More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2314 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3561  thiamine pyrophosphate protein central region  58.1 
 
 		 622 aa  659    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.238424 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1676  iolD protein  59.42 
 
 		 646 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479049  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0714  TPP-requiring enzyme IolD  65.06 
 
 		 607 aa  760    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83955  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1134  thiamine pyrophosphate protein central region  58.28 
 
 		 616 aa  682    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.474291 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7802  thiamine pyrophosphate protein central region  73.69 
 
 		 612 aa  929    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.821593  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0912  iolD protein  59.27 
 
 		 661 aa  636    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1830  iolD protein  59.42 
 
 		 661 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.301996  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3284  acetolactate synthase  76.27 
 
 		 614 aa  932    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.787406  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0487  putative malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  77.45 
 
 		 610 aa  946    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.853743  normal  0.367436 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3838  thiamine pyrophosphate protein central region  64.89 
 
 		 607 aa  772    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1654  iolD protein  59.42 
 
 		 646 aa  638    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72162  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0670  TPP-requiring enzyme IolD  65.06 
 
 		 607 aa  760    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2314  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  100 
 
 		 612 aa  1248    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284269  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0077  acetolactate synthase  66.17 
 
 		 607 aa  808    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1675  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  74.67 
 
 		 609 aa  917    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0725  iolD protein  59.27 
 
 		 646 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.165076  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0981  thiamine pyrophosphate protein central region  57.95 
 
 		 616 aa  678    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1443  iolD protein  59.27 
 
 		 646 aa  637    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1601  thiamine pyrophosphate protein central region  56.09 
 
 		 649 aa  640    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0437  iolD protein  59.27 
 
 		 646 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4016  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  76.76 
 
 		 614 aa  936    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2648  iolD protein  58.47 
 
 		 667 aa  630  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190604  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1325  putative myo-inositol catabolism LolD protein  54.84 
 
 		 659 aa  630  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1595  thiamine pyrophosphate protein central region  52.37 
 
 		 620 aa  617  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1239  putative acetolactate synthase protein  53.18 
 
 		 627 aa  609  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1341  thiamine pyrophosphate protein central region  54.36 
 
 		 627 aa  611  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2810  thiamine pyrophosphate protein central region  54.57 
 
 		 657 aa  609  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595591  normal  0.165764 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1400  thiamine pyrophosphate protein central region  54.83 
 
 		 627 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3315  thiamine pyrophosphate protein central region  53.06 
 
 		 618 aa  601  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4566  acetolactate synthase  54.36 
 
 		 636 aa  600  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.958598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0940  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  55.67 
 
 		 627 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1302  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  54.04 
 
 		 627 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1422  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  55.67 
 
 		 627 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1893  thiamine pyrophosphate protein central region  55.47 
 
 		 638 aa  596  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2931  thiamine pyrophosphate protein central region  51.75 
 
 		 627 aa  580  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224802 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0066  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  52.14 
 
 		 627 aa  576  1.0000000000000001e-163  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.354472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1718  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  48.08 
 
 		 626 aa  548  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1695  thiamine pyrophosphate protein central region  47.85 
 
 		 624 aa  536  1e-151  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4491  thiamine pyrophosphate protein central region  49.04 
 
 		 637 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0431429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1524  thiamine pyrophosphate protein central region  45.34 
 
 		 623 aa  513  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3608  thiamine pyrophosphate protein central region  45.9 
 
 		 669 aa  514  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.908775  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2745  thiamine pyrophosphate protein central region  45.22 
 
 		 649 aa  509  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2834  thiamine pyrophosphate protein central region  46.23 
 
 		 613 aa  508  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1800  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  46.66 
 
 		 626 aa  511  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2599  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  45.32 
 
 		 649 aa  509  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443683  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2335  iolD protein  42.16 
 
 		 644 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.646914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2298  malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  42.16 
 
 		 644 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2254  myo-inositol catabolism protein, malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  42.36 
 
 		 644 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2530  putative iolD protein  42.16 
 
 		 644 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612889 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2514  acetolactate synthase IolD  42.16 
 
 		 644 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.868451  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5566  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  47.68 
 
 		 612 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0302  myo-inositol catabolism protein  42.77 
 
 		 644 aa  505  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0659  thiamine pyrophosphate protein central region  47.59 
 
 		 623 aa  504  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3075  thiamine pyrophosphate protein central region  49.35 
 
 		 623 aa  501  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.875201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5695  thiamine pyrophosphate protein central region  42.93 
 
 		 621 aa  496  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.728148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3495  iolD protein  43.08 
 
 		 645 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154384  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1420  thiamine pyrophosphate enzyme protein  47.59 
 
 		 623 aa  490  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.406796  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3348  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  46.38 
 
 		 622 aa  489  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0194169  normal  0.142166 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0084  myo-inositol catabolism protein IolD  40.82 
 
 		 639 aa  489  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3269  pyruvate decarboxylase:pyruvate decarboxylase  43.3 
 
 		 645 aa  488  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149274  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4019  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  45.66 
 
 		 649 aa  485  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14756 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0728  thiamine pyrophosphate protein central region  44.86 
 
 		 645 aa  482  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50100  myo-inositol catabolism protein IolD  44.7 
 
 		 645 aa  485  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443282  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4539  thiamine pyrophosphate protein central region  43.61 
 
 		 637 aa  481  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.366125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3121  thiamine pyrophosphate protein central region  45.54 
 
 		 652 aa  481  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1335  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  44.52 
 
 		 643 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1578  myo-inositol catabolism protein  43.44 
 
 		 645 aa  476  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.505237  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5446  thiamine pyrophosphate protein central region  44.94 
 
 		 664 aa  478  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3002  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  45.06 
 
 		 643 aa  476  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4714  probable malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  44.29 
 
 		 646 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163823  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1621  hypothetical protein  42.18 
 
 		 623 aa  474  1e-132  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1616  hypothetical protein  42.3 
 
 		 623 aa  474  1e-132  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0939  thiamine pyrophosphate protein central region  41.78 
 
 		 660 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3048  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  45.3 
 
 		 648 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2976  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme  45.14 
 
 		 648 aa  467  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4015  thiamine pyrophosphate protein central region  41.75 
 
 		 638 aa  468  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6846  thiamine pyrophosphate protein central region  47.83 
 
 		 616 aa  467  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1876  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme  45.14 
 
 		 648 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662616 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0822  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.15 
 
 		 654 aa  462  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837061  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4056  thiamine pyrophosphate protein central region  42.48 
 
 		 643 aa  460  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  58.31 
 
 		 924 aa  461  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1269  thiamine pyrophosphate protein central region  45.83 
 
 		 621 aa  456  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3342  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  44.98 
 
 		 643 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.621165  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4659  thiamine pyrophosphate protein central region  43.7 
 
 		 646 aa  448  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1369  thiamine pyrophosphate protein central region  41.8 
 
 		 644 aa  443  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0138  thiamine pyrophosphate protein central region  40.86 
 
 		 653 aa  438  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4209  thiamine pyrophosphate protein central region  39.9 
 
 		 624 aa  376  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.423105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1092  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.69 
 
 		 600 aa  209  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  30.89 
 
 		 587 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27 
 
 		 561 aa  196  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1519  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  30.14 
 
 		 595 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6310  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.14 
 
 		 595 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.683934  normal  0.626612 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6968  thiamine pyrophosphate protein central region  29.79 
 
 		 595 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  29.35 
 
 		 576 aa  183  7e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  28.36 
 
 		 578 aa  176  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.39 
 
 		 557 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01970  acetolactate synthase, large subunit  28.17 
 
 		 622 aa  175  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00241919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0639  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.1 
 
 		 593 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0915985  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.91 
 
 		 555 aa  174  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2706  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.86 
 
 		 573 aa  173  7.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>