More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1536 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1536  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  100 
 
 
582 aa  1143    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2521  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  56.86 
 
 
547 aa  605  9.999999999999999e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.948829  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4459  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  44.39 
 
 
566 aa  402  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.325037  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.02 
 
 
535 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  32.18 
 
 
578 aa  240  5e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  31.24 
 
 
576 aa  231  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  32.09 
 
 
551 aa  232  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0639  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.64 
 
 
593 aa  230  6e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0915985  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.45 
 
 
557 aa  229  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0025  acetolactate synthase catalytic subunit  30.5 
 
 
562 aa  227  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.65 
 
 
563 aa  224  3e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3813  acetolactate synthase catalytic subunit  30.96 
 
 
554 aa  223  8e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  29.96 
 
 
554 aa  223  8e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  30.27 
 
 
587 aa  223  8e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  29.57 
 
 
552 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2091  acetolactate synthase large subunit  28.39 
 
 
589 aa  221  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.117674  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2128  acetolactate synthase large subunit  28.39 
 
 
589 aa  221  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.67 
 
 
557 aa  220  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  28.6 
 
 
567 aa  220  6e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  29.58 
 
 
587 aa  220  7e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  28.8 
 
 
566 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  30.25 
 
 
623 aa  217  4e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.47 
 
 
567 aa  217  5e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4022  acetolactate synthase catalytic subunit  29.43 
 
 
562 aa  217  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4006  acetolactate synthase catalytic subunit  29.43 
 
 
562 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.277464  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4077  acetolactate synthase catalytic subunit  29.43 
 
 
562 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4127  acetolactate synthase catalytic subunit  29.43 
 
 
562 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4185  acetolactate synthase catalytic subunit  29.43 
 
 
562 aa  216  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.48 
 
 
558 aa  216  7e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  29.03 
 
 
566 aa  216  9.999999999999999e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  28.85 
 
 
587 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.88 
 
 
555 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  29.73 
 
 
587 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5104  acetolactate synthase catalytic subunit  29.59 
 
 
562 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.127246 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1620  acetolactate synthase catalytic subunit  29.56 
 
 
556 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.546066  normal  0.5994 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.73 
 
 
574 aa  213  5.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.71 
 
 
554 aa  213  7e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1175  Acetolactate synthase  30.61 
 
 
591 aa  213  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.112778  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0752  acetolactate synthase, large subunit  27.64 
 
 
569 aa  213  1e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_737  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.82 
 
 
569 aa  213  1e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00716267  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.09 
 
 
552 aa  211  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.82 
 
 
582 aa  211  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2482  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.87 
 
 
561 aa  211  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246138  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.43 
 
 
557 aa  211  3e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  29 
 
 
599 aa  211  3e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0833  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.12 
 
 
569 aa  211  4e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.469559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.05 
 
 
566 aa  211  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.42 
 
 
558 aa  211  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  29.98 
 
 
554 aa  210  5e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2256  acetolactate synthase, large subunit  30 
 
 
560 aa  209  8e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3594  hypothetical protein  31.45 
 
 
541 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234761  normal  0.928094 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.85 
 
 
558 aa  209  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0905  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.67 
 
 
615 aa  207  3e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  27.32 
 
 
542 aa  207  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  28.12 
 
 
562 aa  207  5e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2229  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.2 
 
 
579 aa  206  7e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2937  hypothetical protein  32.45 
 
 
543 aa  206  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4248  acetolactate synthase catalytic subunit  29.2 
 
 
562 aa  206  9e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3884  acetolactate synthase catalytic subunit  29.68 
 
 
562 aa  206  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1905  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  28.44 
 
 
573 aa  206  1e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0620  acetolactate synthase catalytic subunit  29.34 
 
 
554 aa  206  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0028  acetolactate synthase catalytic subunit  29.68 
 
 
562 aa  206  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4038  acetolactate synthase catalytic subunit  29.38 
 
 
562 aa  206  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.725928  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.07 
 
 
559 aa  205  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3236  acetolactate synthase III, large subunit, biosynthetic type  29.08 
 
 
575 aa  205  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00702842  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.77 
 
 
565 aa  205  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4180  acetolactate synthase catalytic subunit  29.2 
 
 
562 aa  205  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2652  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.61 
 
 
586 aa  204  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.77 
 
 
553 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03555  acetolactate synthase large subunit  29.38 
 
 
562 aa  204  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03497  hypothetical protein  29.38 
 
 
562 aa  204  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0032  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.38 
 
 
562 aa  204  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2270  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.77 
 
 
576 aa  204  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0620  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.77 
 
 
560 aa  204  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.635865  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.75 
 
 
587 aa  204  5e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2624  acetolactate synthase catalytic subunit  32.62 
 
 
563 aa  203  6e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  27.74 
 
 
548 aa  203  7e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2503  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.29 
 
 
566 aa  203  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000132944  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.37 
 
 
588 aa  203  9e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0734  acetolactate synthase catalytic subunit  28.97 
 
 
564 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.02 
 
 
612 aa  202  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05821  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.96 
 
 
587 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.449821  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.26 
 
 
554 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1717  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.87 
 
 
566 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.589802  normal  0.264845 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2168  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.03 
 
 
573 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0398  acetolactate synthase catalytic subunit  31.25 
 
 
605 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0609  acetolactate synthase, large subunit  30.35 
 
 
584 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0318526  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.79 
 
 
555 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1839  acetolactate synthase catalytic subunit  28.55 
 
 
555 aa  201  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1642  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.25 
 
 
618 aa  201  3e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132379  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0526  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.18 
 
 
587 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  27.96 
 
 
548 aa  201  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2048  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.67 
 
 
596 aa  201  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1950  acetolactate synthase catalytic subunit  28.55 
 
 
555 aa  201  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2544  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.22 
 
 
588 aa  201  3.9999999999999996e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000348617  hitchhiker  0.0000942961 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05521  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.64 
 
 
587 aa  201  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.78481  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  27.39 
 
 
548 aa  201  5e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.49 
 
 
569 aa  200  6e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  26.76 
 
 
555 aa  200  6e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.32 
 
 
593 aa  200  7e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>