205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5917 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5917  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  100 
 
 
198 aa  391  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0854932  normal  0.161715 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6790  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  71.28 
 
 
198 aa  287  7e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2177  sulfopyruvate decarboxylase  67.69 
 
 
198 aa  273  9e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315174  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6662  putative sulfopyruvate decarboxylase beta subunit  62.43 
 
 
193 aa  210  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.754247 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6125  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  55.43 
 
 
189 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6413  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  54.89 
 
 
189 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.53225 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1052  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  50.27 
 
 
196 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1069  hypothetical protein  34.87 
 
 
199 aa  108  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.319185  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2499  hypothetical protein  36.56 
 
 
202 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3127  hypothetical protein  37.1 
 
 
213 aa  105  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3542  sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha / sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  32.97 
 
 
382 aa  102  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0505956  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2976  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  35.48 
 
 
373 aa  97.1  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1717  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.16 
 
 
185 aa  95.5  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1219  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.63 
 
 
187 aa  95.1  6e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1402  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  34.73 
 
 
184 aa  94.7  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00264057 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2117  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  34.41 
 
 
372 aa  94.4  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1459  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta  38.76 
 
 
189 aa  93.6  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.417982  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0964  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.12 
 
 
185 aa  92.8  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0504  sulfopyruvate decarboxylase subunit beta / sulfopyruvate decarboxylase subunit alpha  36.36 
 
 
371 aa  92.4  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0982  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  31.61 
 
 
185 aa  92  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0238706  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1624  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  35.03 
 
 
187 aa  91.7  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1316  thiamine pyrophosphate enzyme  36.6 
 
 
384 aa  91.3  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0991  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.79 
 
 
188 aa  89.7  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1915  thiamine pyrophosphate enzyme, putative 3-phosphonopyruvate decarboxylase  35.18 
 
 
393 aa  84.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3534  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.67 
 
 
393 aa  84.7  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0803  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  33.93 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2733  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.97 
 
 
370 aa  82.4  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3399  phosphonopyruvate decarboxylase  32.99 
 
 
398 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2234  putative thiamine pyrophosphate enzyme  32.98 
 
 
387 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4472  phosphonopyruvate decarboxylase  32.98 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.110205  normal  0.598116 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4015  phosphonopyruvate decarboxylase  33.33 
 
 
398 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.764027 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1809  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  35.05 
 
 
399 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0361229  normal  0.074249 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4246  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  32.47 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4120  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  32.47 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2064  3-phosphonopyruvate decarboxylase  32.65 
 
 
393 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0779  3-phosphonopyruvate decarboxylase  32.65 
 
 
393 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0690  3-phosphonopyruvate decarboxylase  32.65 
 
 
393 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1769  3-phosphonopyruvate decarboxylase  32.65 
 
 
372 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0759  3-phosphonopyruvate decarboxylase  32.65 
 
 
372 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.762667  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1052  3-phosphonopyruvate decarboxylase  32.65 
 
 
372 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2977  phosphonopyruvate decarboxylase  34.27 
 
 
392 aa  77.4  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5998  phosphonopyruvate decarboxylase  30.35 
 
 
387 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.412851 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0817  phosphonopyruvate decarboxylase  30.77 
 
 
408 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.438085  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1162  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  31.95 
 
 
370 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1414  phosphonopyruvate decarboxylase, putative  28.93 
 
 
378 aa  75.5  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0112  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  33.73 
 
 
373 aa  75.5  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0909  phosphonopyruvate decarboxylase  30.77 
 
 
412 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2172  thiamine pyrophosphate enzyme family protein  30.77 
 
 
721 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.531587  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1909  3-phosphonopyruvate decarboxylase  32.82 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3414  phosphonopyruvate decarboxylase protein  32.47 
 
 
380 aa  72.4  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3821  phosphonopyruvate decarboxylase  34.65 
 
 
394 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.416111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5664  phosphonopyruvate decarboxylase  28.93 
 
 
373 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2070  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  31.29 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0454462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1237  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  31.33 
 
 
223 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0422665  normal  0.190035 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0477  phosphonopyruvate decarboxylase  38.04 
 
 
384 aa  55.1  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0573  phosphonopyruvate decarboxylase  38.04 
 
 
384 aa  54.7  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5427  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  32.17 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1893  thiamine pyrophosphate protein central region  38.78 
 
 
638 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4566  acetolactate synthase  39 
 
 
636 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.958598  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1341  thiamine pyrophosphate protein central region  39.8 
 
 
627 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1302  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.8 
 
 
627 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0283  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  36 
 
 
361 aa  49.7  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0940  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  38.78 
 
 
627 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1422  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.78 
 
 
627 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1400  thiamine pyrophosphate protein central region  38.78 
 
 
627 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3951  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  43.08 
 
 
574 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3284  acetolactate synthase  38.57 
 
 
614 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.787406  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3566  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  35 
 
 
368 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3639  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  35 
 
 
368 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260577  normal  0.765691 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4016  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  38.57 
 
 
614 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3571  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  35 
 
 
368 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0071  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  32.73 
 
 
354 aa  48.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2521  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  29.68 
 
 
547 aa  48.1  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.948829  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1239  putative acetolactate synthase protein  41.43 
 
 
627 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2931  thiamine pyrophosphate protein central region  43.66 
 
 
627 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.224802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3075  thiamine pyrophosphate protein central region  35.29 
 
 
623 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.875201 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0066  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.25 
 
 
627 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.354472  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2314  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  32.26 
 
 
612 aa  47.8  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284269  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2258  acetolactate synthase, large subunit  40.68 
 
 
569 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4034  thiamine pyrophosphate protein central region  31.76 
 
 
541 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.350713  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3964  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  34 
 
 
360 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3561  thiamine pyrophosphate protein central region  32.35 
 
 
622 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.238424 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0143  hypothetical protein  33.05 
 
 
546 aa  46.2  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1417  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  32.12 
 
 
607 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.301106  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2187  thiamine pyrophosphate protein central region  26.63 
 
 
572 aa  46.2  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1240  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.14 
 
 
580 aa  45.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2248  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  37.63 
 
 
571 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0660  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  33 
 
 
348 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0641  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorB  29.25 
 
 
281 aa  45.4  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.81273  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6866  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  30.77 
 
 
345 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.674512  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1393  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorB  29.25 
 
 
281 aa  45.4  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1955  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  33.64 
 
 
342 aa  45.4  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00663827  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1235  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  34.29 
 
 
270 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1167  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  31.43 
 
 
280 aa  45.4  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0562  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorB  29.25 
 
 
281 aa  45.4  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.508312  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6665  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  31.96 
 
 
347 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.166242  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0313  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  33 
 
 
353 aa  45.4  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5695  thiamine pyrophosphate protein central region  30.97 
 
 
621 aa  45.8  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.728148 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0089  2-oxoglutarate ferredoxin oxidoreductase subunit beta  34.69 
 
 
278 aa  45.4  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2810  thiamine pyrophosphate protein central region  41.43 
 
 
657 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595591  normal  0.165764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>