More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2648 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1239  putative acetolactate synthase protein  61.54 
 
 
627 aa  726    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1893  thiamine pyrophosphate protein central region  63.08 
 
 
638 aa  700    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0714  TPP-requiring enzyme IolD  59.07 
 
 
607 aa  695    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.83955  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0725  iolD protein  93.4 
 
 
646 aa  1170    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.165076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0912  iolD protein  93.4 
 
 
661 aa  1199    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2810  thiamine pyrophosphate protein central region  78.11 
 
 
657 aa  973    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595591  normal  0.165764 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0077  acetolactate synthase  56.82 
 
 
607 aa  683    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1830  iolD protein  93.55 
 
 
661 aa  1201    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.301996  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3284  acetolactate synthase  57.49 
 
 
614 aa  649    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.787406  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7802  thiamine pyrophosphate protein central region  56.82 
 
 
612 aa  660    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.821593  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4566  acetolactate synthase  62.38 
 
 
636 aa  712    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.958598  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3561  thiamine pyrophosphate protein central region  60 
 
 
622 aa  677    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.238424 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2648  iolD protein  100 
 
 
667 aa  1335    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.190604  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1341  thiamine pyrophosphate protein central region  63.34 
 
 
627 aa  727    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1676  iolD protein  93.56 
 
 
646 aa  1171    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479049  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1325  putative myo-inositol catabolism LolD protein  78.43 
 
 
659 aa  991    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0940  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  63.18 
 
 
627 aa  713    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172702  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1595  thiamine pyrophosphate protein central region  57.84 
 
 
620 aa  687    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1601  thiamine pyrophosphate protein central region  78.47 
 
 
649 aa  994    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392192  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0670  TPP-requiring enzyme IolD  59.07 
 
 
607 aa  695    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3838  thiamine pyrophosphate protein central region  59.23 
 
 
607 aa  702    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1302  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  63.18 
 
 
627 aa  712    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1400  thiamine pyrophosphate protein central region  62.7 
 
 
627 aa  711    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1422  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  63.18 
 
 
627 aa  713    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3315  thiamine pyrophosphate protein central region  62.28 
 
 
618 aa  719    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1654  iolD protein  93.4 
 
 
646 aa  1170    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72162  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0981  thiamine pyrophosphate protein central region  59.55 
 
 
616 aa  690    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1443  iolD protein  93.4 
 
 
646 aa  1170    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0066  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  60.74 
 
 
627 aa  696    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.354472  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4016  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  57.49 
 
 
614 aa  647    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1134  thiamine pyrophosphate protein central region  59.71 
 
 
616 aa  693    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.474291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2931  thiamine pyrophosphate protein central region  62.06 
 
 
627 aa  714    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.224802 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0437  iolD protein  93.4 
 
 
646 aa  1170    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2314  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  58.41 
 
 
612 aa  627  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.284269  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1675  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  56.36 
 
 
609 aa  625  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0487  putative malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  57.36 
 
 
610 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.853743  normal  0.367436 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1718  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  51.19 
 
 
626 aa  571  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2834  thiamine pyrophosphate protein central region  50.25 
 
 
613 aa  561  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2745  thiamine pyrophosphate protein central region  48.55 
 
 
649 aa  557  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5566  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  51.36 
 
 
612 aa  549  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1524  thiamine pyrophosphate protein central region  49.44 
 
 
623 aa  546  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1800  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  50.08 
 
 
626 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.749934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3075  thiamine pyrophosphate protein central region  51.44 
 
 
623 aa  534  1e-150  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.875201 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1695  thiamine pyrophosphate protein central region  49.21 
 
 
624 aa  527  1e-148  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0659  thiamine pyrophosphate protein central region  50.32 
 
 
623 aa  526  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101601  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3608  thiamine pyrophosphate protein central region  46.23 
 
 
669 aa  519  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.908775  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3348  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  48.8 
 
 
622 aa  512  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0194169  normal  0.142166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4491  thiamine pyrophosphate protein central region  50.86 
 
 
637 aa  511  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0431429  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5695  thiamine pyrophosphate protein central region  45.35 
 
 
621 aa  509  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.728148 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1269  thiamine pyrophosphate protein central region  50.88 
 
 
621 aa  506  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.710125 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2599  thiamine pyrophosphate enzyme, central region  45.67 
 
 
649 aa  505  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.443683  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1420  thiamine pyrophosphate enzyme protein  50.16 
 
 
623 aa  503  1e-141  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.406796  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6846  thiamine pyrophosphate protein central region  51.23 
 
 
616 aa  500  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2335  iolD protein  43.12 
 
 
644 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.646914  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4539  thiamine pyrophosphate protein central region  46.85 
 
 
637 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.366125  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2514  acetolactate synthase IolD  43.12 
 
 
644 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.868451  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2530  putative iolD protein  43.12 
 
 
644 aa  497  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612889 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3495  iolD protein  45.54 
 
 
645 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0154384  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2298  malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  43.12 
 
 
644 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3269  pyruvate decarboxylase:pyruvate decarboxylase  45.83 
 
 
645 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149274  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0302  myo-inositol catabolism protein  42.97 
 
 
644 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0084  myo-inositol catabolism protein IolD  42.17 
 
 
639 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2254  myo-inositol catabolism protein, malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  42.81 
 
 
644 aa  491  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3121  thiamine pyrophosphate protein central region  46.86 
 
 
652 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1335  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  44.53 
 
 
643 aa  483  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4056  thiamine pyrophosphate protein central region  45.73 
 
 
643 aa  483  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4019  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  46.06 
 
 
649 aa  484  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.14756 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1616  hypothetical protein  41.84 
 
 
623 aa  479  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0728  thiamine pyrophosphate protein central region  45.33 
 
 
645 aa  480  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.244688  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1621  hypothetical protein  41.47 
 
 
623 aa  478  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0822  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  45.23 
 
 
654 aa  478  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.837061  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3002  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  44.43 
 
 
643 aa  473  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1369  thiamine pyrophosphate protein central region  46.79 
 
 
644 aa  474  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0939  thiamine pyrophosphate protein central region  43.82 
 
 
660 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50100  myo-inositol catabolism protein IolD  45.97 
 
 
645 aa  471  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443282  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4714  probable malonic semialdehyde oxidative decarboxylase  43.1 
 
 
646 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163823  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3048  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  46.18 
 
 
648 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1876  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme  46.18 
 
 
648 aa  462  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00662616 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2976  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme  46.18 
 
 
648 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1578  myo-inositol catabolism protein  42.44 
 
 
645 aa  460  9.999999999999999e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.505237  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4015  thiamine pyrophosphate protein central region  40.47 
 
 
638 aa  456  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3342  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  44.58 
 
 
643 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.621165  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2414  Xylose isomerase domain protein TIM barrel  58.24 
 
 
924 aa  451  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4659  thiamine pyrophosphate protein central region  44.11 
 
 
646 aa  442  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5446  thiamine pyrophosphate protein central region  41.75 
 
 
664 aa  423  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432939  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0138  thiamine pyrophosphate protein central region  38.78 
 
 
653 aa  408  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4209  thiamine pyrophosphate protein central region  40.51 
 
 
624 aa  375  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.423105  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8567  thiamine pyrophosphate protein central region  29.73 
 
 
596 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.450993  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3347  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.95 
 
 
561 aa  171  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18132  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1092  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.3 
 
 
600 aa  167  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1642  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  29.11 
 
 
618 aa  164  5.0000000000000005e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132379  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  28.25 
 
 
587 aa  162  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6968  thiamine pyrophosphate protein central region  29.71 
 
 
595 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1519  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  29.71 
 
 
595 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6310  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.71 
 
 
595 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.683934  normal  0.626612 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3455  glyoxylate carboligase  28.92 
 
 
577 aa  159  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.152002 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.47 
 
 
581 aa  159  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.34 
 
 
593 aa  158  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.3 
 
 
581 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  28.39 
 
 
588 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>