More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3550 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_21480  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  78.15 
 
 		 551 aa  884    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3550  acetolactate synthase, large subunit  100 
 
 		 583 aa  1187    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2607  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  49.53 
 
 		 558 aa  464  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0633  thiamine pyrophosphate protein  45.9 
 
 		 553 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151923  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0945  thiamine pyrophosphate protein  41.4 
 
 		 561 aa  393  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1410  thiamine pyrophosphate protein  42.07 
 
 		 564 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372474  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1636  thiamine pyrophosphate protein  42.1 
 
 		 559 aa  385  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  42.31 
 
 		 570 aa  383  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1497  thiamine pyrophosphate protein  43.7 
 
 		 582 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0284  thiamine pyrophosphate protein  43.3 
 
 		 576 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0998  thiamine pyrophosphate protein  39.29 
 
 		 559 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.79453  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0882  thiamine pyrophosphate protein  39.52 
 
 		 558 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0313  thiamine pyrophosphate protein  40.04 
 
 		 557 aa  372  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  41.41 
 
 		 549 aa  372  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  40.37 
 
 		 552 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  39.89 
 
 		 552 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2213  Fis family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 580 aa  368  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.851331  normal  0.770524 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1643  thiamine pyrophosphate protein  41.4 
 
 		 559 aa  369  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2263  thiamine pyrophosphate protein  41.73 
 
 		 572 aa  368  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.00000136096  unclonable  0.000000016429 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2817  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  39.93 
 
 		 570 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0051  thiamine pyrophosphate protein  41.54 
 
 		 574 aa  369  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2121  thiamine pyrophosphate protein  40.55 
 
 		 548 aa  365  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.299662 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0789  thiamine pyrophosphate protein  39.48 
 
 		 564 aa  364  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000306468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  39.67 
 
 		 568 aa  363  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2885  thiamine pyrophosphate protein  41.22 
 
 		 552 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3275  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.6 
 
 		 559 aa  361  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0138  thiamine pyrophosphate protein  40.55 
 
 		 567 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2117  thiamine pyrophosphate protein  40.78 
 
 		 556 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.925616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3016  thiamine pyrophosphate protein  39.77 
 
 		 566 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2917  thiamine pyrophosphate protein  41.03 
 
 		 567 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1062  acetolactate synthase, large subunit  38.75 
 
 		 556 aa  355  8.999999999999999e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0138  thiamine pyrophosphate protein  41.03 
 
 		 567 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1340  thiamine pyrophosphate protein  39.33 
 
 		 565 aa  355  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3250  thiamine pyrophosphate protein  40.96 
 
 		 567 aa  354  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492745  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4600  thiamine pyrophosphate protein  41.52 
 
 		 567 aa  355  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879686 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2625  thiamine pyrophosphate protein  40.08 
 
 		 555 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0152  thiamine pyrophosphate protein  40.84 
 
 		 567 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2520  thiamine pyrophosphate protein  38.96 
 
 		 565 aa  353  4e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121235 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0128  thiamine pyrophosphate protein  40.52 
 
 		 567 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0427824  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5061  thiamine pyrophosphate protein  41.33 
 
 		 567 aa  352  1e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  0.490143 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3885  thiamine pyrophosphate protein  40.38 
 
 		 572 aa  351  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3318  thiamine pyrophosphate protein  40.63 
 
 		 567 aa  350  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0137  thiamine pyrophosphate protein  38.82 
 
 		 538 aa  350  4e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0136  thiamine pyrophosphate protein  40.22 
 
 		 567 aa  349  9e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0133  thiamine pyrophosphate protein  40.56 
 
 		 567 aa  346  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.377635  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1865  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  41.12 
 
 		 572 aa  346  5e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1264  thiamine pyrophosphate protein  42.22 
 
 		 558 aa  346  8e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2933  thiamine pyrophosphate protein  38.48 
 
 		 550 aa  345  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1101  thiamine pyrophosphate protein  39.41 
 
 		 559 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.805378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3316  thiamine pyrophosphate protein  40.56 
 
 		 567 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3933  thiamine pyrophosphate protein  40.56 
 
 		 567 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1548  thiamine pyrophosphate protein  40.56 
 
 		 567 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2989  thiamine pyrophosphate protein  40.56 
 
 		 567 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3054  thiamine pyrophosphate protein  40.56 
 
 		 567 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4004  thiamine pyrophosphate protein  40.56 
 
 		 567 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6728  thiamine pyrophosphate protein  40.96 
 
 		 566 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988038  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1228  thiamine pyrophosphate protein  37.99 
 
 		 575 aa  343  7e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299499  normal  0.940009 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2795  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.78 
 
 		 572 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.595093 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1291  thiamine pyrophosphate protein  38.63 
 
 		 575 aa  339  9e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0542091  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1353  thiamine pyrophosphate protein  39.54 
 
 		 581 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1620  thiamine pyrophosphate protein  37.29 
 
 		 567 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.738779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  38.41 
 
 		 567 aa  337  5e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1557  acetolactate synthase large subunit  40.07 
 
 		 564 aa  333  7.000000000000001e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6522  thiamine pyrophosphate protein  40.97 
 
 		 561 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1163  thiamine pyrophosphate protein  36.68 
 
 		 568 aa  323  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  35.73 
 
 		 552 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  35.38 
 
 		 551 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0664  putative pyruvate decarboxylase  35.03 
 
 		 561 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0915  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  36.19 
 
 		 560 aa  260  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0036  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.82 
 
 		 543 aa  258  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2477  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  32.62 
 
 		 543 aa  252  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2955  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.97 
 
 		 565 aa  250  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.836437  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.9 
 
 		 548 aa  238  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.22 
 
 		 586 aa  231  3e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4134  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.9 
 
 		 548 aa  228  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.82212  normal  0.957886 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4152  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.21 
 
 		 548 aa  228  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1115  putative acetolactate synthase large subunit  31.01 
 
 		 586 aa  227  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0471394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4015  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.04 
 
 		 548 aa  226  6e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00565502 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03646  acetolactate synthase II, valine insensitive, large subunit  31.53 
 
 		 548 aa  226  7e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0646243  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03595  hypothetical protein  31.53 
 
 		 548 aa  226  7e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0633614  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.53 
 
 		 548 aa  226  9e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4279  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.16 
 
 		 548 aa  226  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4126  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.78 
 
 		 548 aa  225  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4183  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.78 
 
 		 548 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.224573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4291  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.6 
 
 		 548 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3985  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.34 
 
 		 548 aa  224  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4234  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.34 
 
 		 548 aa  224  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.194744  normal  0.310929 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4232  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.6 
 
 		 548 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4111  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.6 
 
 		 548 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0289  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.21 
 
 		 572 aa  221  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.403033  normal  0.363537 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.57 
 
 		 548 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.46 
 
 		 572 aa  216  8e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.73 
 
 		 553 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.16 
 
 		 548 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.54 
 
 		 562 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  28.74 
 
 		 542 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1114  putative pyruvate decarboxylase  30.46 
 
 		 587 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0345  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  29.5 
 
 		 569 aa  213  9e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0918871  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4760  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.35 
 
 		 548 aa  212  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  31.16 
 
 		 548 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>