More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2121 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1643  thiamine pyrophosphate protein  60.69 
 
 		 559 aa  653    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2625  thiamine pyrophosphate protein  79.96 
 
 		 555 aa  912    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0998  thiamine pyrophosphate protein  57.25 
 
 		 559 aa  645    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.79453  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0882  thiamine pyrophosphate protein  59.52 
 
 		 558 aa  669    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2117  thiamine pyrophosphate protein  60.07 
 
 		 556 aa  642    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.925616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  72.63 
 
 		 549 aa  820    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1410  thiamine pyrophosphate protein  57.3 
 
 		 564 aa  636    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372474  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2121  thiamine pyrophosphate protein  100 
 
 		 548 aa  1118    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.299662 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2885  thiamine pyrophosphate protein  79.96 
 
 		 552 aa  912    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2933  thiamine pyrophosphate protein  77.84 
 
 		 550 aa  890    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1340  thiamine pyrophosphate protein  60.69 
 
 		 565 aa  676    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0313  thiamine pyrophosphate protein  60.88 
 
 		 557 aa  684    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2263  thiamine pyrophosphate protein  61.36 
 
 		 572 aa  679    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.00000136096  unclonable  0.000000016429 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2520  thiamine pyrophosphate protein  60.51 
 
 		 565 aa  675    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121235 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0789  thiamine pyrophosphate protein  61.97 
 
 		 564 aa  687    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000306468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1264  thiamine pyrophosphate protein  61.24 
 
 		 558 aa  628  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3016  thiamine pyrophosphate protein  56.91 
 
 		 566 aa  629  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1101  thiamine pyrophosphate protein  57.33 
 
 		 559 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.805378  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0945  thiamine pyrophosphate protein  54.83 
 
 		 561 aa  612  9.999999999999999e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0136  thiamine pyrophosphate protein  57.3 
 
 		 567 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0051  thiamine pyrophosphate protein  56.1 
 
 		 574 aa  610  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0138  thiamine pyrophosphate protein  56.18 
 
 		 567 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6728  thiamine pyrophosphate protein  57.88 
 
 		 566 aa  608  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988038  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0152  thiamine pyrophosphate protein  56.39 
 
 		 567 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2917  thiamine pyrophosphate protein  56.39 
 
 		 567 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0138  thiamine pyrophosphate protein  56.39 
 
 		 567 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3885  thiamine pyrophosphate protein  55.37 
 
 		 572 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3250  thiamine pyrophosphate protein  56.02 
 
 		 567 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492745  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0128  thiamine pyrophosphate protein  55.84 
 
 		 567 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0427824  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1228  thiamine pyrophosphate protein  55.78 
 
 		 575 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299499  normal  0.940009 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1291  thiamine pyrophosphate protein  56.19 
 
 		 575 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0542091  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3318  thiamine pyrophosphate protein  56.02 
 
 		 567 aa  599  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6522  thiamine pyrophosphate protein  58.53 
 
 		 561 aa  598  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5061  thiamine pyrophosphate protein  56.59 
 
 		 567 aa  597  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  0.490143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4600  thiamine pyrophosphate protein  56.59 
 
 		 567 aa  596  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879686 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0133  thiamine pyrophosphate protein  55.29 
 
 		 567 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.377635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2989  thiamine pyrophosphate protein  55.29 
 
 		 567 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1548  thiamine pyrophosphate protein  55.29 
 
 		 567 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  53.58 
 
 		 552 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4004  thiamine pyrophosphate protein  55.29 
 
 		 567 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0633  thiamine pyrophosphate protein  55.7 
 
 		 553 aa  585  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151923  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3054  thiamine pyrophosphate protein  55.29 
 
 		 567 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3933  thiamine pyrophosphate protein  55.29 
 
 		 567 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3316  thiamine pyrophosphate protein  55.29 
 
 		 567 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1353  thiamine pyrophosphate protein  56.44 
 
 		 581 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1062  acetolactate synthase, large subunit  51.85 
 
 		 556 aa  578  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  53.64 
 
 		 568 aa  573  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  52.64 
 
 		 570 aa  567  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  52.11 
 
 		 552 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3275  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  53.01 
 
 		 559 aa  560  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2795  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  51.89 
 
 		 572 aa  546  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.595093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1620  thiamine pyrophosphate protein  51.45 
 
 		 567 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.738779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1636  thiamine pyrophosphate protein  50.91 
 
 		 559 aa  536  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1497  thiamine pyrophosphate protein  50.91 
 
 		 582 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2817  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  50.36 
 
 		 570 aa  530  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2607  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  51.01 
 
 		 558 aa  524  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0284  thiamine pyrophosphate protein  49.64 
 
 		 576 aa  518  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2213  Fis family transcriptional regulator  49.19 
 
 		 580 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.851331  normal  0.770524 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0137  thiamine pyrophosphate protein  48.79 
 
 		 538 aa  514  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1557  acetolactate synthase large subunit  49.91 
 
 		 564 aa  501  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  46.95 
 
 		 567 aa  501  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1865  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  48.93 
 
 		 572 aa  486  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1163  thiamine pyrophosphate protein  45.44 
 
 		 568 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  40.95 
 
 		 552 aa  432  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  41.17 
 
 		 551 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21480  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  39.33 
 
 		 551 aa  358  1.9999999999999998e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2477  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  40.36 
 
 		 543 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3550  acetolactate synthase, large subunit  40.19 
 
 		 583 aa  355  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2955  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.02 
 
 		 565 aa  354  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.836437  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0664  putative pyruvate decarboxylase  37.59 
 
 		 561 aa  351  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0036  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.77 
 
 		 543 aa  315  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0915  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  38.31 
 
 		 560 aa  312  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1115  putative acetolactate synthase large subunit  37.93 
 
 		 586 aa  307  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0471394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1114  putative pyruvate decarboxylase  37.55 
 
 		 587 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.51 
 
 		 586 aa  283  5.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.5 
 
 		 588 aa  278  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.33 
 
 		 548 aa  276  9e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.27 
 
 		 574 aa  273  8.000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.9 
 
 		 548 aa  272  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4291  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.33 
 
 		 548 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.03 
 
 		 562 aa  263  6e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.71 
 
 		 554 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4126  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.33 
 
 		 548 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  33.45 
 
 		 620 aa  262  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4232  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.33 
 
 		 548 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.96 
 
 		 548 aa  261  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4183  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.33 
 
 		 548 aa  262  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.224573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4111  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.33 
 
 		 548 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.16 
 
 		 593 aa  261  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.15 
 
 		 548 aa  261  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.3 
 
 		 552 aa  260  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  32.24 
 
 		 555 aa  260  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2256  acetolactate synthase, large subunit  32.24 
 
 		 560 aa  259  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4279  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.61 
 
 		 548 aa  257  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.92 
 
 		 573 aa  257  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274178  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2769  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.43 
 
 		 604 aa  256  8e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.28 
 
 		 566 aa  256  8e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.51 
 
 		 564 aa  256  9e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4015  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.84 
 
 		 548 aa  255  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565502 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03595  hypothetical protein  30.61 
 
 		 548 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0633614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>