More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3127 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3127  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  433  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2499  hypothetical protein  67.02 
 
 
202 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1069  hypothetical protein  63.54 
 
 
199 aa  244  6e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1624  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.12 
 
 
187 aa  121  9e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1459  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  39.46 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.417982  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2117  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  40.74 
 
 
372 aa  114  6.9999999999999995e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0982  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.22 
 
 
185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0238706  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0964  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.22 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1717  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.16 
 
 
185 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3534  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.23 
 
 
393 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1915  thiamine pyrophosphate enzyme, putative 3-phosphonopyruvate decarboxylase  35.75 
 
 
393 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4472  phosphonopyruvate decarboxylase  34.36 
 
 
395 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110205  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4015  phosphonopyruvate decarboxylase  34.34 
 
 
398 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.764027 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6125  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.35 
 
 
189 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6413  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.77 
 
 
189 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.53225 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3414  phosphonopyruvate decarboxylase protein  35.98 
 
 
380 aa  105  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2977  phosphonopyruvate decarboxylase  34.83 
 
 
392 aa  105  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1219  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.32 
 
 
187 aa  105  5e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5917  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.1 
 
 
198 aa  105  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854932  normal  0.161715 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2234  putative thiamine pyrophosphate enzyme  33.51 
 
 
387 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3399  phosphonopyruvate decarboxylase  32.99 
 
 
398 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0803  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  38.33 
 
 
189 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5998  phosphonopyruvate decarboxylase  32.46 
 
 
387 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.412851 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4246  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  31.82 
 
 
398 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4120  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.82 
 
 
398 aa  102  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1162  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  39.73 
 
 
370 aa  102  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0991  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.02 
 
 
188 aa  101  7e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1769  3-phosphonopyruvate decarboxylase  40.15 
 
 
372 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2064  3-phosphonopyruvate decarboxylase  40.15 
 
 
393 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0690  3-phosphonopyruvate decarboxylase  40.15 
 
 
393 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0779  3-phosphonopyruvate decarboxylase  40.15 
 
 
393 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0759  3-phosphonopyruvate decarboxylase  40.15 
 
 
372 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.762667  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1052  3-phosphonopyruvate decarboxylase  40.15 
 
 
372 aa  101  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1909  3-phosphonopyruvate decarboxylase  39.39 
 
 
393 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1809  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  30.35 
 
 
399 aa  99.8  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0361229  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3821  phosphonopyruvate decarboxylase  34.57 
 
 
394 aa  98.6  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.416111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6790  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  35.26 
 
 
198 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1402  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  34.46 
 
 
184 aa  95.1  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00264057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1237  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  36.96 
 
 
223 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0422665  normal  0.190035 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0112  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.83 
 
 
373 aa  93.2  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2976  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  38.1 
 
 
373 aa  93.6  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2070  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  36.41 
 
 
213 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0454462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3542  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha / sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  33.86 
 
 
382 aa  92.8  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0505956  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0504  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta / sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  37.5 
 
 
371 aa  93.2  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1414  phosphonopyruvate decarboxylase, putative  33.78 
 
 
378 aa  92.4  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2177  sulfopyruvate decarboxylase  34.73 
 
 
198 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315174  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1052  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  34.52 
 
 
196 aa  89.7  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5427  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  36.81 
 
 
202 aa  89  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1316  thiamine pyrophosphate enzyme  32.11 
 
 
384 aa  86.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5664  phosphonopyruvate decarboxylase  35.57 
 
 
373 aa  85.1  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0477  phosphonopyruvate decarboxylase  37.41 
 
 
384 aa  84  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2733  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.04 
 
 
370 aa  82  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0573  phosphonopyruvate decarboxylase  37.41 
 
 
384 aa  82  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0817  phosphonopyruvate decarboxylase  31.75 
 
 
408 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.438085  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0909  phosphonopyruvate decarboxylase  31.75 
 
 
412 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2172  thiamine pyrophosphate enzyme family protein  33.33 
 
 
721 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.531587  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6662  putative sulfopyruvate decarboxylase beta subunit  45.76 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0620  acetolactate synthase catalytic subunit  39.06 
 
 
554 aa  68.6  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  38.28 
 
 
554 aa  66.2  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0734  acetolactate synthase catalytic subunit  33.33 
 
 
564 aa  66.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1620  acetolactate synthase catalytic subunit  31.96 
 
 
556 aa  65.1  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.546066  normal  0.5994 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2814  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.72 
 
 
565 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3813  acetolactate synthase catalytic subunit  29.78 
 
 
554 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1950  acetolactate synthase catalytic subunit  33.59 
 
 
555 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1839  acetolactate synthase catalytic subunit  33.59 
 
 
555 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1240  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.06 
 
 
580 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  33.83 
 
 
562 aa  59.7  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0680  thiamine pyrophosphate requiring enzyme  27.42 
 
 
574 aa  59.7  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4111  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  27.59 
 
 
548 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4291  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  27.53 
 
 
548 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4183  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  27.53 
 
 
548 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.224573  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4232  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  27.59 
 
 
548 aa  59.3  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4126  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  27.59 
 
 
548 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4038  acetolactate synthase catalytic subunit  32.33 
 
 
562 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.725928  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0438  acetolactate synthase large subunit  27.27 
 
 
570 aa  58.5  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.597749 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  29.21 
 
 
554 aa  58.2  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3884  acetolactate synthase catalytic subunit  32.33 
 
 
562 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0028  acetolactate synthase catalytic subunit  32.33 
 
 
562 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4180  acetolactate synthase catalytic subunit  32.33 
 
 
562 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4248  acetolactate synthase catalytic subunit  32.33 
 
 
562 aa  58.2  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3550  acetolactate synthase, large subunit  41.9 
 
 
583 aa  58.2  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03555  acetolactate synthase large subunit  32.33 
 
 
562 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0032  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.33 
 
 
562 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4459  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  34.5 
 
 
566 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.325037  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03497  hypothetical protein  32.33 
 
 
562 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  32.33 
 
 
562 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.127246 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03646  acetolactate synthase II, valine insensitive, large subunit  28.76 
 
 
548 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0646243  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03595  hypothetical protein  28.76 
 
 
548 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0633614  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.76 
 
 
548 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2723  thiamine pyrophosphate protein central region  34.65 
 
 
596 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4152  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.76 
 
 
548 aa  57  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4279  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.76 
 
 
548 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.64 
 
 
628 aa  57.4  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.662359  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1410  thiamine pyrophosphate protein  29.47 
 
 
564 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372474  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4134  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  28.1 
 
 
548 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.82212  normal  0.957886 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1883  acetolactate synthase catalytic subunit  36.59 
 
 
615 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4015  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  27.45 
 
 
548 aa  55.5  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565502 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0945  thiamine pyrophosphate protein  30.1 
 
 
561 aa  55.5  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3281  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  27.84 
 
 
556 aa  55.5  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1536  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  31.12 
 
 
582 aa  55.5  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>