More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3348 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2834  thiamine pyrophosphate protein central region  52.84 
 
 		 613 aa  642    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1420  thiamine pyrophosphate enzyme protein  75.12 
 
 		 623 aa  944    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.406796  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3348  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  100 
 
 		 622 aa  1291    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0194169  normal  0.142166 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1269  thiamine pyrophosphate protein central region  76.45 
 
 		 621 aa  938    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1595  thiamine pyrophosphate protein central region  48.64 
 
 		 620 aa  568  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0981  thiamine pyrophosphate protein central region  47.65 
 
 		 616 aa  549  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1134  thiamine pyrophosphate protein central region  47.66 
 
 		 616 aa  547  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.474291 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3561  thiamine pyrophosphate protein central region  47.76 
 
 		 622 aa  543  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.238424 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1325  putative myo-inositol catabolism LolD protein  48.55 
 
 		 659 aa  541  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1601  thiamine pyrophosphate protein central region  48.72 
 
 		 649 aa  536  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3838  thiamine pyrophosphate protein central region  47.56 
 
 		 607 aa  536  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0077  acetolactate synthase  45.5 
 
 		 607 aa  528  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0912  iolD protein  49.11 
 
 		 661 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1830  iolD protein  49.11 
 
 		 661 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.301996  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1443  iolD protein  49.11 
 
 		 646 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0437  iolD protein  49.11 
 
 		 646 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1654  iolD protein  48.95 
 
 		 646 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72162  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1676  iolD protein  49.11 
 
 		 646 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479049  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0725  iolD protein  49.11 
 
 		 646 aa  524  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.165076  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2810  thiamine pyrophosphate protein central region  48.23 
 
 		 657 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595591  normal  0.165764 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1239  putative acetolactate synthase protein  45.8 
 
 		 627 aa  519  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0714  TPP-requiring enzyme IolD  47.4 
 
 		 607 aa  520  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83955  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0670  TPP-requiring enzyme IolD  47.4 
 
 		 607 aa  520  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3315  thiamine pyrophosphate protein central region  46.47 
 
 		 618 aa  518  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2648  iolD protein  48.64 
 
 		 667 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190604  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1341  thiamine pyrophosphate protein central region  46.03 
 
 		 627 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1400  thiamine pyrophosphate protein central region  46.35 
 
 		 627 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6846  thiamine pyrophosphate protein central region  47.99 
 
 		 616 aa  509  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1302  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  46.36 
 
 		 627 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4566  acetolactate synthase  46.35 
 
 		 636 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.958598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1524  thiamine pyrophosphate protein central region  44.14 
 
 		 623 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0940  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  46.19 
 
 		 627 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1422  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  46.19 
 
 		 627 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1675  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  45.66 
 
 		 609 aa  500  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2931  thiamine pyrophosphate protein central region  44.87 
 
 		 627 aa  497  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224802 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0066  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  44.06 
 
 		 627 aa  496  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.354472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7802  thiamine pyrophosphate protein central region  44.43 
 
 		 612 aa  496  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.821593  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2314  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  46.38 
 
 		 612 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284269  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1893  thiamine pyrophosphate protein central region  45.87 
 
 		 638 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4016  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  45.03 
 
 		 614 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3284  acetolactate synthase  44.71 
 
 		 614 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.787406  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0487  putative malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  45.32 
 
 		 610 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.853743  normal  0.367436 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2335  iolD protein  39.22 
 
 		 644 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.646914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2298  malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  39.16 
 
 		 644 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0302  myo-inositol catabolism protein  39.94 
 
 		 644 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2514  acetolactate synthase IolD  39.22 
 
 		 644 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.868451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2254  myo-inositol catabolism protein, malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  39.66 
 
 		 644 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2530  putative iolD protein  39.01 
 
 		 644 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612889 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1718  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  40.42 
 
 		 626 aa  464  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1621  hypothetical protein  40.69 
 
 		 623 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1616  hypothetical protein  40.36 
 
 		 623 aa  454  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2599  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  40.35 
 
 		 649 aa  450  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443683  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3495  iolD protein  39.81 
 
 		 645 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154384  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1695  thiamine pyrophosphate protein central region  41.05 
 
 		 624 aa  447  1.0000000000000001e-124  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1800  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.73 
 
 		 626 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5695  thiamine pyrophosphate protein central region  39.74 
 
 		 621 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.728148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3075  thiamine pyrophosphate protein central region  42.2 
 
 		 623 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.875201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3608  thiamine pyrophosphate protein central region  39.72 
 
 		 669 aa  439  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.908775  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4491  thiamine pyrophosphate protein central region  41.92 
 
 		 637 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0431429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3269  pyruvate decarboxylase:pyruvate decarboxylase  39.14 
 
 		 645 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149274  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0659  thiamine pyrophosphate protein central region  40.89 
 
 		 623 aa  434  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1335  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  39.6 
 
 		 643 aa  433  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4714  probable malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  39.02 
 
 		 646 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163823  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5566  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.16 
 
 		 612 aa  432  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0084  myo-inositol catabolism protein IolD  37.73 
 
 		 639 aa  429  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1578  myo-inositol catabolism protein  39.66 
 
 		 645 aa  426  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.505237  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50100  myo-inositol catabolism protein IolD  39.57 
 
 		 645 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443282  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0728  thiamine pyrophosphate protein central region  40.12 
 
 		 645 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4019  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.31 
 
 		 649 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4539  thiamine pyrophosphate protein central region  39.65 
 
 		 637 aa  424  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.366125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4015  thiamine pyrophosphate protein central region  37.31 
 
 		 638 aa  423  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3002  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  38.67 
 
 		 643 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2976  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme  39.49 
 
 		 648 aa  412  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3048  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.49 
 
 		 648 aa  413  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3121  thiamine pyrophosphate protein central region  40.63 
 
 		 652 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1876  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme  39.34 
 
 		 648 aa  411  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662616 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3342  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  40.12 
 
 		 643 aa  410  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.621165  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2745  thiamine pyrophosphate protein central region  37.72 
 
 		 649 aa  411  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4659  thiamine pyrophosphate protein central region  38.78 
 
 		 646 aa  411  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0138  thiamine pyrophosphate protein central region  38.76 
 
 		 653 aa  403  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4056  thiamine pyrophosphate protein central region  38.33 
 
 		 643 aa  405  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5446  thiamine pyrophosphate protein central region  37.44 
 
 		 664 aa  399  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1369  thiamine pyrophosphate protein central region  39.16 
 
 		 644 aa  395  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0939  thiamine pyrophosphate protein central region  38.41 
 
 		 660 aa  389  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  46.93 
 
 		 924 aa  378  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0822  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.49 
 
 		 654 aa  376  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837061  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4209  thiamine pyrophosphate protein central region  37.24 
 
 		 624 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.423105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3437  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.14 
 
 		 542 aa  179  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00701573  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  28.32 
 
 		 578 aa  173  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.55 
 
 		 636 aa  172  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.76 
 
 		 557 aa  172  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  25.59 
 
 		 566 aa  171  4e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  28.67 
 
 		 576 aa  171  4e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  26.92 
 
 		 599 aa  167  5e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.97 
 
 		 566 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  27.77 
 
 		 587 aa  163  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.66 
 
 		 581 aa  162  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.83 
 
 		 581 aa  161  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4356  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  25.43 
 
 		 597 aa  159  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0195043  normal  0.165363 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01970  acetolactate synthase, large subunit  27.05 
 
 		 622 aa  157  5.0000000000000005e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00241919  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>