More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3318 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0138  thiamine pyrophosphate protein  97 
 
 
567 aa  1097    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3016  thiamine pyrophosphate protein  77.39 
 
 
566 aa  897    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0945  thiamine pyrophosphate protein  60.84 
 
 
561 aa  669    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4004  thiamine pyrophosphate protein  87.43 
 
 
567 aa  965    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3885  thiamine pyrophosphate protein  79.68 
 
 
572 aa  890    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2989  thiamine pyrophosphate protein  87.43 
 
 
567 aa  965    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0133  thiamine pyrophosphate protein  87.43 
 
 
567 aa  966    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.377635  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3318  thiamine pyrophosphate protein  100 
 
 
567 aa  1152    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3250  thiamine pyrophosphate protein  88.14 
 
 
567 aa  986    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492745  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0051  thiamine pyrophosphate protein  78.42 
 
 
574 aa  889    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1548  thiamine pyrophosphate protein  87.43 
 
 
567 aa  965    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3933  thiamine pyrophosphate protein  87.43 
 
 
567 aa  965    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2917  thiamine pyrophosphate protein  97.17 
 
 
567 aa  1099    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0136  thiamine pyrophosphate protein  96.29 
 
 
567 aa  1088    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0128  thiamine pyrophosphate protein  97.17 
 
 
567 aa  1098    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0427824  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0138  thiamine pyrophosphate protein  97.17 
 
 
567 aa  1099    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3054  thiamine pyrophosphate protein  87.43 
 
 
567 aa  965    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0152  thiamine pyrophosphate protein  96.64 
 
 
567 aa  1093    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1410  thiamine pyrophosphate protein  60.47 
 
 
564 aa  677    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372474  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3316  thiamine pyrophosphate protein  87.43 
 
 
567 aa  965    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1228  thiamine pyrophosphate protein  57.09 
 
 
575 aa  626  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299499  normal  0.940009 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1291  thiamine pyrophosphate protein  58.06 
 
 
575 aa  623  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0542091  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2121  thiamine pyrophosphate protein  56.02 
 
 
548 aa  617  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.299662 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2885  thiamine pyrophosphate protein  56.06 
 
 
552 aa  615  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2625  thiamine pyrophosphate protein  55.23 
 
 
555 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1353  thiamine pyrophosphate protein  58.48 
 
 
581 aa  611  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2795  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  58.61 
 
 
572 aa  600  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.595093 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2933  thiamine pyrophosphate protein  55.07 
 
 
550 aa  592  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0882  thiamine pyrophosphate protein  55.84 
 
 
558 aa  592  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  55.54 
 
 
549 aa  593  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2263  thiamine pyrophosphate protein  57.53 
 
 
572 aa  593  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.00000136096  unclonable  0.000000016429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0313  thiamine pyrophosphate protein  55.56 
 
 
557 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1062  acetolactate synthase, large subunit  54.53 
 
 
556 aa  586  1e-166  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  53.94 
 
 
570 aa  581  1e-164  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  55.07 
 
 
568 aa  577  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1643  thiamine pyrophosphate protein  56.88 
 
 
559 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0789  thiamine pyrophosphate protein  54.72 
 
 
564 aa  576  1.0000000000000001e-163  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000306468  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1340  thiamine pyrophosphate protein  53.7 
 
 
565 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2117  thiamine pyrophosphate protein  57.65 
 
 
556 aa  568  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.925616  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2520  thiamine pyrophosphate protein  53.35 
 
 
565 aa  570  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4600  thiamine pyrophosphate protein  56.11 
 
 
567 aa  566  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0879686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5061  thiamine pyrophosphate protein  56.11 
 
 
567 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  0.490143 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0998  thiamine pyrophosphate protein  54.11 
 
 
559 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.79453  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1264  thiamine pyrophosphate protein  56.12 
 
 
558 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1497  thiamine pyrophosphate protein  56.96 
 
 
582 aa  558  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1557  acetolactate synthase large subunit  54.68 
 
 
564 aa  558  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153426  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1636  thiamine pyrophosphate protein  55.52 
 
 
559 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929542  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0633  thiamine pyrophosphate protein  55.99 
 
 
553 aa  557  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151923  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  54.93 
 
 
552 aa  554  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  55.45 
 
 
552 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2817  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  51.44 
 
 
570 aa  548  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1101  thiamine pyrophosphate protein  53.24 
 
 
559 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.805378  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6728  thiamine pyrophosphate protein  54.5 
 
 
566 aa  542  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988038  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1620  thiamine pyrophosphate protein  52.71 
 
 
567 aa  544  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.738779  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6522  thiamine pyrophosphate protein  55.58 
 
 
561 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3275  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  54.46 
 
 
559 aa  538  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2213  Fis family transcriptional regulator  50.82 
 
 
580 aa  532  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.851331  normal  0.770524 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1865  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  52.17 
 
 
572 aa  528  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0284  thiamine pyrophosphate protein  52.01 
 
 
576 aa  528  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1163  thiamine pyrophosphate protein  49.1 
 
 
568 aa  504  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256596  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2607  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  50.82 
 
 
558 aa  498  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  49.82 
 
 
567 aa  501  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0137  thiamine pyrophosphate protein  47.61 
 
 
538 aa  465  1e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239979  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  40.91 
 
 
552 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  41.45 
 
 
551 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21480  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  40.29 
 
 
551 aa  369  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2477  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  42.36 
 
 
543 aa  369  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3550  acetolactate synthase, large subunit  40.89 
 
 
583 aa  368  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0664  putative pyruvate decarboxylase  39.27 
 
 
561 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1115  putative acetolactate synthase large subunit  41.25 
 
 
586 aa  352  7e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0471394  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1114  putative pyruvate decarboxylase  41.05 
 
 
587 aa  343  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0915  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  39.93 
 
 
560 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2955  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.01 
 
 
565 aa  330  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.836437  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0036  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.15 
 
 
543 aa  301  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.05 
 
 
588 aa  270  4e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.82 
 
 
586 aa  268  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  31.45 
 
 
566 aa  267  4e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.82 
 
 
564 aa  259  7e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.66 
 
 
555 aa  258  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.1 
 
 
561 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.18 
 
 
602 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  29.1 
 
 
572 aa  251  2e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.5 
 
 
612 aa  250  4e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.2 
 
 
563 aa  250  6e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.42 
 
 
572 aa  249  1e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.75 
 
 
574 aa  249  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.8 
 
 
552 aa  248  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6128  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.42 
 
 
579 aa  247  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.8 
 
 
562 aa  247  4.9999999999999997e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4291  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.06 
 
 
548 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  29.93 
 
 
566 aa  246  9e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4232  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.06 
 
 
548 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4183  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.06 
 
 
548 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.224573  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.66 
 
 
563 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.28 
 
 
563 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4111  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.06 
 
 
548 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.07 
 
 
588 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4126  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  30.06 
 
 
548 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1642  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.27 
 
 
618 aa  244  3.9999999999999997e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132379  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.7 
 
 
569 aa  243  5e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>