More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6846 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6846  thiamine pyrophosphate protein central region  100 
 
 		 616 aa  1213    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2834  thiamine pyrophosphate protein central region  51.63 
 
 		 613 aa  626  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0912  iolD protein  51.45 
 
 		 661 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1830  iolD protein  51.45 
 
 		 661 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.301996  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1443  iolD protein  51.45 
 
 		 646 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0725  iolD protein  51.45 
 
 		 646 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.165076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0437  iolD protein  51.45 
 
 		 646 aa  527  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1654  iolD protein  51.45 
 
 		 646 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72162  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1676  iolD protein  51.45 
 
 		 646 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479049  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1595  thiamine pyrophosphate protein central region  47.81 
 
 		 620 aa  522  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3348  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  47.99 
 
 		 622 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0194169  normal  0.142166 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2648  iolD protein  50.91 
 
 		 667 aa  514  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190604  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1134  thiamine pyrophosphate protein central region  46.39 
 
 		 616 aa  514  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.474291 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0981  thiamine pyrophosphate protein central region  45.38 
 
 		 616 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3838  thiamine pyrophosphate protein central region  46.73 
 
 		 607 aa  502  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0077  acetolactate synthase  45.62 
 
 		 607 aa  498  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1325  putative myo-inositol catabolism LolD protein  48.84 
 
 		 659 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1601  thiamine pyrophosphate protein central region  48.76 
 
 		 649 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392192  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1239  putative acetolactate synthase protein  46.42 
 
 		 627 aa  496  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3561  thiamine pyrophosphate protein central region  46.94 
 
 		 622 aa  497  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.238424 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3315  thiamine pyrophosphate protein central region  47.4 
 
 		 618 aa  493  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1420  thiamine pyrophosphate enzyme protein  46.54 
 
 		 623 aa  494  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.406796  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2810  thiamine pyrophosphate protein central region  49.75 
 
 		 657 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595591  normal  0.165764 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4016  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  47.97 
 
 		 614 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7802  thiamine pyrophosphate protein central region  46.81 
 
 		 612 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.821593  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3284  acetolactate synthase  47.65 
 
 		 614 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.787406  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1269  thiamine pyrophosphate protein central region  48.12 
 
 		 621 aa  482  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1341  thiamine pyrophosphate protein central region  47.11 
 
 		 627 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0714  TPP-requiring enzyme IolD  46.18 
 
 		 607 aa  481  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83955  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0670  TPP-requiring enzyme IolD  46.02 
 
 		 607 aa  480  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4566  acetolactate synthase  46.66 
 
 		 636 aa  472  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.958598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0487  putative malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  46.61 
 
 		 610 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.853743  normal  0.367436 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2314  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  47.83 
 
 		 612 aa  473  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284269  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1675  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  46.1 
 
 		 609 aa  472  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0940  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  46.66 
 
 		 627 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1400  thiamine pyrophosphate protein central region  46.66 
 
 		 627 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1422  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  46.66 
 
 		 627 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0066  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  45.86 
 
 		 627 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.354472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2931  thiamine pyrophosphate protein central region  45.95 
 
 		 627 aa  466  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224802 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1302  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  47.27 
 
 		 627 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1893  thiamine pyrophosphate protein central region  46.34 
 
 		 638 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1524  thiamine pyrophosphate protein central region  42.47 
 
 		 623 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0302  myo-inositol catabolism protein  38.94 
 
 		 644 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2254  myo-inositol catabolism protein, malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  39.1 
 
 		 644 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2335  iolD protein  38.62 
 
 		 644 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.646914  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2530  putative iolD protein  38.62 
 
 		 644 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612889 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2514  acetolactate synthase IolD  38.62 
 
 		 644 aa  430  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.868451  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1718  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  42.58 
 
 		 626 aa  431  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5566  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  44.41 
 
 		 612 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2298  malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  38.62 
 
 		 644 aa  428  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3075  thiamine pyrophosphate protein central region  46.57 
 
 		 623 aa  427  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.875201 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1695  thiamine pyrophosphate protein central region  42.81 
 
 		 624 aa  424  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3495  iolD protein  40.13 
 
 		 645 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154384  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3269  pyruvate decarboxylase:pyruvate decarboxylase  40.48 
 
 		 645 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149274  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0084  myo-inositol catabolism protein IolD  36.49 
 
 		 639 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1616  hypothetical protein  38.91 
 
 		 623 aa  411  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5695  thiamine pyrophosphate protein central region  41.6 
 
 		 621 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.728148 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1335  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  41.32 
 
 		 643 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1621  hypothetical protein  38.28 
 
 		 623 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4714  probable malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  40.38 
 
 		 646 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163823  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50100  myo-inositol catabolism protein IolD  41.89 
 
 		 645 aa  408  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4491  thiamine pyrophosphate protein central region  44.27 
 
 		 637 aa  409  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0431429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3342  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  43.73 
 
 		 643 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.621165  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1578  myo-inositol catabolism protein  39.1 
 
 		 645 aa  405  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.505237  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2599  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  42.01 
 
 		 649 aa  403  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2976  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme  42.12 
 
 		 648 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0659  thiamine pyrophosphate protein central region  43.45 
 
 		 623 aa  402  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3002  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  40.61 
 
 		 643 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3048  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  42.54 
 
 		 648 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1876  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme  42.12 
 
 		 648 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662616 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2745  thiamine pyrophosphate protein central region  42.67 
 
 		 649 aa  400  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4015  thiamine pyrophosphate protein central region  37.44 
 
 		 638 aa  398  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3608  thiamine pyrophosphate protein central region  41.07 
 
 		 669 aa  395  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.908775  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  51.76 
 
 		 924 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1800  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.96 
 
 		 626 aa  387  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3121  thiamine pyrophosphate protein central region  43.49 
 
 		 652 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4019  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  41.54 
 
 		 649 aa  382  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4659  thiamine pyrophosphate protein central region  40.29 
 
 		 646 aa  376  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0138  thiamine pyrophosphate protein central region  39.46 
 
 		 653 aa  379  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0728  thiamine pyrophosphate protein central region  42.51 
 
 		 645 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5446  thiamine pyrophosphate protein central region  41.61 
 
 		 664 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4056  thiamine pyrophosphate protein central region  39.87 
 
 		 643 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0939  thiamine pyrophosphate protein central region  37.75 
 
 		 660 aa  364  3e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4539  thiamine pyrophosphate protein central region  41.19 
 
 		 637 aa  363  7.0000000000000005e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.366125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0822  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  38.89 
 
 		 654 aa  359  7e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837061  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1369  thiamine pyrophosphate protein central region  40.68 
 
 		 644 aa  357  3.9999999999999996e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4209  thiamine pyrophosphate protein central region  39.44 
 
 		 624 aa  326  9e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.423105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1921  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.72 
 
 		 576 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.299558 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.29 
 
 		 564 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  27.53 
 
 		 588 aa  148  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  32.03 
 
 		 576 aa  146  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.62 
 
 		 555 aa  144  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.6 
 
 		 572 aa  143  7e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1620  acetolactate synthase catalytic subunit  27.83 
 
 		 556 aa  143  9e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.546066  normal  0.5994 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1850  acetolactate synthase catalytic subunit  27.16 
 
 		 566 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.96 
 
 		 556 aa  141  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  28 
 
 		 572 aa  140  4.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0498  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.95 
 
 		 566 aa  140  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3624  acetolactate synthase catalytic subunit  27.59 
 
 		 554 aa  140  7.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.77 
 
 		 586 aa  140  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>