More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3640 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4356  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  70.52 
 
 		 597 aa  869    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0195043  normal  0.165363 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2279  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  67.78 
 
 		 635 aa  832    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000048825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1233  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  73.67 
 
 		 627 aa  904    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506  normal  0.463621 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2864  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  70.76 
 
 		 659 aa  876    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.887934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8059  acetolactate synthase, large subunit  73.17 
 
 		 578 aa  880    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1090  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  89.62 
 
 		 598 aa  1111    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1335  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  72.49 
 
 		 611 aa  881    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.558483  normal  0.552773 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13018  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  68.5 
 
 		 618 aa  852    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0170383  normal  0.298126 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10680  acetolactate synthase, large subunit  67.44 
 
 		 626 aa  842    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.141846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6021  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  71.29 
 
 		 611 aa  872    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.265007  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0611  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  71.48 
 
 		 589 aa  887    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.175913  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1042  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  56.97 
 
 		 649 aa  686    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.531314  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  72.62 
 
 		 620 aa  901    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1123  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  74.5 
 
 		 629 aa  915    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  hitchhiker  0.000150974 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1163  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  68.89 
 
 		 621 aa  830    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3554  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  71.45 
 
 		 581 aa  889    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.743835  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3230  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  70.76 
 
 		 644 aa  873    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08530  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  66.5 
 
 		 633 aa  790    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0564947  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3640  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  100 
 
 		 608 aa  1227    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4073  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  76.07 
 
 		 623 aa  915    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.24876  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18810  acetolactate synthase, large subunit  64.73 
 
 		 585 aa  800    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.740593  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  60.92 
 
 		 569 aa  689    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0171  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  72.07 
 
 		 586 aa  897    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458212  normal  0.847135 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1906  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  69.1 
 
 		 619 aa  847    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365234  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1408  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  68.11 
 
 		 623 aa  821    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.655144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1886  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  69.1 
 
 		 619 aa  847    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0490387  normal  0.105007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4239  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  68.45 
 
 		 620 aa  853    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.302024 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2539  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  67.78 
 
 		 633 aa  838    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0377208  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2386  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  68.61 
 
 		 613 aa  837    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2821  acetolactate synthase large subunit  72.64 
 
 		 581 aa  908    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0706  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  72.8 
 
 		 581 aa  901    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1466  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  72.05 
 
 		 617 aa  877    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0931966  normal  0.0742245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7782  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  74.14 
 
 		 586 aa  921    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.340574 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3392  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  71.8 
 
 		 585 aa  882    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1710  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  66.33 
 
 		 615 aa  824    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.53529 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1952  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  69.1 
 
 		 619 aa  847    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.338885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2122  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  68.33 
 
 		 625 aa  850    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1900  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.37 
 
 		 568 aa  601  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1978  acetolactate synthase, large subunit  52.2 
 
 		 568 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.62 
 
 		 588 aa  595  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.19 
 
 		 582 aa  594  1e-168  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1985  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  52.03 
 
 		 568 aa  594  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  53.34 
 
 		 558 aa  594  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  52.55 
 
 		 557 aa  592  1e-168  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0710  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  50.34 
 
 		 563 aa  589  1e-167  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.76 
 
 		 570 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.77 
 
 		 569 aa  577  1.0000000000000001e-163  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.51 
 
 		 565 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  51.63 
 
 		 558 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.57 
 
 		 555 aa  574  1.0000000000000001e-162  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.75 
 
 		 584 aa  573  1.0000000000000001e-162  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4449  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.32 
 
 		 570 aa  565  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.75 
 
 		 636 aa  565  1e-160  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.8 
 
 		 566 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  50.26 
 
 		 578 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.83 
 
 		 566 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  51.23 
 
 		 612 aa  563  1.0000000000000001e-159  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.93 
 
 		 558 aa  559  1e-158  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.06 
 
 		 559 aa  561  1e-158  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.66 
 
 		 566 aa  560  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  49.74 
 
 		 562 aa  561  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  49.58 
 
 		 623 aa  557  1e-157  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_737  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.74 
 
 		 569 aa  558  1e-157  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00716267  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0752  acetolactate synthase, large subunit  49.23 
 
 		 569 aa  557  1e-157  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.31 
 
 		 566 aa  553  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.8 
 
 		 553 aa  554  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  48.97 
 
 		 577 aa  552  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.57 
 
 		 566 aa  555  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0745  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.88 
 
 		 581 aa  552  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.425404  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1063  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.58 
 
 		 595 aa  555  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.722606  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0892  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.88 
 
 		 581 aa  552  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.806334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.66 
 
 		 552 aa  555  1e-156  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.89 
 
 		 569 aa  548  1e-155  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.469559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  47.64 
 
 		 566 aa  551  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  49.15 
 
 		 567 aa  551  1e-155  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  49.23 
 
 		 563 aa  551  1e-155  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0911  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.67 
 
 		 587 aa  549  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  49.24 
 
 		 587 aa  549  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.03 
 
 		 557 aa  548  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0898  acetolactate synthase, large subunit  47.62 
 
 		 564 aa  551  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.81 
 
 		 562 aa  550  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.32 
 
 		 564 aa  547  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0736  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.25 
 
 		 597 aa  547  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.591869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.19 
 
 		 570 aa  547  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.36 
 
 		 570 aa  547  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0947  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.58 
 
 		 587 aa  548  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.87 
 
 		 557 aa  548  1e-154  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.19 
 
 		 570 aa  547  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  49.83 
 
 		 602 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1557  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.74 
 
 		 581 aa  546  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.19 
 
 		 570 aa  547  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.29 
 
 		 554 aa  548  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.6 
 
 		 555 aa  548  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.19 
 
 		 571 aa  542  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0810  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.55 
 
 		 595 aa  544  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.845021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1968  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  50.41 
 
 		 581 aa  543  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.697399  normal  0.245648 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3112  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.51 
 
 		 601 aa  543  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0197191  normal  0.918751 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2270  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.32 
 
 		 576 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2520  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  46.54 
 
 		 582 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4126  acetolactate synthase large subunit  50.09 
 
 		 638 aa  541  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>