More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4600 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1264  thiamine pyrophosphate protein  63.32 
 
 		 558 aa  635    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2885  thiamine pyrophosphate protein  57.35 
 
 		 552 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1643  thiamine pyrophosphate protein  61.74 
 
 		 559 aa  663    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5061  thiamine pyrophosphate protein  99.47 
 
 		 567 aa  1139    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  0.490143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6522  thiamine pyrophosphate protein  77.36 
 
 		 561 aa  802    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6728  thiamine pyrophosphate protein  75.86 
 
 		 566 aa  800    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988038  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0998  thiamine pyrophosphate protein  67.03 
 
 		 559 aa  744    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.79453  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0882  thiamine pyrophosphate protein  57.04 
 
 		 558 aa  637    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1101  thiamine pyrophosphate protein  66.79 
 
 		 559 aa  722    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.805378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  60.62 
 
 		 549 aa  669    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4600  thiamine pyrophosphate protein  100 
 
 		 567 aa  1143    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879686 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2625  thiamine pyrophosphate protein  56.99 
 
 		 555 aa  634  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2117  thiamine pyrophosphate protein  60.36 
 
 		 556 aa  633  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.925616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1340  thiamine pyrophosphate protein  58.98 
 
 		 565 aa  632  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2263  thiamine pyrophosphate protein  58.96 
 
 		 572 aa  634  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.00000136096  unclonable  0.000000016429 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0789  thiamine pyrophosphate protein  59.17 
 
 		 564 aa  634  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000306468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2121  thiamine pyrophosphate protein  56.59 
 
 		 548 aa  628  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.299662 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2520  thiamine pyrophosphate protein  58.8 
 
 		 565 aa  630  1e-179  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121235 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0313  thiamine pyrophosphate protein  57.35 
 
 		 557 aa  630  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2933  thiamine pyrophosphate protein  56.75 
 
 		 550 aa  626  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1410  thiamine pyrophosphate protein  53.31 
 
 		 564 aa  585  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372474  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0128  thiamine pyrophosphate protein  55.58 
 
 		 567 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0427824  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0138  thiamine pyrophosphate protein  56.67 
 
 		 567 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3016  thiamine pyrophosphate protein  52.92 
 
 		 566 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0136  thiamine pyrophosphate protein  55.22 
 
 		 567 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0152  thiamine pyrophosphate protein  55.04 
 
 		 567 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2917  thiamine pyrophosphate protein  55.94 
 
 		 567 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0138  thiamine pyrophosphate protein  55.94 
 
 		 567 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0945  thiamine pyrophosphate protein  52.72 
 
 		 561 aa  571  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3318  thiamine pyrophosphate protein  56.11 
 
 		 567 aa  569  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3250  thiamine pyrophosphate protein  54.5 
 
 		 567 aa  570  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492745  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0133  thiamine pyrophosphate protein  54.85 
 
 		 567 aa  565  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.377635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2989  thiamine pyrophosphate protein  54.67 
 
 		 567 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3316  thiamine pyrophosphate protein  54.67 
 
 		 567 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3933  thiamine pyrophosphate protein  54.67 
 
 		 567 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4004  thiamine pyrophosphate protein  54.67 
 
 		 567 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3054  thiamine pyrophosphate protein  54.67 
 
 		 567 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1548  thiamine pyrophosphate protein  54.67 
 
 		 567 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0051  thiamine pyrophosphate protein  51.66 
 
 		 574 aa  554  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1291  thiamine pyrophosphate protein  54.03 
 
 		 575 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0542091  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1228  thiamine pyrophosphate protein  52.77 
 
 		 575 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299499  normal  0.940009 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3885  thiamine pyrophosphate protein  52 
 
 		 572 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1062  acetolactate synthase, large subunit  51.11 
 
 		 556 aa  548  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1353  thiamine pyrophosphate protein  53.87 
 
 		 581 aa  542  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  50.45 
 
 		 570 aa  543  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0633  thiamine pyrophosphate protein  54.71 
 
 		 553 aa  542  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151923  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  53.33 
 
 		 552 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2817  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  50.27 
 
 		 570 aa  535  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2795  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  52.24 
 
 		 572 aa  531  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.595093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  51.85 
 
 		 552 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1620  thiamine pyrophosphate protein  50 
 
 		 567 aa  518  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.738779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1636  thiamine pyrophosphate protein  51.64 
 
 		 559 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3275  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  50.72 
 
 		 559 aa  519  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2213  Fis family transcriptional regulator  49.73 
 
 		 580 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.851331  normal  0.770524 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0284  thiamine pyrophosphate protein  49.82 
 
 		 576 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  49.1 
 
 		 568 aa  516  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1497  thiamine pyrophosphate protein  51.79 
 
 		 582 aa  513  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1557  acetolactate synthase large subunit  49.73 
 
 		 564 aa  513  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2607  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  49.18 
 
 		 558 aa  481  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1163  thiamine pyrophosphate protein  45.07 
 
 		 568 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1865  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  47.23 
 
 		 572 aa  467  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0137  thiamine pyrophosphate protein  47.3 
 
 		 538 aa  459  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  45.6 
 
 		 567 aa  458  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  40.79 
 
 		 552 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  41.85 
 
 		 551 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21480  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  40.47 
 
 		 551 aa  375  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3550  acetolactate synthase, large subunit  41.76 
 
 		 583 aa  368  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2477  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  38.62 
 
 		 543 aa  339  7e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2955  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.78 
 
 		 565 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.836437  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0664  putative pyruvate decarboxylase  38.22 
 
 		 561 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0915  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  39.06 
 
 		 560 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0036  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.24 
 
 		 543 aa  293  5e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1115  putative acetolactate synthase large subunit  36.28 
 
 		 586 aa  289  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0471394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1114  putative pyruvate decarboxylase  35.68 
 
 		 587 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0289  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  35.33 
 
 		 572 aa  268  2.9999999999999995e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.403033  normal  0.363537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.81 
 
 		 586 aa  266  7e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4291  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.56 
 
 		 548 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4126  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.56 
 
 		 548 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4183  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.56 
 
 		 548 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.224573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4232  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.56 
 
 		 548 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.09 
 
 		 548 aa  261  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4128  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.15 
 
 		 557 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4111  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.38 
 
 		 548 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3934  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.15 
 
 		 557 aa  261  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4009  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.77 
 
 		 557 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4031  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.96 
 
 		 557 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.4 
 
 		 548 aa  258  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0356  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.96 
 
 		 557 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4347  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.77 
 
 		 552 aa  254  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3664  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.77 
 
 		 551 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32 
 
 		 602 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.15 
 
 		 548 aa  253  5.000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.99 
 
 		 574 aa  253  6e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0442  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.52 
 
 		 562 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.78 
 
 		 548 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4279  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.43 
 
 		 548 aa  251  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.8 
 
 		 562 aa  251  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4152  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.44 
 
 		 548 aa  251  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03646  acetolactate synthase II, valine insensitive, large subunit  31.61 
 
 		 548 aa  250  5e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0646243  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03595  hypothetical protein  31.61 
 
 		 548 aa  250  5e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0633614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>