transcriptional regulator  48.85 
 
 		 580 aa  523  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.851331  normal  0.770524 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5061  thiamine pyrophosphate protein  50.89 
 
 		 567 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  0.490143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4600  thiamine pyrophosphate protein  50.71 
 
 		 567 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879686 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1101  thiamine pyrophosphate protein  48.74 
 
 		 559 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.805378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1264  thiamine pyrophosphate protein  51.09 
 
 		 558 aa  512  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  47.77 
 
 		 567 aa  512  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2607  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  49.55 
 
 		 558 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6522  thiamine pyrophosphate protein  49.82 
 
 		 561 aa  498  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1865  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  46.9 
 
 		 572 aa  495  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6728  thiamine pyrophosphate protein  49.82 
 
 		 566 aa  498  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988038  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1557  acetolactate synthase large subunit  47.83 
 
 		 564 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1163  thiamine pyrophosphate protein  44.5 
 
 		 568 aa  477  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0137  thiamine pyrophosphate protein  44.57 
 
 		 538 aa  464  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  39.14 
 
 		 552 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  40.37 
 
 		 551 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3550  acetolactate synthase, large subunit  41.75 
 
 		 583 aa  378  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21480  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  40.07 
 
 		 551 aa  365  1e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2477  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  39.23 
 
 		 543 aa  362  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1115  putative acetolactate synthase large subunit  39.36 
 
 		 586 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0471394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0664  putative pyruvate decarboxylase  37.33 
 
 		 561 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1114  putative pyruvate decarboxylase  38.06 
 
 		 587 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2955  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.15 
 
 		 565 aa  319  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.836437  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0915  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  38.33 
 
 		 560 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0036  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.62 
 
 		 543 aa  297  4e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.78 
 
 		 588 aa  274  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30 
 
 		 586 aa  272  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1921  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.01 
 
 		 576 aa  269  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.299558 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2864  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.73 
 
 		 659 aa  257  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0639  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.65 
 
 		 593 aa  250  4e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0915985  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3813  acetolactate synthase catalytic subunit  31.68 
 
 		 554 aa  250  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3419  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.17 
 
 		 579 aa  249  7e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.130634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.07 
 
 		 548 aa  249  7e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.96 
 
 		 548 aa  249  7e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  31.31 
 
 		 554 aa  248  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30 
 
 		 588 aa  248  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.91 
 
 		 574 aa  248  3e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  28.7 
 
 		 572 aa  247  4e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.74 
 
 		 563 aa  247  4e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2652  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.64 
 
 		 586 aa  247  4e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2862  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.29 
 
 		 564 aa  245  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1090  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  31.04 
 
 		 598 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  32.17 
 
 		 554 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.66 
 
 		 548 aa  243  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  31.32 
 
 		 566 aa  243  5e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.5 
 
 		 572 aa  243  7e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1928  acetolactate synthase  31.42 
 
 		 545 aa  243  7e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886275  normal  0.0286883 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.66 
 
 		 548 aa  243  7.999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.25 
 
 		 612 aa  242  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.72 
 
 		 569 aa  241  2e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  29.3 
 
 		 566 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>