More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0438 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0438  acetolactate synthase large subunit  100 
 
 
570 aa  1184    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.597749 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0680  thiamine pyrophosphate requiring enzyme  81.93 
 
 
574 aa  996    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2814  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  60.11 
 
 
565 aa  721    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2038  acetolactate synthase, large subunit  40.03 
 
 
625 aa  437  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.206948  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  40.27 
 
 
628 aa  436  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.662359  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2119  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  39.39 
 
 
621 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4490  acetolactate synthase, large subunit  39.05 
 
 
621 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5007  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  39.05 
 
 
621 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.544612  normal  0.0507111 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  38.66 
 
 
571 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  38.77 
 
 
573 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  37.59 
 
 
570 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  37.59 
 
 
570 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1966  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  38.42 
 
 
571 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.107455  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  37.59 
 
 
570 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  37.59 
 
 
570 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1934  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  37.72 
 
 
571 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1707  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  37.79 
 
 
571 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.57 
 
 
569 aa  370  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  37.83 
 
 
570 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  36.86 
 
 
562 aa  363  4e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.65 
 
 
563 aa  363  6e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  36.01 
 
 
548 aa  360  4e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0147  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  36.8 
 
 
558 aa  358  9.999999999999999e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.62 
 
 
555 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  35.54 
 
 
548 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.38 
 
 
563 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  35.18 
 
 
548 aa  355  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  35.87 
 
 
574 aa  354  2e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  35.65 
 
 
548 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4165  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  35.71 
 
 
557 aa  353  5e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1488  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.2 
 
 
601 aa  352  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  37.48 
 
 
573 aa  351  2e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000302703  decreased coverage  0.000148215 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.96 
 
 
582 aa  351  2e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  37.35 
 
 
562 aa  349  6e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4760  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  36.61 
 
 
548 aa  349  7e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2374  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  37.28 
 
 
572 aa  349  7e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343911  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1973  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  37.28 
 
 
572 aa  349  8e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.417395  hitchhiker  0.0000255584 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0624  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.68 
 
 
572 aa  349  8e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  35.74 
 
 
593 aa  348  1e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  34.46 
 
 
565 aa  348  1e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2490  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  37.28 
 
 
572 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.156428  hitchhiker  0.00098132 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.58 
 
 
554 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  36.01 
 
 
612 aa  348  2e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2386  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  37.54 
 
 
572 aa  348  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0890713  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1628  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  36.24 
 
 
572 aa  348  2e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1955  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  36.79 
 
 
618 aa  347  3e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.11 
 
 
562 aa  347  3e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.8 
 
 
566 aa  347  4e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  35.85 
 
 
587 aa  347  4e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.74 
 
 
562 aa  347  4e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01970  acetolactate synthase, large subunit  35.7 
 
 
622 aa  346  5e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00241919  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  34.45 
 
 
566 aa  347  5e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0345  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  34.11 
 
 
569 aa  347  5e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0918871  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1776  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  36.79 
 
 
573 aa  346  6e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2279  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  36.73 
 
 
572 aa  346  7e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.04 
 
 
566 aa  346  8e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.3 
 
 
553 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1165  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  35.04 
 
 
561 aa  345  8.999999999999999e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03555  acetolactate synthase large subunit  35.46 
 
 
562 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0032  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.46 
 
 
562 aa  345  1e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03497  hypothetical protein  35.46 
 
 
562 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4248  acetolactate synthase catalytic subunit  35.46 
 
 
562 aa  345  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2982  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.96 
 
 
572 aa  345  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000024883  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3024  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.96 
 
 
572 aa  345  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000501065  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.63 
 
 
555 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3884  acetolactate synthase catalytic subunit  35.46 
 
 
562 aa  344  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1406  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.01 
 
 
593 aa  345  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.345903  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0028  acetolactate synthase catalytic subunit  35.46 
 
 
562 aa  344  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05821  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  36.2 
 
 
587 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.449821  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2138  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  36.2 
 
 
572 aa  343  4e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.803808  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.94 
 
 
559 aa  343  5e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2018  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  36.54 
 
 
573 aa  343  5e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.801766  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4180  acetolactate synthase catalytic subunit  35.28 
 
 
562 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.18 
 
 
570 aa  343  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  34.94 
 
 
554 aa  343  7e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4038  acetolactate synthase catalytic subunit  35.28 
 
 
562 aa  343  7e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.725928  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1750  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  36.73 
 
 
572 aa  342  8e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.524546  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  36.57 
 
 
557 aa  342  1e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.44 
 
 
566 aa  342  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.8 
 
 
566 aa  342  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2122  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  36.16 
 
 
572 aa  342  1e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  35.46 
 
 
562 aa  342  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1830  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  36.73 
 
 
572 aa  342  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2269  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  36.73 
 
 
572 aa  342  1e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0105  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.56 
 
 
568 aa  341  2e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180923  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4077  acetolactate synthase catalytic subunit  35.28 
 
 
562 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00556  acetolactate synthase III large subunit  34.97 
 
 
572 aa  342  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4185  acetolactate synthase catalytic subunit  35.28 
 
 
562 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0474  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.45 
 
 
585 aa  341  2e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4006  acetolactate synthase catalytic subunit  35.28 
 
 
562 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277464  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  34.88 
 
 
563 aa  342  2e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4127  acetolactate synthase catalytic subunit  35.28 
 
 
562 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  35.22 
 
 
636 aa  341  2e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2558  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.21 
 
 
566 aa  341  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0505809  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0442  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  34.46 
 
 
562 aa  341  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.91 
 
 
564 aa  341  2e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  33.57 
 
 
566 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0522  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  35.9 
 
 
570 aa  340  2.9999999999999998e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.96739  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4022  acetolactate synthase catalytic subunit  35.28 
 
 
562 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.38 
 
 
563 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>