More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0998 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2121  thiamine pyrophosphate protein  57.25 
 
 		 548 aa  649    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.299662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6522  thiamine pyrophosphate protein  71.4 
 
 		 561 aa  743    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2520  thiamine pyrophosphate protein  60.22 
 
 		 565 aa  667    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121235 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2625  thiamine pyrophosphate protein  56.33 
 
 		 555 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1340  thiamine pyrophosphate protein  60.58 
 
 		 565 aa  670    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0313  thiamine pyrophosphate protein  58.48 
 
 		 557 aa  652    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1643  thiamine pyrophosphate protein  62.09 
 
 		 559 aa  667    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1264  thiamine pyrophosphate protein  63.07 
 
 		 558 aa  640    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0998  thiamine pyrophosphate protein  100 
 
 		 559 aa  1139    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.79453  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5061  thiamine pyrophosphate protein  67.03 
 
 		 567 aa  707    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  0.490143 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0882  thiamine pyrophosphate protein  57.81 
 
 		 558 aa  655    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4600  thiamine pyrophosphate protein  67.03 
 
 		 567 aa  707    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879686 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1101  thiamine pyrophosphate protein  91.95 
 
 		 559 aa  1005    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.805378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0789  thiamine pyrophosphate protein  60.51 
 
 		 564 aa  667    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000306468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  59.45 
 
 		 549 aa  661    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2885  thiamine pyrophosphate protein  56.88 
 
 		 552 aa  646    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6728  thiamine pyrophosphate protein  72.05 
 
 		 566 aa  761    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988038  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2263  thiamine pyrophosphate protein  60.65 
 
 		 572 aa  666    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.00000136096  unclonable  0.000000016429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2117  thiamine pyrophosphate protein  57.07 
 
 		 556 aa  632  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.925616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2933  thiamine pyrophosphate protein  56.78 
 
 		 550 aa  625  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1410  thiamine pyrophosphate protein  54.88 
 
 		 564 aa  610  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372474  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0945  thiamine pyrophosphate protein  54.07 
 
 		 561 aa  595  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  53.8 
 
 		 552 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0138  thiamine pyrophosphate protein  54.48 
 
 		 567 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0152  thiamine pyrophosphate protein  53.71 
 
 		 567 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2917  thiamine pyrophosphate protein  53.75 
 
 		 567 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0138  thiamine pyrophosphate protein  53.75 
 
 		 567 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1062  acetolactate synthase, large subunit  50.55 
 
 		 556 aa  550  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0128  thiamine pyrophosphate protein  53.75 
 
 		 567 aa  550  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0427824  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3016  thiamine pyrophosphate protein  50.46 
 
 		 566 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2795  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  52.56 
 
 		 572 aa  545  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.595093 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3318  thiamine pyrophosphate protein  54.11 
 
 		 567 aa  548  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3250  thiamine pyrophosphate protein  52.06 
 
 		 567 aa  545  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492745  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  49.46 
 
 		 570 aa  547  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  51.27 
 
 		 552 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3275  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  52.33 
 
 		 559 aa  546  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0136  thiamine pyrophosphate protein  53.27 
 
 		 567 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1620  thiamine pyrophosphate protein  51.52 
 
 		 567 aa  541  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.738779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0133  thiamine pyrophosphate protein  52.63 
 
 		 567 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.377635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4004  thiamine pyrophosphate protein  52.63 
 
 		 567 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2989  thiamine pyrophosphate protein  52.63 
 
 		 567 aa  535  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1228  thiamine pyrophosphate protein  49.82 
 
 		 575 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299499  normal  0.940009 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0051  thiamine pyrophosphate protein  51.09 
 
 		 574 aa  534  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3316  thiamine pyrophosphate protein  52.63 
 
 		 567 aa  535  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3933  thiamine pyrophosphate protein  52.63 
 
 		 567 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3054  thiamine pyrophosphate protein  52.63 
 
 		 567 aa  535  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1548  thiamine pyrophosphate protein  52.63 
 
 		 567 aa  535  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1291  thiamine pyrophosphate protein  50.8 
 
 		 575 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0542091  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3885  thiamine pyrophosphate protein  50.18 
 
 		 572 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0633  thiamine pyrophosphate protein  51.85 
 
 		 553 aa  526  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151923  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1353  thiamine pyrophosphate protein  50.63 
 
 		 581 aa  525  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1497  thiamine pyrophosphate protein  51.27 
 
 		 582 aa  524  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1636  thiamine pyrophosphate protein  51.2 
 
 		 559 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  48.13 
 
 		 568 aa  509  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0284  thiamine pyrophosphate protein  47.65 
 
 		 576 aa  501  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2817  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  46.38 
 
 		 570 aa  498  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1557  acetolactate synthase large subunit  47.42 
 
 		 564 aa  490  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2607  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  49.18 
 
 		 558 aa  491  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2213  Fis family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 580 aa  485  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.851331  normal  0.770524 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  47.12 
 
 		 567 aa  479  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0137  thiamine pyrophosphate protein  46.73 
 
 		 538 aa  474  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1865  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  47.16 
 
 		 572 aa  465  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1163  thiamine pyrophosphate protein  45.36 
 
 		 568 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  41.58 
 
 		 552 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  40.93 
 
 		 551 aa  405  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21480  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  38.96 
 
 		 551 aa  370  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3550  acetolactate synthase, large subunit  38.5 
 
 		 583 aa  364  2e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2477  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  40.33 
 
 		 543 aa  359  9e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0915  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  40.79 
 
 		 560 aa  345  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2955  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.22 
 
 		 565 aa  340  4e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.836437  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0664  putative pyruvate decarboxylase  37.48 
 
 		 561 aa  330  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0036  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.98 
 
 		 543 aa  306  6e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1114  putative pyruvate decarboxylase  35.62 
 
 		 587 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1115  putative acetolactate synthase large subunit  35.62 
 
 		 586 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0471394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.01 
 
 		 552 aa  265  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.84 
 
 		 548 aa  253  7e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.15 
 
 		 569 aa  253  8.000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.58 
 
 		 586 aa  252  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.85 
 
 		 588 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.6 
 
 		 553 aa  251  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.54 
 
 		 548 aa  249  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.93 
 
 		 564 aa  248  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4165  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.02 
 
 		 557 aa  248  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  30.63 
 
 		 566 aa  247  4e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.78 
 
 		 548 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  30.11 
 
 		 562 aa  246  8e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.6 
 
 		 548 aa  244  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0345  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.9 
 
 		 569 aa  244  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0918871  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.99 
 
 		 572 aa  243  6e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  30.47 
 
 		 555 aa  243  6e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.65 
 
 		 574 aa  243  9e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.08 
 
 		 554 aa  241  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2864  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.08 
 
 		 659 aa  242  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3934  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.34 
 
 		 557 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4128  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.34 
 
 		 557 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.74 
 
 		 562 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.6 
 
 		 588 aa  240  5e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  30.77 
 
 		 554 aa  240  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0442  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.78 
 
 		 562 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.58 
 
 		 554 aa  239  8e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>