More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0137 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0137  thiamine pyrophosphate protein  100 
 
 
538 aa  1107    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239979  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0633  thiamine pyrophosphate protein  57.36 
 
 
553 aa  587  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151923  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  49.91 
 
 
549 aa  514  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2121  thiamine pyrophosphate protein  48.79 
 
 
548 aa  514  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.299662 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2933  thiamine pyrophosphate protein  47.51 
 
 
550 aa  497  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2625  thiamine pyrophosphate protein  47.52 
 
 
555 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2885  thiamine pyrophosphate protein  47.52 
 
 
552 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1228  thiamine pyrophosphate protein  48.47 
 
 
575 aa  488  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299499  normal  0.940009 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2117  thiamine pyrophosphate protein  48.51 
 
 
556 aa  485  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.925616  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1291  thiamine pyrophosphate protein  47.76 
 
 
575 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0542091  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3275  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  47.04 
 
 
559 aa  478  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1410  thiamine pyrophosphate protein  46.49 
 
 
564 aa  468  9.999999999999999e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372474  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0998  thiamine pyrophosphate protein  46.05 
 
 
559 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.79453  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  44.18 
 
 
570 aa  464  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1353  thiamine pyrophosphate protein  47.64 
 
 
581 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1620  thiamine pyrophosphate protein  44.44 
 
 
567 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.738779  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  44.32 
 
 
552 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0945  thiamine pyrophosphate protein  44.95 
 
 
561 aa  457  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0136  thiamine pyrophosphate protein  47.74 
 
 
567 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2917  thiamine pyrophosphate protein  47.46 
 
 
567 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0138  thiamine pyrophosphate protein  47.99 
 
 
567 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0138  thiamine pyrophosphate protein  47.46 
 
 
567 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1643  thiamine pyrophosphate protein  47.91 
 
 
559 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3016  thiamine pyrophosphate protein  45.96 
 
 
566 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0152  thiamine pyrophosphate protein  47.57 
 
 
567 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0128  thiamine pyrophosphate protein  47.51 
 
 
567 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0427824  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0313  thiamine pyrophosphate protein  45.02 
 
 
557 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2263  thiamine pyrophosphate protein  45.77 
 
 
572 aa  442  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.00000136096  unclonable  0.000000016429 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3318  thiamine pyrophosphate protein  47.61 
 
 
567 aa  445  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0882  thiamine pyrophosphate protein  43.96 
 
 
558 aa  442  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1101  thiamine pyrophosphate protein  45.85 
 
 
559 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.805378  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3885  thiamine pyrophosphate protein  45.4 
 
 
572 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  42.7 
 
 
568 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4600  thiamine pyrophosphate protein  46.86 
 
 
567 aa  435  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0879686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5061  thiamine pyrophosphate protein  46.86 
 
 
567 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  0.490143 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  42.45 
 
 
552 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3250  thiamine pyrophosphate protein  47.13 
 
 
567 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492745  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0051  thiamine pyrophosphate protein  44.83 
 
 
574 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3933  thiamine pyrophosphate protein  47.32 
 
 
567 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3054  thiamine pyrophosphate protein  47.32 
 
 
567 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2989  thiamine pyrophosphate protein  47.32 
 
 
567 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0133  thiamine pyrophosphate protein  47.51 
 
 
567 aa  435  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.377635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4004  thiamine pyrophosphate protein  47.32 
 
 
567 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3316  thiamine pyrophosphate protein  47.32 
 
 
567 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1340  thiamine pyrophosphate protein  43.93 
 
 
565 aa  433  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1548  thiamine pyrophosphate protein  47.32 
 
 
567 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2795  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  44.38 
 
 
572 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.595093 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2607  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  45.94 
 
 
558 aa  431  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1062  acetolactate synthase, large subunit  43.63 
 
 
556 aa  429  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2520  thiamine pyrophosphate protein  43.73 
 
 
565 aa  431  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121235 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0789  thiamine pyrophosphate protein  43.69 
 
 
564 aa  426  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000306468  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  43.35 
 
 
567 aa  427  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1636  thiamine pyrophosphate protein  44.09 
 
 
559 aa  425  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929542  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1264  thiamine pyrophosphate protein  45.89 
 
 
558 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1497  thiamine pyrophosphate protein  44.07 
 
 
582 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0284  thiamine pyrophosphate protein  43.65 
 
 
576 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2817  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  42.4 
 
 
570 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1557  acetolactate synthase large subunit  43.72 
 
 
564 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153426  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1865  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  44.11 
 
 
572 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2213  Fis family transcriptional regulator  43.21 
 
 
580 aa  415  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.851331  normal  0.770524 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6522  thiamine pyrophosphate protein  47.13 
 
 
561 aa  412  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6728  thiamine pyrophosphate protein  45.08 
 
 
566 aa  411  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988038  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1163  thiamine pyrophosphate protein  40.73 
 
 
568 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256596  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  37.32 
 
 
552 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  39.43 
 
 
551 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21480  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  38.59 
 
 
551 aa  348  2e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3550  acetolactate synthase, large subunit  38.43 
 
 
583 aa  344  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2477  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  37.94 
 
 
543 aa  336  7e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0036  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.52 
 
 
543 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0664  putative pyruvate decarboxylase  36.48 
 
 
561 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0915  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  36.7 
 
 
560 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2955  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.01 
 
 
565 aa  291  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.836437  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1115  putative acetolactate synthase large subunit  33.82 
 
 
586 aa  257  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0471394  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.19 
 
 
586 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1921  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.13 
 
 
576 aa  251  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.299558 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.32 
 
 
588 aa  243  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1114  putative pyruvate decarboxylase  33.88 
 
 
587 aa  242  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.87 
 
 
553 aa  239  8e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3430  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.58 
 
 
574 aa  237  4e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.646845  normal  0.0217288 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  30.78 
 
 
566 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0748  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31 
 
 
572 aa  235  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.651563  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00556  acetolactate synthase III large subunit  31.28 
 
 
572 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.83 
 
 
566 aa  234  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0624  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.15 
 
 
572 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2270  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.02 
 
 
576 aa  233  8.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  30.08 
 
 
562 aa  231  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2018  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.41 
 
 
573 aa  231  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.801766  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0624  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.43 
 
 
574 aa  231  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.146468 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.9 
 
 
554 aa  231  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3531  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.95 
 
 
575 aa  230  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.57 
 
 
554 aa  230  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3401  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.95 
 
 
575 aa  230  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2932  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.95 
 
 
593 aa  229  8e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  30 
 
 
578 aa  229  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  29.9 
 
 
566 aa  229  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.85 
 
 
557 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3236  acetolactate synthase III, large subunit, biosynthetic type  29.58 
 
 
575 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00702842  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0527  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.89 
 
 
608 aa  228  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.41 
 
 
561 aa  228  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1973  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.39 
 
 
572 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417395  hitchhiker  0.0000255584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>