More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1406 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1650  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.28 
 
 
617 aa  635    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.121087 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1406  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  100 
 
 
593 aa  1224    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.345903  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_51596  predicted protein  54.47 
 
 
610 aa  605  1.0000000000000001e-171  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.355056  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2028  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.99 
 
 
591 aa  596  1e-169  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103551  normal  0.0583023 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.53 
 
 
569 aa  554  1e-156  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.38 
 
 
566 aa  546  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.4 
 
 
555 aa  545  1e-154  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.44 
 
 
553 aa  542  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.04 
 
 
566 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  47.79 
 
 
566 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.1 
 
 
554 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1488  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.13 
 
 
601 aa  537  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203194  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.79 
 
 
566 aa  533  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.71 
 
 
565 aa  534  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.11 
 
 
563 aa  532  1e-150  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0898  acetolactate synthase, large subunit  45.63 
 
 
564 aa  531  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.52 
 
 
562 aa  531  1e-149  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.06 
 
 
552 aa  530  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2558  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.53 
 
 
566 aa  531  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0505809  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.83 
 
 
558 aa  527  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  48.35 
 
 
567 aa  527  1e-148  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.62 
 
 
582 aa  526  1e-148  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.61 
 
 
566 aa  528  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.75 
 
 
562 aa  528  1e-148  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5448  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  44.52 
 
 
592 aa  525  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404549  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.78 
 
 
612 aa  525  1e-147  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1978  acetolactate synthase, large subunit  46.34 
 
 
568 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.59 
 
 
570 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1900  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.34 
 
 
568 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  47.16 
 
 
562 aa  522  1e-147  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.17 
 
 
566 aa  522  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5323  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  43.03 
 
 
591 aa  521  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.196754  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.28 
 
 
602 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4073  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.92 
 
 
623 aa  521  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24876  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  44.79 
 
 
564 aa  519  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.26 
 
 
563 aa  521  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.38 
 
 
593 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2420  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.16 
 
 
586 aa  518  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438184  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2343  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  43.49 
 
 
592 aa  514  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2464  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.16 
 
 
585 aa  514  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0927747  normal  0.484681 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.88 
 
 
571 aa  512  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5349  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  43.71 
 
 
591 aa  513  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4864  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  43.71 
 
 
591 aa  514  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0239  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  44.65 
 
 
592 aa  514  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1985  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46 
 
 
568 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1909  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  47.33 
 
 
561 aa  513  1e-144  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000425472  hitchhiker  0.0000717525 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.93 
 
 
559 aa  512  1e-144  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3351  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.36 
 
 
601 aa  513  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1488  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.26 
 
 
600 aa  514  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181787  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  44.67 
 
 
563 aa  509  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.54 
 
 
570 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.71 
 
 
570 aa  510  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.54 
 
 
570 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3009  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  43.8 
 
 
585 aa  511  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.161058 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.54 
 
 
570 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5404  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  43.37 
 
 
591 aa  511  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.589591  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.67 
 
 
573 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1389  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  42.59 
 
 
584 aa  506  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0317493  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.5 
 
 
556 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0634  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.93 
 
 
567 aa  506  9.999999999999999e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.876407  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1804  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  43.24 
 
 
607 aa  508  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516088  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.67 
 
 
557 aa  508  9.999999999999999e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6087  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.19 
 
 
589 aa  507  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0902  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.88 
 
 
619 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2008  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  42.86 
 
 
592 aa  506  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901977  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0752  acetolactate synthase, large subunit  46.55 
 
 
569 aa  508  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1966  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.71 
 
 
571 aa  504  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.107455  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1346  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  42.42 
 
 
584 aa  504  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0313448  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1090  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  45.47 
 
 
598 aa  504  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.38 
 
 
588 aa  504  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2520  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  45.93 
 
 
582 aa  503  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1707  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.37 
 
 
571 aa  502  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  44.6 
 
 
562 aa  504  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3640  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  46.11 
 
 
608 aa  504  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3255  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.02 
 
 
593 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2145  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.82 
 
 
562 aa  502  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000794715  normal  0.0157817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2722  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  43.82 
 
 
592 aa  502  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.817808  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4239  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  47.25 
 
 
620 aa  504  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.302024 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0929  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.72 
 
 
619 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_737  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.72 
 
 
569 aa  504  1e-141  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00716267  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1782  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  44.58 
 
 
572 aa  504  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.331882  normal  0.0862821 
 
 
-
 
NC_002936  DET0833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.21 
 
 
569 aa  501  1e-140  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.469559  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.27 
 
 
565 aa  501  1e-140  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3345  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.67 
 
 
592 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615353  normal  0.0219835 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  45.81 
 
 
620 aa  498  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2098  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.16 
 
 
592 aa  502  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477274  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.95 
 
 
587 aa  499  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2982  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  42.5 
 
 
572 aa  499  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000024883  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10680  acetolactate synthase, large subunit  45.97 
 
 
626 aa  499  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.141846 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3024  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  42.5 
 
 
572 aa  499  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000501065  normal  0.146294 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  44.97 
 
 
584 aa  495  1e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2037  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  44.44 
 
 
564 aa  497  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  43.86 
 
 
570 aa  495  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2158  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  43.32 
 
 
564 aa  497  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2757  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.44 
 
 
632 aa  498  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.928665  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0467  acetolactate synthase, large subunit  43.2 
 
 
586 aa  495  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0875  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  43.88 
 
 
583 aa  496  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.840064  normal  0.16884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13018  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  46.79 
 
 
618 aa  497  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0170383  normal  0.298126 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.02 
 
 
557 aa  498  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2242  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  44.16 
 
 
592 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>