More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1291 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1291  thiamine pyrophosphate protein  100 
 
 
575 aa  1177    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0542091  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1353  thiamine pyrophosphate protein  86.99 
 
 
581 aa  1017    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0945  thiamine pyrophosphate protein  58.71 
 
 
561 aa  662    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2817  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  57.53 
 
 
570 aa  642    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2213  Fis family transcriptional regulator  58.02 
 
 
580 aa  641    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.851331  normal  0.770524 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1410  thiamine pyrophosphate protein  59.09 
 
 
564 aa  674    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372474  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1228  thiamine pyrophosphate protein  96.7 
 
 
575 aa  1143    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299499  normal  0.940009 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3016  thiamine pyrophosphate protein  57.25 
 
 
566 aa  629  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0138  thiamine pyrophosphate protein  58.6 
 
 
567 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0152  thiamine pyrophosphate protein  58.05 
 
 
567 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0051  thiamine pyrophosphate protein  57.22 
 
 
574 aa  626  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2917  thiamine pyrophosphate protein  58.42 
 
 
567 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0138  thiamine pyrophosphate protein  58.42 
 
 
567 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0136  thiamine pyrophosphate protein  58.6 
 
 
567 aa  626  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0128  thiamine pyrophosphate protein  58.42 
 
 
567 aa  624  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0427824  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1865  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  57.79 
 
 
572 aa  622  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3885  thiamine pyrophosphate protein  57.04 
 
 
572 aa  620  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3318  thiamine pyrophosphate protein  58.06 
 
 
567 aa  615  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3250  thiamine pyrophosphate protein  56.76 
 
 
567 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492745  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2121  thiamine pyrophosphate protein  56.19 
 
 
548 aa  608  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.299662 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3054  thiamine pyrophosphate protein  56.76 
 
 
567 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2989  thiamine pyrophosphate protein  56.76 
 
 
567 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0133  thiamine pyrophosphate protein  56.76 
 
 
567 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.377635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3316  thiamine pyrophosphate protein  56.76 
 
 
567 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3933  thiamine pyrophosphate protein  56.76 
 
 
567 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4004  thiamine pyrophosphate protein  56.76 
 
 
567 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1548  thiamine pyrophosphate protein  56.76 
 
 
567 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  55.99 
 
 
568 aa  597  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2933  thiamine pyrophosphate protein  53.76 
 
 
550 aa  592  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  52.78 
 
 
570 aa  594  1e-168  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  54.41 
 
 
549 aa  588  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2625  thiamine pyrophosphate protein  53.57 
 
 
555 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2885  thiamine pyrophosphate protein  53.21 
 
 
552 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1340  thiamine pyrophosphate protein  54.22 
 
 
565 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2520  thiamine pyrophosphate protein  54.22 
 
 
565 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121235 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2795  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  55.22 
 
 
572 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.595093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2263  thiamine pyrophosphate protein  54.19 
 
 
572 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.00000136096  unclonable  0.000000016429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1557  acetolactate synthase large subunit  53.62 
 
 
564 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153426  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  54.07 
 
 
552 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1062  acetolactate synthase, large subunit  52.67 
 
 
556 aa  568  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0313  thiamine pyrophosphate protein  52.58 
 
 
557 aa  564  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1497  thiamine pyrophosphate protein  53.42 
 
 
582 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1643  thiamine pyrophosphate protein  54.17 
 
 
559 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1636  thiamine pyrophosphate protein  53.55 
 
 
559 aa  553  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929542  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0789  thiamine pyrophosphate protein  53.24 
 
 
564 aa  555  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000306468  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0882  thiamine pyrophosphate protein  50.72 
 
 
558 aa  551  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  52.7 
 
 
552 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1620  thiamine pyrophosphate protein  51.6 
 
 
567 aa  548  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.738779  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2117  thiamine pyrophosphate protein  53.91 
 
 
556 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.925616  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0998  thiamine pyrophosphate protein  49.65 
 
 
559 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.79453  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1264  thiamine pyrophosphate protein  53.57 
 
 
558 aa  531  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0284  thiamine pyrophosphate protein  49.91 
 
 
576 aa  530  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4600  thiamine pyrophosphate protein  54.03 
 
 
567 aa  528  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0879686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5061  thiamine pyrophosphate protein  53.85 
 
 
567 aa  526  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  0.490143 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0633  thiamine pyrophosphate protein  53.36 
 
 
553 aa  528  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151923  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3275  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  50 
 
 
559 aa  525  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6728  thiamine pyrophosphate protein  51.89 
 
 
566 aa  512  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988038  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2607  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  51.35 
 
 
558 aa  509  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6522  thiamine pyrophosphate protein  52.33 
 
 
561 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1101  thiamine pyrophosphate protein  49.73 
 
 
559 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.805378  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1163  thiamine pyrophosphate protein  47.6 
 
 
568 aa  498  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256596  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  47.33 
 
 
567 aa  494  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0137  thiamine pyrophosphate protein  48.29 
 
 
538 aa  487  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239979  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  42.4 
 
 
552 aa  435  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  41.4 
 
 
551 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2477  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  39.86 
 
 
543 aa  359  9.999999999999999e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21480  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  39.37 
 
 
551 aa  353  5e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3550  acetolactate synthase, large subunit  38.42 
 
 
583 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0664  putative pyruvate decarboxylase  38.28 
 
 
561 aa  332  9e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2955  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.64 
 
 
565 aa  324  3e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.836437  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0915  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  39.82 
 
 
560 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0036  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.33 
 
 
543 aa  311  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1114  putative pyruvate decarboxylase  37.43 
 
 
587 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1115  putative acetolactate synthase large subunit  36.03 
 
 
586 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0471394  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.86 
 
 
586 aa  273  6e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  32.85 
 
 
566 aa  267  4e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.44 
 
 
548 aa  263  6.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.59 
 
 
588 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.42 
 
 
574 aa  261  2e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.09 
 
 
612 aa  261  3e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.26 
 
 
548 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.66 
 
 
548 aa  257  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.45 
 
 
581 aa  256  6e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4988  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.39 
 
 
619 aa  256  8e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.26 
 
 
567 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.27 
 
 
581 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1165  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.69 
 
 
561 aa  254  3e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4126  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.64 
 
 
548 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4291  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.46 
 
 
548 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4111  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.46 
 
 
548 aa  253  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.31 
 
 
561 aa  252  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4232  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.46 
 
 
548 aa  253  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.04 
 
 
548 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4183  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.46 
 
 
548 aa  252  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.224573  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.21 
 
 
552 aa  249  7e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.43 
 
 
572 aa  249  9e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.57 
 
 
573 aa  249  9e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  31.57 
 
 
587 aa  249  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.07 
 
 
564 aa  249  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4015  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.41 
 
 
548 aa  248  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565502 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>